RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562664.5

PPP4C-204, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-204ENST00000562664 KIF27Q86VH2 1401 aa41.64■■■■■ 4.26
PPP4C-204ENST00000562664 IGF1RP08069 1367 aa41.61■■■■■ 4.25
PPP4C-204ENST00000562664 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP4C-204ENST00000562664 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.54■■■■■ 4.24
PPP4C-204ENST00000562664 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.43■■■■■ 4.22
PPP4C-204ENST00000562664 MAPKBP1O60336 1514 aa41.35■■■■■ 4.21
PPP4C-204ENST00000562664 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.33■■■■■ 4.21
PPP4C-204ENST00000562664 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.27■■■■■ 4.2
PPP4C-204ENST00000562664 DIP2BQ9P265 1576 aa41.25■■■■■ 4.19
PPP4C-204ENST00000562664 IQGAP2Q13576 1575 aa41.2■■■■■ 4.19
PPP4C-204ENST00000562664 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.17■■■■■ 4.18
PPP4C-204ENST00000562664 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.09■■■■■ 4.17
PPP4C-204ENST00000562664 PTPRGP23470 1445 aa41.08■■■■■ 4.17
PPP4C-204ENST00000562664 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.07■■■■■ 4.16
PPP4C-204ENST00000562664 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.04■■■■■ 4.16
PPP4C-204ENST00000562664 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
PPP4C-204ENST00000562664 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41■■■■■ 4.15
PPP4C-204ENST00000562664 DISP1Q96F81 1524 aa40.98■■■■■ 4.15
PPP4C-204ENST00000562664 ABCC2Q92887 1545 aa40.96■■■■■ 4.15
PPP4C-204ENST00000562664 TSPOAP1O95153 1857 aa40.96■■■■■ 4.15
PPP4C-204ENST00000562664 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.93■■■■■ 4.14
PPP4C-204ENST00000562664 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4C-204ENST00000562664 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
PPP4C-204ENST00000562664 KDM6BO15054 1643 aa40.86■■■■■ 4.13
PPP4C-204ENST00000562664 KIAA0556O60303 1618 aa40.85■■■■■ 4.13
PPP4C-204ENST00000562664 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.85■■■■■ 4.13
PPP4C-204ENST00000562664 UACAQ9BZF9 1416 aa40.82■■■■■ 4.12
PPP4C-204ENST00000562664 ASXL2Q76L83 1435 aa40.78■■■■■ 4.12
PPP4C-204ENST00000562664 GLI2P10070 1586 aa40.76■■■■■ 4.12
PPP4C-204ENST00000562664 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.76■■■■■ 4.12
PPP4C-204ENST00000562664 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
PPP4C-204ENST00000562664 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP4C-204ENST00000562664 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
PPP4C-204ENST00000562664 PRXQ9BXM0 1461 aa40.61■■■■■ 4.09
PPP4C-204ENST00000562664 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.58■■■■■ 4.09
PPP4C-204ENST00000562664 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
PPP4C-204ENST00000562664 GOLGA3Q08378 1498 aa40.52■■■■■ 4.08
PPP4C-204ENST00000562664 ABCA8O94911 1581 aa40.47■■■■■ 4.07
PPP4C-204ENST00000562664 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.41■■■■■ 4.06
PPP4C-204ENST00000562664 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.36■■■■■ 4.05
PPP4C-204ENST00000562664 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
PPP4C-204ENST00000562664 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.33■■■■■ 4.05
PPP4C-204ENST00000562664 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.28■■■■■ 4.04
PPP4C-204ENST00000562664 SAMD9Q5K651 1589 aa40.22■■■■■ 4.03
PPP4C-204ENST00000562664 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.16■■■■■ 4.02
PPP4C-204ENST00000562664 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.14■■■■■ 4.02
PPP4C-204ENST00000562664 CD109Q6YHK3 1445 aa40.1■■■■■ 4.01
PPP4C-204ENST00000562664 ADGRL1O94910 1474 aa40.09■■■■■ 4.01
PPP4C-204ENST00000562664 EEA1Q15075 1411 aa40.08■■■■■ 4.01
PPP4C-204ENST00000562664 ATP10BO94823 1461 aa40.05■■■■■ 4
PPP4C-204ENST00000562664 P3H3Q8IVL6 736 aa40.04■■■■■ 4
PPP4C-204ENST00000562664 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.03■■■■■ 4
PPP4C-204ENST00000562664 KCNH8Q96L42 1107 aa40.03■■■■■ 4
PPP4C-204ENST00000562664 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.95■■■■□ 3.99
PPP4C-204ENST00000562664 ARID3CA6NKF2 412 aa39.92■■■■□ 3.98
PPP4C-204ENST00000562664 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
PPP4C-204ENST00000562664 KIF21BO75037 1637 aa39.88■■■■□ 3.97
PPP4C-204ENST00000562664 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
PPP4C-204ENST00000562664 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.84■■■■□ 3.97
PPP4C-204ENST00000562664 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.82■■■■□ 3.97
PPP4C-204ENST00000562664 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.75■■■■□ 3.95
PPP4C-204ENST00000562664 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
PPP4C-204ENST00000562664 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.67■■■■□ 3.94
PPP4C-204ENST00000562664 NEO1Q92859 1461 aa39.67■■■■□ 3.94
PPP4C-204ENST00000562664 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
PPP4C-204ENST00000562664 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
PPP4C-204ENST00000562664 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.62■■■■□ 3.93
PPP4C-204ENST00000562664 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.6■■■■□ 3.93
PPP4C-204ENST00000562664 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.5■■■■□ 3.911e-10■■□□□ 13.3
PPP4C-204ENST00000562664 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP4C-204ENST00000562664 RAPGEF3O95398 923 aa39.48■■■■□ 3.91
PPP4C-204ENST00000562664 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.47■■■■□ 3.91
PPP4C-204ENST00000562664 RICTORQ6R327 1708 aa39.47■■■■□ 3.91
PPP4C-204ENST00000562664 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
PPP4C-204ENST00000562664 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.46■■■■□ 3.91
PPP4C-204ENST00000562664 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.45■■■■□ 3.91
PPP4C-204ENST00000562664 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP4C-204ENST00000562664 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.39■■■■□ 3.9
PPP4C-204ENST00000562664 FANCAO15360 1455 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-204ENST00000562664 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-204ENST00000562664 HECW1Q76N89 1606 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-204ENST00000562664 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-204ENST00000562664 AKNAQ7Z591 1439 aa39.35■■■■□ 3.89
PPP4C-204ENST00000562664 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
PPP4C-204ENST00000562664 FMN1Q68DA7 1419 aa39.31■■■■□ 3.88
PPP4C-204ENST00000562664 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
PPP4C-204ENST00000562664 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.3■■■■□ 3.88
PPP4C-204ENST00000562664 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP4C-204ENST00000562664 PTPRMP28827 1452 aa39.28■■■■□ 3.88
PPP4C-204ENST00000562664 MADDQ8WXG6 1647 aa39.27■■■■□ 3.88
PPP4C-204ENST00000562664 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP4C-204ENST00000562664 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.23■■■■□ 3.87
PPP4C-204ENST00000562664 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.18■■■■□ 3.86
PPP4C-204ENST00000562664 KIF14Q15058 1648 aa39.18■■■■□ 3.86
PPP4C-204ENST00000562664 PLCH2O75038 1416 aa39.17■■■■□ 3.86
PPP4C-204ENST00000562664 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.15■■■■□ 3.86
PPP4C-204ENST00000562664 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.86
PPP4C-204ENST00000562664 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.11■■■■□ 3.85
PPP4C-204ENST00000562664 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PPP4C-204ENST00000562664 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.11■■■■□ 3.85
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