RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565511.5

RAB40C-209, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3

Gene RAB40C, Length 783 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-209ENST00000565511 CUL7Q14999 1698 aa41.49■■■■■ 4.23
RAB40C-209ENST00000565511 JPH4Q96JJ6 628 aa41.45■■■■■ 4.23
RAB40C-209ENST00000565511 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.31■■■■■ 4.2
RAB40C-209ENST00000565511 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.25■■■■■ 4.19
RAB40C-209ENST00000565511 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.14■■■■■ 4.18
RAB40C-209ENST00000565511 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.13■■■■■ 4.17
RAB40C-209ENST00000565511 IQGAP2Q13576 1575 aa41■■■■■ 4.15
RAB40C-209ENST00000565511 MAPKBP1O60336 1514 aa40.94■■■■■ 4.14
RAB40C-209ENST00000565511 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.91■■■■■ 4.14
RAB40C-209ENST00000565511 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.87■■■■■ 4.13
RAB40C-209ENST00000565511 DIP2BQ9P265 1576 aa40.86■■■■■ 4.13
RAB40C-209ENST00000565511 PTPRGP23470 1445 aa40.85■■■■■ 4.13
RAB40C-209ENST00000565511 DISP1Q96F81 1524 aa40.84■■■■■ 4.13
RAB40C-209ENST00000565511 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
RAB40C-209ENST00000565511 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.82■■■■■ 4.12
RAB40C-209ENST00000565511 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.81■■■■■ 4.12
RAB40C-209ENST00000565511 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
RAB40C-209ENST00000565511 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.75■■■■■ 4.11
RAB40C-209ENST00000565511 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.75■■■■■ 4.11
RAB40C-209ENST00000565511 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.68■■■■■ 4.1
RAB40C-209ENST00000565511 KIAA0556O60303 1618 aa40.67■■■■■ 4.1
RAB40C-209ENST00000565511 ABCC2Q92887 1545 aa40.67■■■■■ 4.1
RAB40C-209ENST00000565511 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.61■■■■■ 4.09
RAB40C-209ENST00000565511 PRXQ9BXM0 1461 aa40.61■■■■■ 4.09
RAB40C-209ENST00000565511 UACAQ9BZF9 1416 aa40.59■■■■■ 4.09
RAB40C-209ENST00000565511 TSPOAP1O95153 1857 aa40.58■■■■■ 4.09
RAB40C-209ENST00000565511 ASXL2Q76L83 1435 aa40.51■■■■■ 4.08
RAB40C-209ENST00000565511 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.45■■■■■ 4.07
RAB40C-209ENST00000565511 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
RAB40C-209ENST00000565511 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.42■■■■■ 4.06
RAB40C-209ENST00000565511 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
RAB40C-209ENST00000565511 KDM6BO15054 1643 aa40.38■■■■■ 4.06
RAB40C-209ENST00000565511 GLI2P10070 1586 aa40.38■■■■■ 4.05
RAB40C-209ENST00000565511 GOLGA3Q08378 1498 aa40.32■■■■■ 4.05
RAB40C-209ENST00000565511 ABCA8O94911 1581 aa40.29■■■■■ 4.04
RAB40C-209ENST00000565511 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
RAB40C-209ENST00000565511 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
RAB40C-209ENST00000565511 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.23■■■■■ 4.03
RAB40C-209ENST00000565511 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.23■■■■■ 4.03
RAB40C-209ENST00000565511 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.15■■■■■ 4.02
RAB40C-209ENST00000565511 SAMD9Q5K651 1589 aa40.11■■■■■ 4.01
RAB40C-209ENST00000565511 EEA1Q15075 1411 aa40.08■■■■■ 4.01
RAB40C-209ENST00000565511 P3H3Q8IVL6 736 aa40.08■■■■■ 4.01
RAB40C-209ENST00000565511 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
RAB40C-209ENST00000565511 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
RAB40C-209ENST00000565511 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.94■■■■□ 3.98
RAB40C-209ENST00000565511 ARID3CA6NKF2 412 aa39.93■■■■□ 3.98
RAB40C-209ENST00000565511 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.92■■■■□ 3.98
RAB40C-209ENST00000565511 ATP10BO94823 1461 aa39.91■■■■□ 3.98
RAB40C-209ENST00000565511 KIF21BO75037 1637 aa39.9■■■■□ 3.98
RAB40C-209ENST00000565511 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.88■■■■□ 3.97
RAB40C-209ENST00000565511 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.88■■■■□ 3.97
RAB40C-209ENST00000565511 KCNH8Q96L42 1107 aa39.88■■■■□ 3.97
RAB40C-209ENST00000565511 CD109Q6YHK3 1445 aa39.83■■■■□ 3.97
RAB40C-209ENST00000565511 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
RAB40C-209ENST00000565511 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.82■■■■□ 3.97
RAB40C-209ENST00000565511 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.82■■■■□ 3.97
RAB40C-209ENST00000565511 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.77■■■■□ 3.96
RAB40C-209ENST00000565511 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
RAB40C-209ENST00000565511 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.68■■■■□ 3.94
RAB40C-209ENST00000565511 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.65■■■■□ 3.94
RAB40C-209ENST00000565511 ADGRL1O94910 1474 aa39.64■■■■□ 3.94
RAB40C-209ENST00000565511 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.62■■■■□ 3.93
RAB40C-209ENST00000565511 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
RAB40C-209ENST00000565511 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
RAB40C-209ENST00000565511 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.5■■■■□ 3.91
RAB40C-209ENST00000565511 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
RAB40C-209ENST00000565511 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
RAB40C-209ENST00000565511 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.42■■■■□ 3.9
RAB40C-209ENST00000565511 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.37■■■■□ 3.89
RAB40C-209ENST00000565511 NEO1Q92859 1461 aa39.37■■■■□ 3.89
RAB40C-209ENST00000565511 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.34■■■■□ 3.89
RAB40C-209ENST00000565511 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.34■■■■□ 3.892e-6■■■□□ 16.1
RAB40C-209ENST00000565511 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.3■■■■□ 3.88
RAB40C-209ENST00000565511 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.3■■■■□ 3.88
RAB40C-209ENST00000565511 RAPGEF3O95398 923 aa39.28■■■■□ 3.88
RAB40C-209ENST00000565511 HECW1Q76N89 1606 aa39.25■■■■□ 3.87
RAB40C-209ENST00000565511 FMN1Q68DA7 1419 aa39.23■■■■□ 3.87
RAB40C-209ENST00000565511 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.2■■■■□ 3.87
RAB40C-209ENST00000565511 RICTORQ6R327 1708 aa39.18■■■■□ 3.86
RAB40C-209ENST00000565511 FANCAO15360 1455 aa39.16■■■■□ 3.86
RAB40C-209ENST00000565511 AKNAQ7Z591 1439 aa39.14■■■■□ 3.86
RAB40C-209ENST00000565511 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.14■■■■□ 3.86
RAB40C-209ENST00000565511 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
RAB40C-209ENST00000565511 KIF14Q15058 1648 aa39.1■■■■□ 3.85
RAB40C-209ENST00000565511 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
RAB40C-209ENST00000565511 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.07■■■■□ 3.84
RAB40C-209ENST00000565511 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.05■■■■□ 3.84
RAB40C-209ENST00000565511 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.05■■■■□ 3.84
RAB40C-209ENST00000565511 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
RAB40C-209ENST00000565511 PLCH2O75038 1416 aa39■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.99■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.99■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.96■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
RAB40C-209ENST00000565511 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.91■■■■□ 3.82
RAB40C-209ENST00000565511 MADDQ8WXG6 1647 aa38.91■■■■□ 3.82
RAB40C-209ENST00000565511 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.9■■■■□ 3.82
RAB40C-209ENST00000565511 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.89■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.6 ms