RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565511.5

RAB40C-209, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3

Gene RAB40C, Length 783 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-209ENST00000565511 CUL7Q14999 1698 aa41.49■■■■■ 4.23
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RAB40C-209ENST00000565511 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.14■■■■■ 4.18
RAB40C-209ENST00000565511 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.13■■■■■ 4.17
RAB40C-209ENST00000565511 IQGAP2Q13576 1575 aa41■■■■■ 4.15
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RAB40C-209ENST00000565511 DIP2BQ9P265 1576 aa40.86■■■■■ 4.13
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RAB40C-209ENST00000565511 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
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RAB40C-209ENST00000565511 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.81■■■■■ 4.12
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RAB40C-209ENST00000565511 ASXL2Q76L83 1435 aa40.51■■■■■ 4.08
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RAB40C-209ENST00000565511 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.23■■■■■ 4.03
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RAB40C-209ENST00000565511 SAMD9Q5K651 1589 aa40.11■■■■■ 4.01
RAB40C-209ENST00000565511 EEA1Q15075 1411 aa40.08■■■■■ 4.01
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RAB40C-209ENST00000565511 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.92■■■■□ 3.98
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RAB40C-209ENST00000565511 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.34■■■■□ 3.89
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RAB40C-209ENST00000565511 HECW1Q76N89 1606 aa39.25■■■■□ 3.87
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RAB40C-209ENST00000565511 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.99■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.96■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.91■■■■□ 3.82
RAB40C-209ENST00000565511 MADDQ8WXG6 1647 aa38.91■■■■□ 3.82
RAB40C-209ENST00000565511 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.9■■■■□ 3.82
RAB40C-209ENST00000565511 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.89■■■■□ 3.82
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