RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 KIF27Q86VH2 1401 aa36.99■■■■□ 3.51
STX4-216ENST00000566353 IGF1RP08069 1367 aa36.95■■■■□ 3.51
STX4-216ENST00000566353 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.93■■■■□ 3.5
STX4-216ENST00000566353 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.89■■■■□ 3.5
STX4-216ENST00000566353 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.8■■■■□ 3.48
STX4-216ENST00000566353 MAPKBP1O60336 1514 aa36.75■■■■□ 3.47
STX4-216ENST00000566353 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.71■■■■□ 3.47
STX4-216ENST00000566353 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.69■■■■□ 3.46
STX4-216ENST00000566353 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
STX4-216ENST00000566353 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
STX4-216ENST00000566353 DIP2BQ9P265 1576 aa36.66■■■■□ 3.46
STX4-216ENST00000566353 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.6■■■■□ 3.45
STX4-216ENST00000566353 IQGAP2Q13576 1575 aa36.57■■■■□ 3.45
STX4-216ENST00000566353 PTPRGP23470 1445 aa36.53■■■■□ 3.44
STX4-216ENST00000566353 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.52■■■■□ 3.44
STX4-216ENST00000566353 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.49■■■■□ 3.43
STX4-216ENST00000566353 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
STX4-216ENST00000566353 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.41■■■■□ 3.42
STX4-216ENST00000566353 ABCC2Q92887 1545 aa36.4■■■■□ 3.42
STX4-216ENST00000566353 TSPOAP1O95153 1857 aa36.39■■■■□ 3.42
STX4-216ENST00000566353 DISP1Q96F81 1524 aa36.39■■■■□ 3.42
STX4-216ENST00000566353 KDM6BO15054 1643 aa36.35■■■■□ 3.41
STX4-216ENST00000566353 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.33■■■■□ 3.41
STX4-216ENST00000566353 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.32■■■■□ 3.41
STX4-216ENST00000566353 UACAQ9BZF9 1416 aa36.28■■■■□ 3.4
STX4-216ENST00000566353 KIAA0556O60303 1618 aa36.26■■■■□ 3.4
STX4-216ENST00000566353 ASXL2Q76L83 1435 aa36.26■■■■□ 3.4
STX4-216ENST00000566353 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.24■■■■□ 3.39
STX4-216ENST00000566353 GLI2P10070 1586 aa36.22■■■■□ 3.39
STX4-216ENST00000566353 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.22■■■■□ 3.39
STX4-216ENST00000566353 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
STX4-216ENST00000566353 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.16■■■■□ 3.38
STX4-216ENST00000566353 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
STX4-216ENST00000566353 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
STX4-216ENST00000566353 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.04■■■■□ 3.36
STX4-216ENST00000566353 PRXQ9BXM0 1461 aa36.02■■■■□ 3.36
STX4-216ENST00000566353 GOLGA3Q08378 1498 aa36.01■■■■□ 3.36
STX4-216ENST00000566353 ABCA8O94911 1581 aa35.92■■■■□ 3.34
STX4-216ENST00000566353 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.92■■■■□ 3.34
STX4-216ENST00000566353 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.91■■■■□ 3.34
STX4-216ENST00000566353 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.9■■■■□ 3.34
STX4-216ENST00000566353 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
STX4-216ENST00000566353 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.76■■■■□ 3.32
STX4-216ENST00000566353 ADGRL1O94910 1474 aa35.69■■■■□ 3.3
STX4-216ENST00000566353 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.68■■■■□ 3.3
STX4-216ENST00000566353 CD109Q6YHK3 1445 aa35.67■■■■□ 3.3
STX4-216ENST00000566353 SAMD9Q5K651 1589 aa35.67■■■■□ 3.3
STX4-216ENST00000566353 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.65■■■■□ 3.3
STX4-216ENST00000566353 KCNH8Q96L42 1107 aa35.64■■■■□ 3.3
STX4-216ENST00000566353 P3H3Q8IVL6 736 aa35.61■■■■□ 3.29
STX4-216ENST00000566353 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
STX4-216ENST00000566353 ATP10BO94823 1461 aa35.56■■■■□ 3.28
STX4-216ENST00000566353 EEA1Q15075 1411 aa35.56■■■■□ 3.28
STX4-216ENST00000566353 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.54■■■■□ 3.28
STX4-216ENST00000566353 ARID3CA6NKF2 412 aa35.53■■■■□ 3.28
STX4-216ENST00000566353 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.47■■■■□ 3.27
STX4-216ENST00000566353 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.4■■■■□ 3.26
STX4-216ENST00000566353 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
STX4-216ENST00000566353 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.36■■■■□ 3.25
STX4-216ENST00000566353 KIF21BO75037 1637 aa35.35■■■■□ 3.25
STX4-216ENST00000566353 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
STX4-216ENST00000566353 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
STX4-216ENST00000566353 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
STX4-216ENST00000566353 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.28■■■■□ 3.24
STX4-216ENST00000566353 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.28■■■■□ 3.24
STX4-216ENST00000566353 NEO1Q92859 1461 aa35.25■■■■□ 3.23
STX4-216ENST00000566353 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.25■■■■□ 3.23
STX4-216ENST00000566353 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.17■■■■□ 3.22
STX4-216ENST00000566353 RAPGEF3O95398 923 aa35.12■■■■□ 3.21
STX4-216ENST00000566353 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.1■■■■□ 3.21
STX4-216ENST00000566353 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.07■■■■□ 3.21
STX4-216ENST00000566353 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.06■■■■□ 3.2
STX4-216ENST00000566353 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.05■■■■□ 3.2
STX4-216ENST00000566353 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.05■■■■□ 3.2
STX4-216ENST00000566353 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
STX4-216ENST00000566353 RICTORQ6R327 1708 aa35.03■■■■□ 3.2
STX4-216ENST00000566353 FANCAO15360 1455 aa35.01■■■■□ 3.19
STX4-216ENST00000566353 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
STX4-216ENST00000566353 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.99■■■■□ 3.19
STX4-216ENST00000566353 AKNAQ7Z591 1439 aa34.98■■■■□ 3.19
STX4-216ENST00000566353 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.98■■■■□ 3.19
STX4-216ENST00000566353 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.95■■■■□ 3.19
STX4-216ENST00000566353 HECW1Q76N89 1606 aa34.95■■■■□ 3.18
STX4-216ENST00000566353 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
STX4-216ENST00000566353 PTPRMP28827 1452 aa34.94■■■■□ 3.18
STX4-216ENST00000566353 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.91■■■■□ 3.18
STX4-216ENST00000566353 FMN1Q68DA7 1419 aa34.91■■■■□ 3.18
STX4-216ENST00000566353 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.91■■■■□ 3.18
STX4-216ENST00000566353 MADDQ8WXG6 1647 aa34.9■■■■□ 3.18
STX4-216ENST00000566353 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.89■■■■□ 3.18
STX4-216ENST00000566353 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
STX4-216ENST00000566353 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
STX4-216ENST00000566353 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.81■■■■□ 3.16
STX4-216ENST00000566353 PLCH2O75038 1416 aa34.81■■■■□ 3.16
STX4-216ENST00000566353 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
STX4-216ENST00000566353 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.8■■■■□ 3.16
STX4-216ENST00000566353 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
STX4-216ENST00000566353 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.75■■■■□ 3.15
STX4-216ENST00000566353 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.75■■■■□ 3.15
STX4-216ENST00000566353 KIF14Q15058 1648 aa34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms