RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563545.1

CHTF18-214, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-214ENST00000563545 IGF1RP08069 1367 aa38.82■■■■□ 3.81
CHTF18-214ENST00000563545 CUL7Q14999 1698 aa38.79■■■■□ 3.8
CHTF18-214ENST00000563545 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.67■■■■□ 3.78
CHTF18-214ENST00000563545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.58■■■■□ 3.77
CHTF18-214ENST00000563545 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.52■■■■□ 3.76
CHTF18-214ENST00000563545 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.45■■■■□ 3.75
CHTF18-214ENST00000563545 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.43■■■■□ 3.74
CHTF18-214ENST00000563545 MAPKBP1O60336 1514 aa38.37■■■■□ 3.73
CHTF18-214ENST00000563545 IQGAP2Q13576 1575 aa38.33■■■■□ 3.73
CHTF18-214ENST00000563545 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.32■■■■□ 3.72
CHTF18-214ENST00000563545 PTPRGP23470 1445 aa38.29■■■■□ 3.72
CHTF18-214ENST00000563545 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.29■■■■□ 3.72
CHTF18-214ENST00000563545 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.28■■■■□ 3.72
CHTF18-214ENST00000563545 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.25■■■■□ 3.71
CHTF18-214ENST00000563545 DIP2BQ9P265 1576 aa38.24■■■■□ 3.71
CHTF18-214ENST00000563545 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.24■■■■□ 3.71
CHTF18-214ENST00000563545 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
CHTF18-214ENST00000563545 DISP1Q96F81 1524 aa38.13■■■■□ 3.69
CHTF18-214ENST00000563545 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
CHTF18-214ENST00000563545 ABCC2Q92887 1545 aa38.08■■■■□ 3.69
CHTF18-214ENST00000563545 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.08■■■■□ 3.69
CHTF18-214ENST00000563545 TSPOAP1O95153 1857 aa38.04■■■■□ 3.68
CHTF18-214ENST00000563545 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.02■■■■□ 3.68
CHTF18-214ENST00000563545 UACAQ9BZF9 1416 aa38.01■■■■□ 3.68
CHTF18-214ENST00000563545 KIAA0556O60303 1618 aa37.99■■■■□ 3.67
CHTF18-214ENST00000563545 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.98■■■■□ 3.67
CHTF18-214ENST00000563545 ASXL2Q76L83 1435 aa37.95■■■■□ 3.67
CHTF18-214ENST00000563545 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.92■■■■□ 3.66
CHTF18-214ENST00000563545 KDM6BO15054 1643 aa37.9■■■■□ 3.66
CHTF18-214ENST00000563545 PRXQ9BXM0 1461 aa37.87■■■■□ 3.65
CHTF18-214ENST00000563545 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.85■■■■□ 3.65
CHTF18-214ENST00000563545 GLI2P10070 1586 aa37.83■■■■□ 3.65
CHTF18-214ENST00000563545 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
CHTF18-214ENST00000563545 GOLGA3Q08378 1498 aa37.78■■■■□ 3.64
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CHTF18-214ENST00000563545 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
CHTF18-214ENST00000563545 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.64■■■■□ 3.62
CHTF18-214ENST00000563545 ABCA8O94911 1581 aa37.63■■■■□ 3.61
CHTF18-214ENST00000563545 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.6■■■■□ 3.61
CHTF18-214ENST00000563545 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.58■■■■□ 3.61
CHTF18-214ENST00000563545 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.51■■■■□ 3.59
CHTF18-214ENST00000563545 P3H3Q8IVL6 736 aa37.47■■■■□ 3.59
CHTF18-214ENST00000563545 EEA1Q15075 1411 aa37.46■■■■□ 3.59
CHTF18-214ENST00000563545 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
CHTF18-214ENST00000563545 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.44■■■■□ 3.58
CHTF18-214ENST00000563545 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
CHTF18-214ENST00000563545 SAMD9Q5K651 1589 aa37.41■■■■□ 3.58
CHTF18-214ENST00000563545 KCNH8Q96L42 1107 aa37.4■■■■□ 3.58
CHTF18-214ENST00000563545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.39■■■■□ 3.58
CHTF18-214ENST00000563545 CD109Q6YHK3 1445 aa37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-214ENST00000563545 ARID3CA6NKF2 412 aa37.33■■■■□ 3.57
CHTF18-214ENST00000563545 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.31■■■■□ 3.56
CHTF18-214ENST00000563545 ATP10BO94823 1461 aa37.31■■■■□ 3.56
CHTF18-214ENST00000563545 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.26■■■■□ 3.56
CHTF18-214ENST00000563545 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CHTF18-214ENST00000563545 ADGRL1O94910 1474 aa37.19■■■■□ 3.54
CHTF18-214ENST00000563545 KIF21BO75037 1637 aa37.18■■■■□ 3.54
CHTF18-214ENST00000563545 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.16■■■■□ 3.54
CHTF18-214ENST00000563545 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.11■■■■□ 3.53
CHTF18-214ENST00000563545 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
CHTF18-214ENST00000563545 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
CHTF18-214ENST00000563545 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
CHTF18-214ENST00000563545 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.04■■■■□ 3.52
CHTF18-214ENST00000563545 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.02■■■■□ 3.52
CHTF18-214ENST00000563545 CHIC1Q5VXU3 224 aa37■■■■□ 3.51
CHTF18-214ENST00000563545 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.94■■■■□ 3.5
CHTF18-214ENST00000563545 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.93■■■■□ 3.5
CHTF18-214ENST00000563545 NEO1Q92859 1461 aa36.89■■■■□ 3.5
CHTF18-214ENST00000563545 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.89■■■■□ 3.5
CHTF18-214ENST00000563545 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
CHTF18-214ENST00000563545 RAPGEF3O95398 923 aa36.81■■■■□ 3.48
CHTF18-214ENST00000563545 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
CHTF18-214ENST00000563545 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.75■■■■□ 3.47
CHTF18-214ENST00000563545 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.74■■■■□ 3.47
CHTF18-214ENST00000563545 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.73■■■■□ 3.47
CHTF18-214ENST00000563545 FMN1Q68DA7 1419 aa36.71■■■■□ 3.47
CHTF18-214ENST00000563545 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.7■■■■□ 3.47
CHTF18-214ENST00000563545 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.68■■■■□ 3.46
CHTF18-214ENST00000563545 HECW1Q76N89 1606 aa36.67■■■■□ 3.46
CHTF18-214ENST00000563545 FANCAO15360 1455 aa36.67■■■■□ 3.46
CHTF18-214ENST00000563545 AKNAQ7Z591 1439 aa36.66■■■■□ 3.46
CHTF18-214ENST00000563545 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.66■■■■□ 3.46
CHTF18-214ENST00000563545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
CHTF18-214ENST00000563545 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CHTF18-214ENST00000563545 RICTORQ6R327 1708 aa36.63■■■■□ 3.45
CHTF18-214ENST00000563545 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.58■■■■□ 3.45
CHTF18-214ENST00000563545 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.54■■■■□ 3.44
CHTF18-214ENST00000563545 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.52■■■■□ 3.44
CHTF18-214ENST00000563545 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
CHTF18-214ENST00000563545 PLCH2O75038 1416 aa36.51■■■■□ 3.43
CHTF18-214ENST00000563545 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CHTF18-214ENST00000563545 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.48■■■■□ 3.43
CHTF18-214ENST00000563545 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.47■■■■□ 3.43
CHTF18-214ENST00000563545 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.47■■■■□ 3.43
CHTF18-214ENST00000563545 PTPRMP28827 1452 aa36.46■■■■□ 3.43
CHTF18-214ENST00000563545 KIF14Q15058 1648 aa36.45■■■■□ 3.42
CHTF18-214ENST00000563545 MADDQ8WXG6 1647 aa36.42■■■■□ 3.42
CHTF18-214ENST00000563545 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CHTF18-214ENST00000563545 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.42■■■■□ 3.42
CHTF18-214ENST00000563545 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.4■■■■□ 3.42
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