RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.8■■□□□ 1.24
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RABGGTA-209ENST00000559551 ARAP1Q96P48 1450 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-209ENST00000559551 CHD1O14646 1710 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-209ENST00000559551 CEP170Q5SW79 1584 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-209ENST00000559551 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-209ENST00000559551 IQGAP2Q13576 1575 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-209ENST00000559551 NUP160Q12769 1436 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-209ENST00000559551 SAMD9Q5K651 1589 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-209ENST00000559551 FBLN2P98095 1184 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-209ENST00000559551 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-209ENST00000559551 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-209ENST00000559551 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-209ENST00000559551 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-209ENST00000559551 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-209ENST00000559551 P3H3Q8IVL6 736 aa22.58■■□□□ 1.2
RABGGTA-209ENST00000559551 DISP1Q96F81 1524 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-209ENST00000559551 KIAA0556O60303 1618 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-209ENST00000559551 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-209ENST00000559551 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-209ENST00000559551 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-209ENST00000559551 SHROOM2Q13796 1616 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-209ENST00000559551 JPH4Q96JJ6 628 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-209ENST00000559551 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-209ENST00000559551 FMN1Q68DA7 1419 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-209ENST00000559551 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-209ENST00000559551 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-209ENST00000559551 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-209ENST00000559551 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-209ENST00000559551 TIAM1Q13009 1591 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-209ENST00000559551 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-209ENST00000559551 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-209ENST00000559551 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-209ENST00000559551 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-209ENST00000559551 MAP3K1Q13233 1512 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-209ENST00000559551 APLP2Q06481 763 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-209ENST00000559551 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-209ENST00000559551 HECW1Q76N89 1606 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-209ENST00000559551 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCA8O94911 1581 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-209ENST00000559551 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-209ENST00000559551 OSCARQ8IYS5 282 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-209ENST00000559551 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-209ENST00000559551 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-209ENST00000559551 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-209ENST00000559551 PTPRGP23470 1445 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-209ENST00000559551 ARID3CA6NKF2 412 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-209ENST00000559551 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-209ENST00000559551 UACAQ9BZF9 1416 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-209ENST00000559551 ATP10BO94823 1461 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-209ENST00000559551 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-209ENST00000559551 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCC2Q92887 1545 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-209ENST00000559551 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGEF11O15085 1522 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-209ENST00000559551 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-209ENST00000559551 NCOA2Q15596 1464 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-209ENST00000559551 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-209ENST00000559551 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-209ENST00000559551 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-209ENST00000559551 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-209ENST00000559551 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF14Q15058 1648 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-209ENST00000559551 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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RABGGTA-209ENST00000559551 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-209ENST00000559551 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
RABGGTA-209ENST00000559551 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-209ENST00000559551 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-209ENST00000559551 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-209ENST00000559551 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-209ENST00000559551 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.83■■□□□ 1.08
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.79■■□□□ 1.08
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RABGGTA-209ENST00000559551 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-209ENST00000559551 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-209ENST00000559551 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-209ENST00000559551 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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RABGGTA-209ENST00000559551 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-209ENST00000559551 MIA2Q96PC5 1412 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-209ENST00000559551 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-209ENST00000559551 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-209ENST00000559551 ITGAEP38570 1179 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGGTA-209ENST00000559551 PTPRKQ15262 1439 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGGTA-209ENST00000559551 PREX2Q70Z35 1606 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGGTA-209ENST00000559551 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.64■■□□□ 1.06
RABGGTA-209ENST00000559551 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.64■■□□□ 1.05
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-209ENST00000559551 ASXL2Q76L83 1435 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-209ENST00000559551 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-209ENST00000559551 KCNH8Q96L42 1107 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-209ENST00000559551 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.6■■□□□ 1.05
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