RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561277.5

TSPAN3-210, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-210ENST00000561277 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.51■■■□□ 2.95
TSPAN3-210ENST00000561277 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.5■■■□□ 2.95
TSPAN3-210ENST00000561277 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.48■■■□□ 2.95
TSPAN3-210ENST00000561277 JPH4Q96JJ6 628 aa33.46■■■□□ 2.95
TSPAN3-210ENST00000561277 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
TSPAN3-210ENST00000561277 PRXQ9BXM0 1461 aa33.36■■■□□ 2.93
TSPAN3-210ENST00000561277 EEA1Q15075 1411 aa33.34■■■□□ 2.93
TSPAN3-210ENST00000561277 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.33■■■□□ 2.93
TSPAN3-210ENST00000561277 IQGAP2Q13576 1575 aa33.32■■■□□ 2.93
TSPAN3-210ENST00000561277 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
TSPAN3-210ENST00000561277 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.21■■■□□ 2.91
TSPAN3-210ENST00000561277 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.14■■■□□ 2.9
TSPAN3-210ENST00000561277 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.11■■■□□ 2.89
TSPAN3-210ENST00000561277 DISP1Q96F81 1524 aa33.08■■■□□ 2.89
TSPAN3-210ENST00000561277 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
TSPAN3-210ENST00000561277 KIF21BO75037 1637 aa33.03■■■□□ 2.88
TSPAN3-210ENST00000561277 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.03■■■□□ 2.88
TSPAN3-210ENST00000561277 PTPRGP23470 1445 aa33.01■■■□□ 2.88
TSPAN3-210ENST00000561277 KIAA0556O60303 1618 aa33.01■■■□□ 2.87
TSPAN3-210ENST00000561277 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
TSPAN3-210ENST00000561277 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.95■■■□□ 2.86
TSPAN3-210ENST00000561277 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.95■■■□□ 2.86
TSPAN3-210ENST00000561277 GOLGA3Q08378 1498 aa32.92■■■□□ 2.86
TSPAN3-210ENST00000561277 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.83■■■□□ 2.85
TSPAN3-210ENST00000561277 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
TSPAN3-210ENST00000561277 UACAQ9BZF9 1416 aa32.79■■■□□ 2.84
TSPAN3-210ENST00000561277 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
TSPAN3-210ENST00000561277 P3H3Q8IVL6 736 aa32.79■■■□□ 2.84
TSPAN3-210ENST00000561277 SAMD9Q5K651 1589 aa32.76■■■□□ 2.83
TSPAN3-210ENST00000561277 ABCC2Q92887 1545 aa32.74■■■□□ 2.83
TSPAN3-210ENST00000561277 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.73■■■□□ 2.83
TSPAN3-210ENST00000561277 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.71■■■□□ 2.83
TSPAN3-210ENST00000561277 MAPKBP1O60336 1514 aa32.7■■■□□ 2.83
TSPAN3-210ENST00000561277 ABCA8O94911 1581 aa32.63■■■□□ 2.81
TSPAN3-210ENST00000561277 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.62■■■□□ 2.81
TSPAN3-210ENST00000561277 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.61■■■□□ 2.81
TSPAN3-210ENST00000561277 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.59■■■□□ 2.81
TSPAN3-210ENST00000561277 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
TSPAN3-210ENST00000561277 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.58■■■□□ 2.81
TSPAN3-210ENST00000561277 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.56■■■□□ 2.8
TSPAN3-210ENST00000561277 DIP2BQ9P265 1576 aa32.54■■■□□ 2.8
TSPAN3-210ENST00000561277 ASXL2Q76L83 1435 aa32.54■■■□□ 2.8
TSPAN3-210ENST00000561277 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.52■■■□□ 2.8
TSPAN3-210ENST00000561277 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.48■■■□□ 2.79
TSPAN3-210ENST00000561277 ARID3CA6NKF2 412 aa32.47■■■□□ 2.79
TSPAN3-210ENST00000561277 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.45■■■□□ 2.79
TSPAN3-210ENST00000561277 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.36■■■□□ 2.77
TSPAN3-210ENST00000561277 ATP10BO94823 1461 aa32.36■■■□□ 2.77
TSPAN3-210ENST00000561277 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
TSPAN3-210ENST00000561277 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
TSPAN3-210ENST00000561277 TSPOAP1O95153 1857 aa32.3■■■□□ 2.76
TSPAN3-210ENST00000561277 GLI2P10070 1586 aa32.3■■■□□ 2.76
TSPAN3-210ENST00000561277 FMN1Q68DA7 1419 aa32.3■■■□□ 2.76
TSPAN3-210ENST00000561277 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
TSPAN3-210ENST00000561277 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
TSPAN3-210ENST00000561277 CLIP1P30622 1438 aa32.26■■■□□ 2.75
TSPAN3-210ENST00000561277 KCNH8Q96L42 1107 aa32.24■■■□□ 2.75
TSPAN3-210ENST00000561277 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
TSPAN3-210ENST00000561277 HECW1Q76N89 1606 aa32.19■■■□□ 2.74
TSPAN3-210ENST00000561277 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.19■■■□□ 2.74
TSPAN3-210ENST00000561277 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.19■■■□□ 2.74
TSPAN3-210ENST00000561277 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
TSPAN3-210ENST00000561277 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
TSPAN3-210ENST00000561277 CEP162Q5TB80 1403 aa32.12■■■□□ 2.73
TSPAN3-210ENST00000561277 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
TSPAN3-210ENST00000561277 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.09■■■□□ 2.73
TSPAN3-210ENST00000561277 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.07■■■□□ 2.72
TSPAN3-210ENST00000561277 CD109Q6YHK3 1445 aa32.07■■■□□ 2.72
TSPAN3-210ENST00000561277 KDM6BO15054 1643 aa32.04■■■□□ 2.72
TSPAN3-210ENST00000561277 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.04■■■□□ 2.72
TSPAN3-210ENST00000561277 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.03■■■□□ 2.72
TSPAN3-210ENST00000561277 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.02■■■□□ 2.72
TSPAN3-210ENST00000561277 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.01■■■□□ 2.72
TSPAN3-210ENST00000561277 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.99■■■□□ 2.71
TSPAN3-210ENST00000561277 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPAN3-210ENST00000561277 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPAN3-210ENST00000561277 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
TSPAN3-210ENST00000561277 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.72e-7■■■■■ 47.7
TSPAN3-210ENST00000561277 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.88■■■□□ 2.69
TSPAN3-210ENST00000561277 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
TSPAN3-210ENST00000561277 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
TSPAN3-210ENST00000561277 KIF14Q15058 1648 aa31.82■■■□□ 2.68
TSPAN3-210ENST00000561277 NEO1Q92859 1461 aa31.73■■■□□ 2.67
TSPAN3-210ENST00000561277 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.72■■■□□ 2.67
TSPAN3-210ENST00000561277 FANCAO15360 1455 aa31.71■■■□□ 2.67
TSPAN3-210ENST00000561277 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.69■■■□□ 2.66
TSPAN3-210ENST00000561277 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.69■■■□□ 2.66
TSPAN3-210ENST00000561277 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.69■■■□□ 2.66
TSPAN3-210ENST00000561277 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.68■■■□□ 2.66
TSPAN3-210ENST00000561277 PLCH2O75038 1416 aa31.67■■■□□ 2.66
TSPAN3-210ENST00000561277 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.63■■■□□ 2.65
TSPAN3-210ENST00000561277 AKNAQ7Z591 1439 aa31.63■■■□□ 2.65
TSPAN3-210ENST00000561277 RAPGEF3O95398 923 aa31.59■■■□□ 2.65
TSPAN3-210ENST00000561277 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.59■■■□□ 2.65
TSPAN3-210ENST00000561277 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.56■■■□□ 2.64
TSPAN3-210ENST00000561277 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.56■■■□□ 2.64
TSPAN3-210ENST00000561277 PREX2Q70Z35 1606 aa31.55■■■□□ 2.64
TSPAN3-210ENST00000561277 TIAM1Q13009 1591 aa31.55■■■□□ 2.64
TSPAN3-210ENST00000561277 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.55■■■□□ 2.64
TSPAN3-210ENST00000561277 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms