RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565787.1

CHTF18-216, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-216ENST00000565787 JPH4Q96JJ6 628 aa40.37■■■■■ 4.05
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CHTF18-216ENST00000565787 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CHTF18-216ENST00000565787 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.21■■■■■ 4.03
CHTF18-216ENST00000565787 IQGAP2Q13576 1575 aa40.11■■■■■ 4.01
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CHTF18-216ENST00000565787 PTPRGP23470 1445 aa39.81■■■■□ 3.96
CHTF18-216ENST00000565787 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.76■■■■□ 3.96
CHTF18-216ENST00000565787 KIAA0556O60303 1618 aa39.74■■■■□ 3.95
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CHTF18-216ENST00000565787 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.67■■■■□ 3.78
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CHTF18-216ENST00000565787 HECW1Q76N89 1606 aa38.61■■■■□ 3.77
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CHTF18-216ENST00000565787 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.41■■■■□ 3.74
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CHTF18-216ENST00000565787 NEO1Q92859 1461 aa38.35■■■■□ 3.73
CHTF18-216ENST00000565787 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.34■■■■□ 3.73
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CHTF18-216ENST00000565787 KIF14Q15058 1648 aa38.23■■■■□ 3.71
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CHTF18-216ENST00000565787 CEP162Q5TB80 1403 aa38.22■■■■□ 3.71
CHTF18-216ENST00000565787 FANCAO15360 1455 aa38.2■■■■□ 3.71
CHTF18-216ENST00000565787 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.18■■■■□ 3.7
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CHTF18-216ENST00000565787 PLCH2O75038 1416 aa38.14■■■■□ 3.7
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CHTF18-216ENST00000565787 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.12■■■■□ 3.69
CHTF18-216ENST00000565787 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.11■■■■□ 3.69
CHTF18-216ENST00000565787 RAPGEF3O95398 923 aa38.11■■■■□ 3.69
CHTF18-216ENST00000565787 RICTORQ6R327 1708 aa38.09■■■■□ 3.69
CHTF18-216ENST00000565787 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
CHTF18-216ENST00000565787 ADGRL1O94910 1474 aa38.04■■■■□ 3.68
CHTF18-216ENST00000565787 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.97■■■■□ 3.67
CHTF18-216ENST00000565787 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.96■■■■□ 3.67
CHTF18-216ENST00000565787 PREX2Q70Z35 1606 aa37.95■■■■□ 3.67
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