RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560587.1

ZNF280D-215, Transcript of zinc finger protein 280D, human

TSL 1 (best)

Gene ZNF280D, Length 1,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF280D-215	ENST00000560587	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.15	■■■■■ 4.34
ZNF280D-215	ENST00000560587	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
ZNF280D-215	ENST00000560587	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.12	■■■■■ 4.33
ZNF280D-215	ENST00000560587	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.04	■■■■■ 4.32
ZNF280D-215	ENST00000560587	IQGAP2	Q13576	1575 aa		41.92	■■■■■ 4.3
ZNF280D-215	ENST00000560587	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.8	■■■■■ 4.28
ZNF280D-215	ENST00000560587	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.75	■■■■■ 4.27
ZNF280D-215	ENST00000560587	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		41.72	■■■■■ 4.27
ZNF280D-215	ENST00000560587	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.72	■■■■■ 4.27
ZNF280D-215	ENST00000560587	EEA1	Q15075	1411 aa		41.72	■■■■■ 4.27
ZNF280D-215	ENST00000560587	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.65	■■■■■ 4.26
ZNF280D-215	ENST00000560587	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.64	■■■■■ 4.26
ZNF280D-215	ENST00000560587	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.61	■■■■■ 4.25
ZNF280D-215	ENST00000560587	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.59	■■■■■ 4.25
ZNF280D-215	ENST00000560587	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.58	■■■■■ 4.25
ZNF280D-215	ENST00000560587	PTPRG	P23470	1445 aa		41.57	■■■■■ 4.25
ZNF280D-215	ENST00000560587	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		41.56	■■■■■ 4.24
ZNF280D-215	ENST00000560587	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.52	■■■■■ 4.24
ZNF280D-215	ENST00000560587	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.46	■■■■■ 4.23
ZNF280D-215	ENST00000560587	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.44	■■■■■ 4.23
ZNF280D-215	ENST00000560587	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.43	■■■■■ 4.22
ZNF280D-215	ENST00000560587	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.42	■■■■■ 4.22
ZNF280D-215	ENST00000560587	MAPKBP1	O60336	1514 aa		41.38	■■■■■ 4.21
ZNF280D-215	ENST00000560587	KIF21B	O75037	1637 aa		41.34	■■■■■ 4.21
ZNF280D-215	ENST00000560587	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.3	■■■■■ 4.2
ZNF280D-215	ENST00000560587	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.29	■■■■■ 4.2
ZNF280D-215	ENST00000560587	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.29	■■■■■ 4.2
ZNF280D-215	ENST00000560587	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.25	■■■■■ 4.19
ZNF280D-215	ENST00000560587	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.18	■■■■■ 4.18
ZNF280D-215	ENST00000560587	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.15	■■■■■ 4.18
ZNF280D-215	ENST00000560587	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.14	■■■■■ 4.18
ZNF280D-215	ENST00000560587	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.1	■■■■■ 4.17
ZNF280D-215	ENST00000560587	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.09	■■■■■ 4.17
ZNF280D-215	ENST00000560587	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.06	■■■■■ 4.16
ZNF280D-215	ENST00000560587	ABCA8	O94911	1581 aa		41.05	■■■■■ 4.16
ZNF280D-215	ENST00000560587	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.04	■■■■■ 4.16
ZNF280D-215	ENST00000560587	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.03	■■■■■ 4.16
ZNF280D-215	ENST00000560587	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.01	■■■■■ 4.16
ZNF280D-215	ENST00000560587	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.94	■■■■■ 4.14
ZNF280D-215	ENST00000560587	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.93	■■■■■ 4.14
ZNF280D-215	ENST00000560587	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.92	■■■■■ 4.14
ZNF280D-215	ENST00000560587	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.91	■■■■■ 4.14
ZNF280D-215	ENST00000560587	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.84	■■■■■ 4.13
ZNF280D-215	ENST00000560587	GLI2	P10070	1586 aa		40.84	■■■■■ 4.13
ZNF280D-215	ENST00000560587	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.81	■■■■■ 4.12
ZNF280D-215	ENST00000560587	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		40.8	■■■■■ 4.12
ZNF280D-215	ENST00000560587	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
ZNF280D-215	ENST00000560587	TSPOAP1	O95153	1857 aa		40.79	■■■■■ 4.12
ZNF280D-215	ENST00000560587	ATP10B	O94823	1461 aa		40.67	■■■■■ 4.1
ZNF280D-215	ENST00000560587	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		40.66	■■■■■ 4.1
ZNF280D-215	ENST00000560587	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.66	■■■■■ 4.1
ZNF280D-215	ENST00000560587	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
ZNF280D-215	ENST00000560587	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
ZNF280D-215	ENST00000560587	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.61	■■■■■ 4.09
ZNF280D-215	ENST00000560587	KDM6B	O15054	1643 aa		40.58	■■■■■ 4.09
ZNF280D-215	ENST00000560587	KCNH8	Q96L42	1107 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ZNF280D-215	ENST00000560587	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ZNF280D-215	ENST00000560587	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ZNF280D-215	ENST00000560587	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		40.5	■■■■■ 4.07
ZNF280D-215	ENST00000560587	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
ZNF280D-215	ENST00000560587	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
ZNF280D-215	ENST00000560587	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.42	■■■■■ 4.06
ZNF280D-215	ENST00000560587	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.39	■■■■■ 4.06
ZNF280D-215	ENST00000560587	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.38	■■■■■ 4.05
ZNF280D-215	ENST00000560587	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.36	■■■■■ 4.05
ZNF280D-215	ENST00000560587	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.05
ZNF280D-215	ENST00000560587	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.29	■■■■■ 4.04
ZNF280D-215	ENST00000560587	CLIP1	P30622	1438 aa		40.28	■■■■■ 4.04
ZNF280D-215	ENST00000560587	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
ZNF280D-215	ENST00000560587	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.22	■■■■■ 4.03
ZNF280D-215	ENST00000560587	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.18	■■■■■ 4.02
ZNF280D-215	ENST00000560587	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.15	■■■■■ 4.02
ZNF280D-215	ENST00000560587	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.13	■■■■■ 4.01
ZNF280D-215	ENST00000560587	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.1	■■■■■ 4.01
ZNF280D-215	ENST00000560587	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
ZNF280D-215	ENST00000560587	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.07	■■■■■ 4.01
ZNF280D-215	ENST00000560587	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.07	■■■■■ 4
ZNF280D-215	ENST00000560587	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.06	■■■■■ 4
ZNF280D-215	ENST00000560587	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.05	■■■■■ 4
ZNF280D-215	ENST00000560587	NEO1	Q92859	1461 aa		40.04	■■■■■ 4
ZNF280D-215	ENST00000560587	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.04	■■■■■ 4
ZNF280D-215	ENST00000560587	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.04	■■■■■ 4
ZNF280D-215	ENST00000560587	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	39.98	■■■■□ 3.99
ZNF280D-215	ENST00000560587	KIF14	Q15058	1648 aa		39.97	■■■■□ 3.99
ZNF280D-215	ENST00000560587	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		39.95	■■■■□ 3.99
ZNF280D-215	ENST00000560587	FANCA	O15360	1455 aa		39.91	■■■■□ 3.98
ZNF280D-215	ENST00000560587	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		39.88	■■■■□ 3.97
ZNF280D-215	ENST00000560587	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		39.87	■■■■□ 3.97
ZNF280D-215	ENST00000560587	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	39.87	■■■■□ 3.97
ZNF280D-215	ENST00000560587	PLCH2	O75038	1416 aa		39.84	■■■■□ 3.97
ZNF280D-215	ENST00000560587	AKNA	Q7Z591	1439 aa		39.83	■■■■□ 3.97
ZNF280D-215	ENST00000560587	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		39.79	■■■■□ 3.96
ZNF280D-215	ENST00000560587	RAPGEF3	O95398	923 aa		39.76	■■■■□ 3.96
ZNF280D-215	ENST00000560587	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	39.75	■■■■□ 3.95
ZNF280D-215	ENST00000560587	RICTOR	Q6R327	1708 aa		39.71	■■■■□ 3.95
ZNF280D-215	ENST00000560587	ADGRL1	O94910	1474 aa		39.7	■■■■□ 3.95
ZNF280D-215	ENST00000560587	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		39.68	■■■■□ 3.94
ZNF280D-215	ENST00000560587	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		39.67	■■■■□ 3.94
ZNF280D-215	ENST00000560587	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		39.66	■■■■□ 3.94
ZNF280D-215	ENST00000560587	PREX2	Q70Z35	1606 aa		39.65	■■■■□ 3.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms