RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561187.1

SNRPA1-215, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A', humanhuman

TSL 2

Gene SNRPA1, Length 509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1-215ENST00000561187 IGF1RP08069 1367 aa47.18■■■■■ 5.14
SNRPA1-215ENST00000561187 CUL7Q14999 1698 aa47.13■■■■■ 5.14
SNRPA1-215ENST00000561187 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.98■■■■■ 5.11
SNRPA1-215ENST00000561187 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.91■■■■■ 5.1
SNRPA1-215ENST00000561187 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.83■■■■■ 5.09
SNRPA1-215ENST00000561187 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.8■■■■■ 5.08
SNRPA1-215ENST00000561187 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.75■■■■■ 5.07
SNRPA1-215ENST00000561187 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.72■■■■■ 5.07
SNRPA1-215ENST00000561187 IQGAP2Q13576 1575 aa46.63■■■■■ 5.06
SNRPA1-215ENST00000561187 MAPKBP1O60336 1514 aa46.62■■■■■ 5.05
SNRPA1-215ENST00000561187 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.61■■■■■ 5.05
SNRPA1-215ENST00000561187 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.59■■■■■ 5.05
SNRPA1-215ENST00000561187 PTPRGP23470 1445 aa46.57■■■■■ 5.05
SNRPA1-215ENST00000561187 DIP2BQ9P265 1576 aa46.55■■■■■ 5.04
SNRPA1-215ENST00000561187 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.53■■■■■ 5.04
SNRPA1-215ENST00000561187 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.5■■■■■ 5.03
SNRPA1-215ENST00000561187 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.48■■■■■ 5.03
SNRPA1-215ENST00000561187 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
SNRPA1-215ENST00000561187 DISP1Q96F81 1524 aa46.38■■■■■ 5.02
SNRPA1-215ENST00000561187 TSPOAP1O95153 1857 aa46.31■■■■■ 5
SNRPA1-215ENST00000561187 ABCC2Q92887 1545 aa46.31■■■■■ 5
SNRPA1-215ENST00000561187 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.28■■■■■ 5
SNRPA1-215ENST00000561187 KIAA0556O60303 1618 aa46.23■■■■■ 4.99
SNRPA1-215ENST00000561187 UACAQ9BZF9 1416 aa46.21■■■■■ 4.99
SNRPA1-215ENST00000561187 ASXL2Q76L83 1435 aa46.18■■■■■ 4.98
SNRPA1-215ENST00000561187 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.17■■■■■ 4.98
SNRPA1-215ENST00000561187 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.17■■■■■ 4.98
SNRPA1-215ENST00000561187 KDM6BO15054 1643 aa46.14■■■■■ 4.98
SNRPA1-215ENST00000561187 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.07■■■■■ 4.97
SNRPA1-215ENST00000561187 PRXQ9BXM0 1461 aa46.02■■■■■ 4.96
SNRPA1-215ENST00000561187 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
SNRPA1-215ENST00000561187 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.99■■■■■ 4.95
SNRPA1-215ENST00000561187 GLI2P10070 1586 aa45.94■■■■■ 4.94
SNRPA1-215ENST00000561187 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
SNRPA1-215ENST00000561187 GOLGA3Q08378 1498 aa45.89■■■■■ 4.94
SNRPA1-215ENST00000561187 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
SNRPA1-215ENST00000561187 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.76■■■■■ 4.92
SNRPA1-215ENST00000561187 ABCA8O94911 1581 aa45.75■■■■■ 4.92
SNRPA1-215ENST00000561187 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.74■■■■■ 4.91
SNRPA1-215ENST00000561187 P3H3Q8IVL6 736 aa45.71■■■■■ 4.91
SNRPA1-215ENST00000561187 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.69■■■■■ 4.9
SNRPA1-215ENST00000561187 ARID3CA6NKF2 412 aa45.63■■■■■ 4.9
SNRPA1-215ENST00000561187 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.6■■■■■ 4.89
SNRPA1-215ENST00000561187 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
SNRPA1-215ENST00000561187 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.58■■■■■ 4.89
SNRPA1-215ENST00000561187 KCNH8Q96L42 1107 aa45.57■■■■■ 4.89
SNRPA1-215ENST00000561187 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
SNRPA1-215ENST00000561187 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
SNRPA1-215ENST00000561187 SAMD9Q5K651 1589 aa45.48■■■■■ 4.87
SNRPA1-215ENST00000561187 EEA1Q15075 1411 aa45.46■■■■■ 4.87
SNRPA1-215ENST00000561187 CD109Q6YHK3 1445 aa45.43■■■■■ 4.86
SNRPA1-215ENST00000561187 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.43■■■■■ 4.86
SNRPA1-215ENST00000561187 ATP10BO94823 1461 aa45.36■■■■■ 4.85
SNRPA1-215ENST00000561187 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.33■■■■■ 4.85
SNRPA1-215ENST00000561187 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.33■■■■■ 4.85
SNRPA1-215ENST00000561187 ADGRL1O94910 1474 aa45.31■■■■■ 4.84
SNRPA1-215ENST00000561187 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.29■■■■■ 4.84
SNRPA1-215ENST00000561187 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
SNRPA1-215ENST00000561187 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
SNRPA1-215ENST00000561187 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.22■■■■■ 4.83
SNRPA1-215ENST00000561187 KIF21BO75037 1637 aa45.19■■■■■ 4.83
SNRPA1-215ENST00000561187 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
SNRPA1-215ENST00000561187 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.1■■■■■ 4.81
SNRPA1-215ENST00000561187 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.01■■■■■ 4.8
SNRPA1-215ENST00000561187 CHIC1Q5VXU3 224 aa45■■■■■ 4.79
SNRPA1-215ENST00000561187 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.96■■■■■ 4.79
SNRPA1-215ENST00000561187 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
SNRPA1-215ENST00000561187 RAPGEF3O95398 923 aa44.83■■■■■ 4.77
SNRPA1-215ENST00000561187 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
SNRPA1-215ENST00000561187 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.82■■■■■ 4.77
SNRPA1-215ENST00000561187 NEO1Q92859 1461 aa44.82■■■■■ 4.77
SNRPA1-215ENST00000561187 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.78■■■■■ 4.76
SNRPA1-215ENST00000561187 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.74■■■■■ 4.75
SNRPA1-215ENST00000561187 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.73■■■■■ 4.75
SNRPA1-215ENST00000561187 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.72■■■■■ 4.75
SNRPA1-215ENST00000561187 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
SNRPA1-215ENST00000561187 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.7■■■■■ 4.75
SNRPA1-215ENST00000561187 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.67■■■■■ 4.74
SNRPA1-215ENST00000561187 HECW1Q76N89 1606 aa44.62■■■■■ 4.73
SNRPA1-215ENST00000561187 FANCAO15360 1455 aa44.62■■■■■ 4.73
SNRPA1-215ENST00000561187 FMN1Q68DA7 1419 aa44.6■■■■■ 4.73
SNRPA1-215ENST00000561187 AKNAQ7Z591 1439 aa44.58■■■■■ 4.73
SNRPA1-215ENST00000561187 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.56■■■■■ 4.72
SNRPA1-215ENST00000561187 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
SNRPA1-215ENST00000561187 RICTORQ6R327 1708 aa44.53■■■■■ 4.72
SNRPA1-215ENST00000561187 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.72
SNRPA1-215ENST00000561187 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.49■■■■■ 4.71
SNRPA1-215ENST00000561187 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.46■■■■■ 4.71
SNRPA1-215ENST00000561187 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.41■■■■■ 4.7
SNRPA1-215ENST00000561187 KIF14Q15058 1648 aa44.4■■■■■ 4.7
SNRPA1-215ENST00000561187 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.38■■■■■ 4.7
SNRPA1-215ENST00000561187 PTPRMP28827 1452 aa44.38■■■■■ 4.69
SNRPA1-215ENST00000561187 MADDQ8WXG6 1647 aa44.38■■■■■ 4.69
SNRPA1-215ENST00000561187 PLCH2O75038 1416 aa44.36■■■■■ 4.69
SNRPA1-215ENST00000561187 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.34■■■■■ 4.69
SNRPA1-215ENST00000561187 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.33■■■■■ 4.69
SNRPA1-215ENST00000561187 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.33■■■■■ 4.69
SNRPA1-215ENST00000561187 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.69
SNRPA1-215ENST00000561187 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.31■■■■■ 4.68
SNRPA1-215ENST00000561187 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.31■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms