RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561896.1

MSLN-203, Transcript of mesothelin, humanhuman

TSL 5

Gene MSLN, Length 1,195 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLN-203ENST00000561896 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
MSLN-203ENST00000561896 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.67■■■■■ 4.58
MSLN-203ENST00000561896 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.65■■■■■ 4.58
MSLN-203ENST00000561896 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
MSLN-203ENST00000561896 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.36■■■■■ 4.53
MSLN-203ENST00000561896 IQGAP2Q13576 1575 aa43.29■■■■■ 4.52
MSLN-203ENST00000561896 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.2■■■■■ 4.51
MSLN-203ENST00000561896 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.12■■■■■ 4.49
MSLN-203ENST00000561896 PTPRGP23470 1445 aa43.1■■■■■ 4.49
MSLN-203ENST00000561896 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.09■■■■■ 4.49
MSLN-203ENST00000561896 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.07■■■■■ 4.49
MSLN-203ENST00000561896 PRXQ9BXM0 1461 aa43.07■■■■■ 4.49
MSLN-203ENST00000561896 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.07■■■■■ 4.49
MSLN-203ENST00000561896 MAPKBP1O60336 1514 aa43.03■■■■■ 4.48
MSLN-203ENST00000561896 DISP1Q96F81 1524 aa43.02■■■■■ 4.48
MSLN-203ENST00000561896 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.99■■■■■ 4.47
MSLN-203ENST00000561896 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.97■■■■■ 4.47
MSLN-203ENST00000561896 KIAA0556O60303 1618 aa42.89■■■■■ 4.46
MSLN-203ENST00000561896 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.88■■■■■ 4.46
MSLN-203ENST00000561896 EEA1Q15075 1411 aa42.87■■■■■ 4.45
MSLN-203ENST00000561896 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.86■■■■■ 4.45
MSLN-203ENST00000561896 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.85■■■■■ 4.45
MSLN-203ENST00000561896 ABCC2Q92887 1545 aa42.82■■■■■ 4.45
MSLN-203ENST00000561896 UACAQ9BZF9 1416 aa42.8■■■■■ 4.44
MSLN-203ENST00000561896 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
MSLN-203ENST00000561896 GOLGA3Q08378 1498 aa42.79■■■■■ 4.44
MSLN-203ENST00000561896 DIP2BQ9P265 1576 aa42.77■■■■■ 4.44
MSLN-203ENST00000561896 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.75■■■■■ 4.43
MSLN-203ENST00000561896 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.63■■■■■ 4.42
MSLN-203ENST00000561896 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.62■■■■■ 4.41
MSLN-203ENST00000561896 ASXL2Q76L83 1435 aa42.57■■■■■ 4.41
MSLN-203ENST00000561896 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.52■■■■■ 4.4
MSLN-203ENST00000561896 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
MSLN-203ENST00000561896 GLI2P10070 1586 aa42.48■■■■■ 4.39
MSLN-203ENST00000561896 ABCA8O94911 1581 aa42.47■■■■■ 4.39
MSLN-203ENST00000561896 KIF21BO75037 1637 aa42.44■■■■■ 4.38
MSLN-203ENST00000561896 SAMD9Q5K651 1589 aa42.42■■■■■ 4.38
MSLN-203ENST00000561896 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
MSLN-203ENST00000561896 TSPOAP1O95153 1857 aa42.4■■■■■ 4.38
MSLN-203ENST00000561896 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
MSLN-203ENST00000561896 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.29■■■■■ 4.36
MSLN-203ENST00000561896 P3H3Q8IVL6 736 aa42.26■■■■■ 4.36
MSLN-203ENST00000561896 KDM6BO15054 1643 aa42.24■■■■■ 4.35
MSLN-203ENST00000561896 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
MSLN-203ENST00000561896 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.23■■■■■ 4.35
MSLN-203ENST00000561896 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.14■■■■■ 4.34
MSLN-203ENST00000561896 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.12■■■■■ 4.33
MSLN-203ENST00000561896 ATP10BO94823 1461 aa42.1■■■■■ 4.33
MSLN-203ENST00000561896 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.1■■■■■ 4.33
MSLN-203ENST00000561896 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.05■■■■■ 4.32
MSLN-203ENST00000561896 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
MSLN-203ENST00000561896 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.03■■■■■ 4.32
MSLN-203ENST00000561896 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
MSLN-203ENST00000561896 KCNH8Q96L42 1107 aa41.97■■■■■ 4.31
MSLN-203ENST00000561896 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.95■■■■■ 4.31
MSLN-203ENST00000561896 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
MSLN-203ENST00000561896 CD109Q6YHK3 1445 aa41.95■■■■■ 4.31
MSLN-203ENST00000561896 ARID3CA6NKF2 412 aa41.92■■■■■ 4.3
MSLN-203ENST00000561896 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
MSLN-203ENST00000561896 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
MSLN-203ENST00000561896 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.82■■■■■ 4.29
MSLN-203ENST00000561896 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.8■■■■■ 4.28
MSLN-203ENST00000561896 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
MSLN-203ENST00000561896 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
MSLN-203ENST00000561896 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.77■■■■■ 4.28
MSLN-203ENST00000561896 FMN1Q68DA7 1419 aa41.75■■■■■ 4.27
MSLN-203ENST00000561896 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.69■■■■■ 4.26
MSLN-203ENST00000561896 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.65■■■■■ 4.26
MSLN-203ENST00000561896 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.62■■■■■ 4.25
MSLN-203ENST00000561896 HECW1Q76N89 1606 aa41.59■■■■■ 4.25
MSLN-203ENST00000561896 NEO1Q92859 1461 aa41.55■■■■■ 4.24
MSLN-203ENST00000561896 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
MSLN-203ENST00000561896 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.52■■■■■ 4.24
MSLN-203ENST00000561896 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
MSLN-203ENST00000561896 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
MSLN-203ENST00000561896 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
MSLN-203ENST00000561896 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.37■■■■■ 4.21
MSLN-203ENST00000561896 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.36■■■■■ 4.21
MSLN-203ENST00000561896 ADGRL1O94910 1474 aa41.34■■■■■ 4.21
MSLN-203ENST00000561896 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.34■■■■■ 4.21
MSLN-203ENST00000561896 FANCAO15360 1455 aa41.31■■■■■ 4.2
MSLN-203ENST00000561896 CLIP1P30622 1438 aa41.31■■■■■ 4.2
MSLN-203ENST00000561896 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.31■■■■■ 4.2
MSLN-203ENST00000561896 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
MSLN-203ENST00000561896 AKNAQ7Z591 1439 aa41.27■■■■■ 4.2
MSLN-203ENST00000561896 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
MSLN-203ENST00000561896 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.26■■■■■ 4.2
MSLN-203ENST00000561896 RAPGEF3O95398 923 aa41.25■■■■■ 4.19
MSLN-203ENST00000561896 PLCH2O75038 1416 aa41.25■■■■■ 4.19
MSLN-203ENST00000561896 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.23■■■■■ 4.19
MSLN-203ENST00000561896 KIF14Q15058 1648 aa41.21■■■■■ 4.19
MSLN-203ENST00000561896 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
MSLN-203ENST00000561896 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.21■■■■■ 4.19
MSLN-203ENST00000561896 RICTORQ6R327 1708 aa41.18■■■■■ 4.18
MSLN-203ENST00000561896 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.18■■■■■ 4.18
MSLN-203ENST00000561896 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.07■■■■■ 4.17
MSLN-203ENST00000561896 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.06■■■■■ 4.16
MSLN-203ENST00000561896 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.02■■■■■ 4.16
MSLN-203ENST00000561896 SCAPERQ9BY12 1400 aa41■■■■■ 4.15
MSLN-203ENST00000561896 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.99■■■■■ 4.15
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