RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563901.5

SH3GL3-205, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3, human

TSL 1 (best)

Gene SH3GL3, Length 1,647 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3GL3-205	ENST00000563901	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	44.06	■■■■■ 4.64
SH3GL3-205	ENST00000563901	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.97	■■■■■ 4.63
SH3GL3-205	ENST00000563901	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		43.96	■■■■■ 4.63
SH3GL3-205	ENST00000563901	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.92	■■■■■ 4.62
SH3GL3-205	ENST00000563901	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.9	■■■■■ 4.62
SH3GL3-205	ENST00000563901	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.82	■■■■■ 4.61
SH3GL3-205	ENST00000563901	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	43.78	■■■■■ 4.6
SH3GL3-205	ENST00000563901	SHROOM2	Q13796	1616 aa		43.73	■■■■■ 4.59
SH3GL3-205	ENST00000563901	JPH4	Q96JJ6	628 aa		43.67	■■■■■ 4.58
SH3GL3-205	ENST00000563901	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.65	■■■■■ 4.58
SH3GL3-205	ENST00000563901	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		43.58	■■■■■ 4.57
SH3GL3-205	ENST00000563901	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.56	■■■■■ 4.56
SH3GL3-205	ENST00000563901	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.55	■■■■■ 4.56
SH3GL3-205	ENST00000563901	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.53	■■■■■ 4.56
SH3GL3-205	ENST00000563901	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.53	■■■■■ 4.56
SH3GL3-205	ENST00000563901	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.5	■■■■■ 4.55
SH3GL3-205	ENST00000563901	CLIP1	P30622	1438 aa		43.48	■■■■■ 4.55
SH3GL3-205	ENST00000563901	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		43.46	■■■■■ 4.55
SH3GL3-205	ENST00000563901	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.45	■■■■■ 4.55
SH3GL3-205	ENST00000563901	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		43.44	■■■■■ 4.54
SH3GL3-205	ENST00000563901	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.39	■■■■■ 4.54
SH3GL3-205	ENST00000563901	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SH3GL3-205	ENST00000563901	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		43.35	■■■■■ 4.53
SH3GL3-205	ENST00000563901	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.33	■■■■■ 4.53
SH3GL3-205	ENST00000563901	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.33	■■■■■ 4.53
SH3GL3-205	ENST00000563901	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.33	■■■■■ 4.53
SH3GL3-205	ENST00000563901	ARAP1	Q96P48	1450 aa		43.29	■■■■■ 4.52
SH3GL3-205	ENST00000563901	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
SH3GL3-205	ENST00000563901	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.12	■■■■■ 4.49
SH3GL3-205	ENST00000563901	PTPRG	P23470	1445 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SH3GL3-205	ENST00000563901	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SH3GL3-205	ENST00000563901	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SH3GL3-205	ENST00000563901	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
SH3GL3-205	ENST00000563901	ABCA8	O94911	1581 aa		42.94	■■■■■ 4.46
SH3GL3-205	ENST00000563901	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SH3GL3-205	ENST00000563901	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.92	■■■■■ 4.46
SH3GL3-205	ENST00000563901	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SH3GL3-205	ENST00000563901	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SH3GL3-205	ENST00000563901	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SH3GL3-205	ENST00000563901	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SH3GL3-205	ENST00000563901	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SH3GL3-205	ENST00000563901	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SH3GL3-205	ENST00000563901	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
SH3GL3-205	ENST00000563901	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SH3GL3-205	ENST00000563901	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SH3GL3-205	ENST00000563901	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
SH3GL3-205	ENST00000563901	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.75	■■■■■ 4.43
SH3GL3-205	ENST00000563901	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SH3GL3-205	ENST00000563901	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
SH3GL3-205	ENST00000563901	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
SH3GL3-205	ENST00000563901	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
SH3GL3-205	ENST00000563901	ATP10B	O94823	1461 aa		42.57	■■■■■ 4.41
SH3GL3-205	ENST00000563901	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SH3GL3-205	ENST00000563901	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SH3GL3-205	ENST00000563901	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SH3GL3-205	ENST00000563901	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
SH3GL3-205	ENST00000563901	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
SH3GL3-205	ENST00000563901	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SH3GL3-205	ENST00000563901	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.39	■■■■■ 4.38
SH3GL3-205	ENST00000563901	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.38	■■■■■ 4.37
SH3GL3-205	ENST00000563901	APLP2	Q06481	763 aa		42.35	■■■■■ 4.37
SH3GL3-205	ENST00000563901	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SH3GL3-205	ENST00000563901	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.28	■■■■■ 4.36
SH3GL3-205	ENST00000563901	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
SH3GL3-205	ENST00000563901	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
SH3GL3-205	ENST00000563901	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SH3GL3-205	ENST00000563901	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SH3GL3-205	ENST00000563901	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.21	■■■■■ 4.35
SH3GL3-205	ENST00000563901	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SH3GL3-205	ENST00000563901	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SH3GL3-205	ENST00000563901	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.2	■■■■■ 4.35
SH3GL3-205	ENST00000563901	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.18	■■■■■ 4.34
SH3GL3-205	ENST00000563901	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
SH3GL3-205	ENST00000563901	KIF14	Q15058	1648 aa		42.16	■■■■■ 4.34
SH3GL3-205	ENST00000563901	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.11	■■■■■ 4.33
SH3GL3-205	ENST00000563901	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
SH3GL3-205	ENST00000563901	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.99	■■■■■ 4.31
SH3GL3-205	ENST00000563901	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.99	■■■■■ 4.31
SH3GL3-205	ENST00000563901	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.98	■■■■■ 4.31	1e-7	■■□□□ 13.4
SH3GL3-205	ENST00000563901	NCOA2	Q15596	1464 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SH3GL3-205	ENST00000563901	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SH3GL3-205	ENST00000563901	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.93	■■■■■ 4.3
SH3GL3-205	ENST00000563901	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.91	■■■■■ 4.3
SH3GL3-205	ENST00000563901	GLI2	P10070	1586 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SH3GL3-205	ENST00000563901	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SH3GL3-205	ENST00000563901	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.84	■■■■■ 4.29
SH3GL3-205	ENST00000563901	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.82	■■■■■ 4.29
SH3GL3-205	ENST00000563901	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SH3GL3-205	ENST00000563901	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.8	■■■■■ 4.28
SH3GL3-205	ENST00000563901	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		41.76	■■■■■ 4.28
SH3GL3-205	ENST00000563901	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SH3GL3-205	ENST00000563901	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SH3GL3-205	ENST00000563901	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SH3GL3-205	ENST00000563901	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.74	■■■■■ 4.27
SH3GL3-205	ENST00000563901	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.74	■■■■■ 4.27
SH3GL3-205	ENST00000563901	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.7	■■■■■ 4.27
SH3GL3-205	ENST00000563901	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.7	■■■■■ 4.27
SH3GL3-205	ENST00000563901	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.68	■■■■■ 4.26
SH3GL3-205	ENST00000563901	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
SH3GL3-205	ENST00000563901	PLCH2	O75038	1416 aa		41.64	■■■■■ 4.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms