RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558983.5

MEF2A-209, Transcript of myocyte enhancer factor 2A, human

TSL 3

Gene MEF2A, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEF2A-209	ENST00000558983	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.24	■■■■■ 4.51
MEF2A-209	ENST00000558983	JPH4	Q96JJ6	628 aa		43.23	■■■■■ 4.51
MEF2A-209	ENST00000558983	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.21	■■■■■ 4.51
MEF2A-209	ENST00000558983	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.18	■■■■■ 4.5
MEF2A-209	ENST00000558983	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.03	■■■■■ 4.48
MEF2A-209	ENST00000558983	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.95	■■■■■ 4.47
MEF2A-209	ENST00000558983	EEA1	Q15075	1411 aa		42.89	■■■■■ 4.46
MEF2A-209	ENST00000558983	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.89	■■■■■ 4.46
MEF2A-209	ENST00000558983	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.88	■■■■■ 4.45
MEF2A-209	ENST00000558983	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.84	■■■■■ 4.45
MEF2A-209	ENST00000558983	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.81	■■■■■ 4.44
MEF2A-209	ENST00000558983	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
MEF2A-209	ENST00000558983	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.75	■■■■■ 4.43
MEF2A-209	ENST00000558983	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.68	■■■■■ 4.42
MEF2A-209	ENST00000558983	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
MEF2A-209	ENST00000558983	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.66	■■■■■ 4.42
MEF2A-209	ENST00000558983	PTPRG	P23470	1445 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MEF2A-209	ENST00000558983	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.62	■■■■■ 4.41
MEF2A-209	ENST00000558983	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.61	■■■■■ 4.41
MEF2A-209	ENST00000558983	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.58	■■■■■ 4.41
MEF2A-209	ENST00000558983	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.51	■■■■■ 4.4
MEF2A-209	ENST00000558983	KIF21B	O75037	1637 aa		42.51	■■■■■ 4.4
MEF2A-209	ENST00000558983	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.49	■■■■■ 4.39
MEF2A-209	ENST00000558983	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.38	■■■■■ 4.37
MEF2A-209	ENST00000558983	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.37	■■■■■ 4.37
MEF2A-209	ENST00000558983	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.35	■■■■■ 4.37
MEF2A-209	ENST00000558983	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.33	■■■■■ 4.37
MEF2A-209	ENST00000558983	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.29	■■■■■ 4.36
MEF2A-209	ENST00000558983	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.26	■■■■■ 4.36
MEF2A-209	ENST00000558983	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MEF2A-209	ENST00000558983	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.17	■■■■■ 4.34
MEF2A-209	ENST00000558983	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.16	■■■■■ 4.34
MEF2A-209	ENST00000558983	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.15	■■■■■ 4.34
MEF2A-209	ENST00000558983	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.15	■■■■■ 4.34
MEF2A-209	ENST00000558983	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.15	■■■■■ 4.34
MEF2A-209	ENST00000558983	ABCA8	O94911	1581 aa		42.14	■■■■■ 4.34
MEF2A-209	ENST00000558983	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
MEF2A-209	ENST00000558983	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
MEF2A-209	ENST00000558983	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
MEF2A-209	ENST00000558983	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.09	■■■■■ 4.33
MEF2A-209	ENST00000558983	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.07	■■■■■ 4.33
MEF2A-209	ENST00000558983	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.04	■■■■■ 4.32
MEF2A-209	ENST00000558983	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.96	■■■■■ 4.31
MEF2A-209	ENST00000558983	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.91	■■■■■ 4.3
MEF2A-209	ENST00000558983	GLI2	P10070	1586 aa		41.87	■■■■■ 4.29
MEF2A-209	ENST00000558983	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.86	■■■■■ 4.29
MEF2A-209	ENST00000558983	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.84	■■■■■ 4.29
MEF2A-209	ENST00000558983	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.82	■■■■■ 4.29
MEF2A-209	ENST00000558983	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.76	■■■■■ 4.28
MEF2A-209	ENST00000558983	ATP10B	O94823	1461 aa		41.76	■■■■■ 4.28
MEF2A-209	ENST00000558983	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.74	■■■■■ 4.27
MEF2A-209	ENST00000558983	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.71	■■■■■ 4.27
MEF2A-209	ENST00000558983	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.69	■■■■■ 4.27
MEF2A-209	ENST00000558983	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
MEF2A-209	ENST00000558983	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.61	■■■■■ 4.25
MEF2A-209	ENST00000558983	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.6	■■■■■ 4.25
MEF2A-209	ENST00000558983	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.59	■■■■■ 4.25
MEF2A-209	ENST00000558983	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.59	■■■■■ 4.25
MEF2A-209	ENST00000558983	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.57	■■■■■ 4.25
MEF2A-209	ENST00000558983	KDM6B	O15054	1643 aa		41.56	■■■■■ 4.24
MEF2A-209	ENST00000558983	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.5	■■■■■ 4.23
MEF2A-209	ENST00000558983	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.5	■■■■■ 4.23
MEF2A-209	ENST00000558983	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.45	■■■■■ 4.23
MEF2A-209	ENST00000558983	CLIP1	P30622	1438 aa		41.44	■■■■■ 4.22
MEF2A-209	ENST00000558983	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.41	■■■■■ 4.22
MEF2A-209	ENST00000558983	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.4	■■■■■ 4.22
MEF2A-209	ENST00000558983	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.4	■■■■■ 4.22
MEF2A-209	ENST00000558983	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.39	■■■■■ 4.22
MEF2A-209	ENST00000558983	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.37	■■■■■ 4.21
MEF2A-209	ENST00000558983	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.3	■■■■■ 4.2
MEF2A-209	ENST00000558983	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.27	■■■■■ 4.2
MEF2A-209	ENST00000558983	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.26	■■■■■ 4.19
MEF2A-209	ENST00000558983	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.21	■■■■■ 4.19
MEF2A-209	ENST00000558983	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.2	■■■■■ 4.19
MEF2A-209	ENST00000558983	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.18	■■■■■ 4.18
MEF2A-209	ENST00000558983	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
MEF2A-209	ENST00000558983	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.16	■■■■■ 4.18
MEF2A-209	ENST00000558983	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.15	■■■■■ 4.18
MEF2A-209	ENST00000558983	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.13	■■■■■ 4.18
MEF2A-209	ENST00000558983	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.13	■■■■■ 4.17
MEF2A-209	ENST00000558983	NEO1	Q92859	1461 aa		41.07	■■■■■ 4.16
MEF2A-209	ENST00000558983	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.06	■■■■■ 4.16
MEF2A-209	ENST00000558983	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.06	■■■■■ 4.16
MEF2A-209	ENST00000558983	KIF14	Q15058	1648 aa		41.05	■■■■■ 4.16
MEF2A-209	ENST00000558983	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.04	■■■■■ 4.16
MEF2A-209	ENST00000558983	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41	■■■■■ 4.15
MEF2A-209	ENST00000558983	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.96	■■■■■ 4.15
MEF2A-209	ENST00000558983	FANCA	O15360	1455 aa		40.95	■■■■■ 4.15
MEF2A-209	ENST00000558983	PLCH2	O75038	1416 aa		40.89	■■■■■ 4.14
MEF2A-209	ENST00000558983	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.86	■■■■■ 4.13
MEF2A-209	ENST00000558983	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.79	■■■■■ 4.12
MEF2A-209	ENST00000558983	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.78	■■■■■ 4.12
MEF2A-209	ENST00000558983	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
MEF2A-209	ENST00000558983	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
MEF2A-209	ENST00000558983	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.76	■■■■■ 4.11
MEF2A-209	ENST00000558983	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.75	■■■■■ 4.11
MEF2A-209	ENST00000558983	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.73	■■■■■ 4.11
MEF2A-209	ENST00000558983	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.72	■■■■■ 4.11
MEF2A-209	ENST00000558983	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.72	■■■■■ 4.11
MEF2A-209	ENST00000558983	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.71	■■■■■ 4.11

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms