RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.98■■■■□ 3.19
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MFGE8-208ENST00000558773 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.86■■■■□ 3.17
MFGE8-208ENST00000558773 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.79■■■■□ 3.16
MFGE8-208ENST00000558773 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.6■■■■□ 3.13
MFGE8-208ENST00000558773 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.59■■■■□ 3.13
MFGE8-208ENST00000558773 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
MFGE8-208ENST00000558773 MAPKBP1O60336 1514 aa34.55■■■■□ 3.12
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MFGE8-208ENST00000558773 PTPRGP23470 1445 aa34.5■■■■□ 3.11
MFGE8-208ENST00000558773 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.5■■■■□ 3.11
MFGE8-208ENST00000558773 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.48■■■■□ 3.11
MFGE8-208ENST00000558773 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.48■■■■□ 3.11
MFGE8-208ENST00000558773 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.46■■■■□ 3.11
MFGE8-208ENST00000558773 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.45■■■■□ 3.11
MFGE8-208ENST00000558773 DIP2BQ9P265 1576 aa34.39■■■■□ 3.1
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MFGE8-208ENST00000558773 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
MFGE8-208ENST00000558773 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.33■■■■□ 3.09
MFGE8-208ENST00000558773 ABCC2Q92887 1545 aa34.3■■■■□ 3.08
MFGE8-208ENST00000558773 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.28■■■■□ 3.08
MFGE8-208ENST00000558773 UACAQ9BZF9 1416 aa34.25■■■■□ 3.07
MFGE8-208ENST00000558773 PRXQ9BXM0 1461 aa34.2■■■■□ 3.06
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MFGE8-208ENST00000558773 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.15■■■■□ 3.06
MFGE8-208ENST00000558773 ASXL2Q76L83 1435 aa34.15■■■■□ 3.06
MFGE8-208ENST00000558773 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.14■■■■□ 3.06
MFGE8-208ENST00000558773 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.12■■■■□ 3.05
MFGE8-208ENST00000558773 TSPOAP1O95153 1857 aa34.09■■■■□ 3.05
MFGE8-208ENST00000558773 GLI2P10070 1586 aa34.08■■■■□ 3.05
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MFGE8-208ENST00000558773 KDM6BO15054 1643 aa34.04■■■■□ 3.04
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MFGE8-208ENST00000558773 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.87■■■■□ 3.01
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MFGE8-208ENST00000558773 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
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MFGE8-208ENST00000558773 KCNH8Q96L42 1107 aa33.66■■■□□ 2.98
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MFGE8-208ENST00000558773 RAPGEF3O95398 923 aa33.14■■■□□ 2.9
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MFGE8-208ENST00000558773 HECW1Q76N89 1606 aa33■■■□□ 2.87
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MFGE8-208ENST00000558773 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.83■■■□□ 2.85
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MFGE8-208ENST00000558773 PTPRMP28827 1452 aa32.8■■■□□ 2.84
MFGE8-208ENST00000558773 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.8■■■□□ 2.84
MFGE8-208ENST00000558773 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
MFGE8-208ENST00000558773 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.79■■■□□ 2.84
MFGE8-208ENST00000558773 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.79■■■□□ 2.84
MFGE8-208ENST00000558773 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.79■■■□□ 2.84
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