RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562996.1

AC068987.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC068987.1, Length 427 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC068987.1-201ENST00000562996 SHROOM2Q13796 1616 aa33.07■■■□□ 2.88
AC068987.1-201ENST00000562996 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
AC068987.1-201ENST00000562996 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.05■■■□□ 2.88
AC068987.1-201ENST00000562996 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.02■■■□□ 2.88
AC068987.1-201ENST00000562996 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.99■■■□□ 2.87
AC068987.1-201ENST00000562996 ARAP1Q96P48 1450 aa32.96■■■□□ 2.87
AC068987.1-201ENST00000562996 IQGAP2Q13576 1575 aa32.92■■■□□ 2.86
AC068987.1-201ENST00000562996 JPH4Q96JJ6 628 aa32.91■■■□□ 2.86
AC068987.1-201ENST00000562996 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.91■■■□□ 2.86
AC068987.1-201ENST00000562996 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
AC068987.1-201ENST00000562996 KIF21BO75037 1637 aa32.86■■■□□ 2.85
AC068987.1-201ENST00000562996 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.81■■■□□ 2.84
AC068987.1-201ENST00000562996 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.72■■■□□ 2.83
AC068987.1-201ENST00000562996 DISP1Q96F81 1524 aa32.67■■■□□ 2.82
AC068987.1-201ENST00000562996 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.65■■■□□ 2.82
AC068987.1-201ENST00000562996 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.65■■■□□ 2.82
AC068987.1-201ENST00000562996 GOLGA3Q08378 1498 aa32.64■■■□□ 2.82
AC068987.1-201ENST00000562996 KIAA0556O60303 1618 aa32.62■■■□□ 2.81
AC068987.1-201ENST00000562996 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.53■■■□□ 2.8
AC068987.1-201ENST00000562996 PTPRGP23470 1445 aa32.5■■■□□ 2.79
AC068987.1-201ENST00000562996 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SAMD9Q5K651 1589 aa32.47■■■□□ 2.79
AC068987.1-201ENST00000562996 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
AC068987.1-201ENST00000562996 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.43■■■□□ 2.78
AC068987.1-201ENST00000562996 P3H3Q8IVL6 736 aa32.36■■■□□ 2.77
AC068987.1-201ENST00000562996 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.33■■■□□ 2.77
AC068987.1-201ENST00000562996 UACAQ9BZF9 1416 aa32.29■■■□□ 2.76
AC068987.1-201ENST00000562996 ABCC2Q92887 1545 aa32.28■■■□□ 2.76
AC068987.1-201ENST00000562996 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.27■■■□□ 2.76
AC068987.1-201ENST00000562996 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.26■■■□□ 2.75
AC068987.1-201ENST00000562996 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.26■■■□□ 2.75
AC068987.1-201ENST00000562996 ABCA8O94911 1581 aa32.23■■■□□ 2.75
AC068987.1-201ENST00000562996 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.21■■■□□ 2.75
AC068987.1-201ENST00000562996 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.74
AC068987.1-201ENST00000562996 MAPKBP1O60336 1514 aa32.14■■■□□ 2.74
AC068987.1-201ENST00000562996 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
AC068987.1-201ENST00000562996 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.12■■■□□ 2.73
AC068987.1-201ENST00000562996 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.12■■■□□ 2.73
AC068987.1-201ENST00000562996 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.09■■■□□ 2.73
AC068987.1-201ENST00000562996 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
AC068987.1-201ENST00000562996 CLIP1P30622 1438 aa32.06■■■□□ 2.72
AC068987.1-201ENST00000562996 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32■■■□□ 2.71
AC068987.1-201ENST00000562996 ASXL2Q76L83 1435 aa32■■■□□ 2.71
AC068987.1-201ENST00000562996 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
AC068987.1-201ENST00000562996 FMN1Q68DA7 1419 aa31.99■■■□□ 2.71
AC068987.1-201ENST00000562996 CEP162Q5TB80 1403 aa31.98■■■□□ 2.71
AC068987.1-201ENST00000562996 ARID3CA6NKF2 412 aa31.97■■■□□ 2.71
AC068987.1-201ENST00000562996 DIP2BQ9P265 1576 aa31.97■■■□□ 2.71
AC068987.1-201ENST00000562996 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.94■■■□□ 2.7
AC068987.1-201ENST00000562996 ATP10BO94823 1461 aa31.93■■■□□ 2.7
AC068987.1-201ENST00000562996 HECW1Q76N89 1606 aa31.89■■■□□ 2.7
AC068987.1-201ENST00000562996 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
AC068987.1-201ENST00000562996 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.87■■■□□ 2.69
AC068987.1-201ENST00000562996 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.84■■■□□ 2.69
AC068987.1-201ENST00000562996 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
AC068987.1-201ENST00000562996 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
AC068987.1-201ENST00000562996 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.8■■■□□ 2.68
AC068987.1-201ENST00000562996 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
AC068987.1-201ENST00000562996 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
AC068987.1-201ENST00000562996 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
AC068987.1-201ENST00000562996 GLI2P10070 1586 aa31.77■■■□□ 2.68
AC068987.1-201ENST00000562996 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.77■■■□□ 2.68
AC068987.1-201ENST00000562996 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.74■■■□□ 2.67
AC068987.1-201ENST00000562996 TSPOAP1O95153 1857 aa31.71■■■□□ 2.67
AC068987.1-201ENST00000562996 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.68■■■□□ 2.66
AC068987.1-201ENST00000562996 KCNH8Q96L42 1107 aa31.68■■■□□ 2.66
AC068987.1-201ENST00000562996 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.64■■■□□ 2.66
AC068987.1-201ENST00000562996 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.65
AC068987.1-201ENST00000562996 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.61■■■□□ 2.65
AC068987.1-201ENST00000562996 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.61■■■□□ 2.65
AC068987.1-201ENST00000562996 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.59■■■□□ 2.65
AC068987.1-201ENST00000562996 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.57■■■□□ 2.64
AC068987.1-201ENST00000562996 CD109Q6YHK3 1445 aa31.52■■■□□ 2.64
AC068987.1-201ENST00000562996 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.51■■■□□ 2.63
AC068987.1-201ENST00000562996 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
AC068987.1-201ENST00000562996 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.5■■■□□ 2.63
AC068987.1-201ENST00000562996 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
AC068987.1-201ENST00000562996 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
AC068987.1-201ENST00000562996 KIF14Q15058 1648 aa31.49■■■□□ 2.63
AC068987.1-201ENST00000562996 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.46■■■□□ 2.63
AC068987.1-201ENST00000562996 KDM6BO15054 1643 aa31.39■■■□□ 2.62
AC068987.1-201ENST00000562996 TIAM1Q13009 1591 aa31.37■■■□□ 2.61
AC068987.1-201ENST00000562996 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.33■■■□□ 2.61
AC068987.1-201ENST00000562996 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.32■■■□□ 2.6
AC068987.1-201ENST00000562996 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.31■■■□□ 2.6
AC068987.1-201ENST00000562996 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
AC068987.1-201ENST00000562996 NEO1Q92859 1461 aa31.26■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 PLCH2O75038 1416 aa31.25■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 FANCAO15360 1455 aa31.25■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.25■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 MAP3K1Q13233 1512 aa31.24■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.22■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 PREX2Q70Z35 1606 aa31.22■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.21■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.21■■■□□ 2.59
AC068987.1-201ENST00000562996 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.2■■■□□ 2.58
AC068987.1-201ENST00000562996 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.19■■■□□ 2.58
AC068987.1-201ENST00000562996 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
AC068987.1-201ENST00000562996 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms