RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.03■■■□□ 2.08
HERC2-208ENST00000566635 ARAP1Q96P48 1450 aa28.02■■■□□ 2.08
HERC2-208ENST00000566635 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
HERC2-208ENST00000566635 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.94■■■□□ 2.06
HERC2-208ENST00000566635 FBLN2P98095 1184 aa27.93■■■□□ 2.06
HERC2-208ENST00000566635 IQGAP2Q13576 1575 aa27.93■■■□□ 2.06
HERC2-208ENST00000566635 CEP170Q5SW79 1584 aa27.92■■■□□ 2.06
HERC2-208ENST00000566635 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.9■■■□□ 2.06
HERC2-208ENST00000566635 CHD1O14646 1710 aa27.89■■■□□ 2.06
HERC2-208ENST00000566635 SAMD9Q5K651 1589 aa27.87■■■□□ 2.05
HERC2-208ENST00000566635 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.85■■■□□ 2.05
HERC2-208ENST00000566635 NUP160Q12769 1436 aa27.84■■■□□ 2.05
HERC2-208ENST00000566635 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.82■■■□□ 2.04
HERC2-208ENST00000566635 P3H3Q8IVL6 736 aa27.82■■■□□ 2.04
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HERC2-208ENST00000566635 KIAA0556O60303 1618 aa27.67■■■□□ 2.02
HERC2-208ENST00000566635 DISP1Q96F81 1524 aa27.66■■■□□ 2.02
HERC2-208ENST00000566635 FMN1Q68DA7 1419 aa27.61■■■□□ 2.01
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HERC2-208ENST00000566635 MAP3K1Q13233 1512 aa27.44■■□□□ 1.98
HERC2-208ENST00000566635 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HERC2-208ENST00000566635 HECW1Q76N89 1606 aa27.41■■□□□ 1.98
HERC2-208ENST00000566635 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.39■■□□□ 1.98
HERC2-208ENST00000566635 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.37■■□□□ 1.97
HERC2-208ENST00000566635 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.35■■□□□ 1.97
HERC2-208ENST00000566635 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.32■■□□□ 1.96
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HERC2-208ENST00000566635 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HERC2-208ENST00000566635 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
HERC2-208ENST00000566635 ABCA8O94911 1581 aa27.26■■□□□ 1.95
HERC2-208ENST00000566635 ARID3CA6NKF2 412 aa27.25■■□□□ 1.95
HERC2-208ENST00000566635 OSCARQ8IYS5 282 aa27.24■■□□□ 1.95
HERC2-208ENST00000566635 PTPRGP23470 1445 aa27.24■■□□□ 1.95
HERC2-208ENST00000566635 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.21■■□□□ 1.95
HERC2-208ENST00000566635 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.17■■□□□ 1.94
HERC2-208ENST00000566635 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.17■■□□□ 1.94
HERC2-208ENST00000566635 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.1■■□□□ 1.93
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HERC2-208ENST00000566635 NCOA2Q15596 1464 aa27.05■■□□□ 1.92
HERC2-208ENST00000566635 ARHGEF11O15085 1522 aa27.01■■□□□ 1.91
HERC2-208ENST00000566635 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.98■■□□□ 1.91
HERC2-208ENST00000566635 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
HERC2-208ENST00000566635 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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HERC2-208ENST00000566635 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.93■■□□□ 1.9
HERC2-208ENST00000566635 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HERC2-208ENST00000566635 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.91■■□□□ 1.9
HERC2-208ENST00000566635 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.91■■□□□ 1.9
HERC2-208ENST00000566635 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.87■■□□□ 1.89
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.85■■□□□ 1.89
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HERC2-208ENST00000566635 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.8■■□□□ 1.88
HERC2-208ENST00000566635 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.8■■□□□ 1.88
HERC2-208ENST00000566635 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.8■■□□□ 1.88
HERC2-208ENST00000566635 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.77■■□□□ 1.88
HERC2-208ENST00000566635 ITGAEP38570 1179 aa26.77■■□□□ 1.88
HERC2-208ENST00000566635 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.76■■□□□ 1.87
HERC2-208ENST00000566635 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
HERC2-208ENST00000566635 MIA2Q96PC5 1412 aa26.74■■□□□ 1.87
HERC2-208ENST00000566635 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
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HERC2-208ENST00000566635 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HERC2-208ENST00000566635 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.69■■□□□ 1.86
HERC2-208ENST00000566635 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
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HERC2-208ENST00000566635 KCNH8Q96L42 1107 aa26.62■■□□□ 1.85
HERC2-208ENST00000566635 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.61■■□□□ 1.85
HERC2-208ENST00000566635 PTPRKQ15262 1439 aa26.61■■□□□ 1.85
HERC2-208ENST00000566635 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
HERC2-208ENST00000566635 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
HERC2-208ENST00000566635 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.61■■□□□ 1.85
HERC2-208ENST00000566635 ASXL2Q76L83 1435 aa26.6■■□□□ 1.85
HERC2-208ENST00000566635 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.59■■□□□ 1.85
HERC2-208ENST00000566635 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.59■■□□□ 1.85
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