RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557944.1

MFGE8-204, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 435 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-204ENST00000557944 GOLGA3Q08378 1498 aa32.29■■■□□ 2.76
MFGE8-204ENST00000557944 IQGAP2Q13576 1575 aa32.19■■■□□ 2.74
MFGE8-204ENST00000557944 JPH4Q96JJ6 628 aa32.18■■■□□ 2.74
MFGE8-204ENST00000557944 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
MFGE8-204ENST00000557944 SHROOM2Q13796 1616 aa32.15■■■□□ 2.74
MFGE8-204ENST00000557944 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.14■■■□□ 2.74
MFGE8-204ENST00000557944 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.1■■■□□ 2.73
MFGE8-204ENST00000557944 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
MFGE8-204ENST00000557944 ARHGEF11O15085 1522 aa32.06■■■□□ 2.72
MFGE8-204ENST00000557944 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.05■■■□□ 2.72
MFGE8-204ENST00000557944 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32■■■□□ 2.71
MFGE8-204ENST00000557944 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.97■■■□□ 2.71
MFGE8-204ENST00000557944 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
MFGE8-204ENST00000557944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
MFGE8-204ENST00000557944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
MFGE8-204ENST00000557944 DISP1Q96F81 1524 aa31.91■■■□□ 2.7
MFGE8-204ENST00000557944 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.91■■■□□ 2.7
MFGE8-204ENST00000557944 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.87■■■□□ 2.69
MFGE8-204ENST00000557944 KIAA0556O60303 1618 aa31.86■■■□□ 2.69
MFGE8-204ENST00000557944 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.84■■■□□ 2.69
MFGE8-204ENST00000557944 ARAP1Q96P48 1450 aa31.83■■■□□ 2.69
MFGE8-204ENST00000557944 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
MFGE8-204ENST00000557944 SAMD9Q5K651 1589 aa31.81■■■□□ 2.68
MFGE8-204ENST00000557944 PTPRGP23470 1445 aa31.78■■■□□ 2.68
MFGE8-204ENST00000557944 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.75■■■□□ 2.67
MFGE8-204ENST00000557944 P3H3Q8IVL6 736 aa31.71■■■□□ 2.67
MFGE8-204ENST00000557944 CLIP1P30622 1438 aa31.71■■■□□ 2.67
MFGE8-204ENST00000557944 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.69■■■□□ 2.66
MFGE8-204ENST00000557944 CEP162Q5TB80 1403 aa31.67■■■□□ 2.66
MFGE8-204ENST00000557944 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.65■■■□□ 2.66
MFGE8-204ENST00000557944 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
MFGE8-204ENST00000557944 UACAQ9BZF9 1416 aa31.58■■■□□ 2.65
MFGE8-204ENST00000557944 FMN1Q68DA7 1419 aa31.56■■■□□ 2.64
MFGE8-204ENST00000557944 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.53■■■□□ 2.64
MFGE8-204ENST00000557944 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.5■■■□□ 2.63
MFGE8-204ENST00000557944 ABCC2Q92887 1545 aa31.49■■■□□ 2.63
MFGE8-204ENST00000557944 ABCA8O94911 1581 aa31.48■■■□□ 2.63
MFGE8-204ENST00000557944 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.45■■■□□ 2.62
MFGE8-204ENST00000557944 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
MFGE8-204ENST00000557944 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.4■■■□□ 2.62
MFGE8-204ENST00000557944 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.35■■■□□ 2.61
MFGE8-204ENST00000557944 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.33■■■□□ 2.61
MFGE8-204ENST00000557944 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
MFGE8-204ENST00000557944 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.29■■■□□ 2.6
MFGE8-204ENST00000557944 HECW1Q76N89 1606 aa31.29■■■□□ 2.6
MFGE8-204ENST00000557944 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.28■■■□□ 2.6
MFGE8-204ENST00000557944 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
MFGE8-204ENST00000557944 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
MFGE8-204ENST00000557944 ATP10BO94823 1461 aa31.24■■■□□ 2.59
MFGE8-204ENST00000557944 MAPKBP1O60336 1514 aa31.23■■■□□ 2.59
MFGE8-204ENST00000557944 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
MFGE8-204ENST00000557944 ARID3CA6NKF2 412 aa31.19■■■□□ 2.58
MFGE8-204ENST00000557944 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
MFGE8-204ENST00000557944 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
MFGE8-204ENST00000557944 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
MFGE8-204ENST00000557944 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.17■■■□□ 2.58
MFGE8-204ENST00000557944 ASXL2Q76L83 1435 aa31.15■■■□□ 2.58
MFGE8-204ENST00000557944 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
MFGE8-204ENST00000557944 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
MFGE8-204ENST00000557944 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.09■■■□□ 2.57
MFGE8-204ENST00000557944 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.09■■■□□ 2.57
MFGE8-204ENST00000557944 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.01■■■□□ 2.56
MFGE8-204ENST00000557944 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.99■■■□□ 2.55
MFGE8-204ENST00000557944 APLP2Q06481 763 aa30.98■■■□□ 2.55
MFGE8-204ENST00000557944 MAP3K1Q13233 1512 aa30.98■■■□□ 2.55
MFGE8-204ENST00000557944 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
MFGE8-204ENST00000557944 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
MFGE8-204ENST00000557944 KCNH8Q96L42 1107 aa30.94■■■□□ 2.54
MFGE8-204ENST00000557944 DIP2BQ9P265 1576 aa30.93■■■□□ 2.54
MFGE8-204ENST00000557944 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.93■■■□□ 2.54
MFGE8-204ENST00000557944 TIAM1Q13009 1591 aa30.92■■■□□ 2.54
MFGE8-204ENST00000557944 GLI2P10070 1586 aa30.91■■■□□ 2.54
MFGE8-204ENST00000557944 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.9■■■□□ 2.54
MFGE8-204ENST00000557944 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.89■■■□□ 2.54
MFGE8-204ENST00000557944 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.84■■■□□ 2.53
MFGE8-204ENST00000557944 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.83■■■□□ 2.53
MFGE8-204ENST00000557944 KIF14Q15058 1648 aa30.81■■■□□ 2.52
MFGE8-204ENST00000557944 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.81■■■□□ 2.52
MFGE8-204ENST00000557944 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.79■■■□□ 2.52
MFGE8-204ENST00000557944 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.78■■■□□ 2.52
MFGE8-204ENST00000557944 CD109Q6YHK3 1445 aa30.75■■■□□ 2.51
MFGE8-204ENST00000557944 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.519e-7■■■□□ 17.5
MFGE8-204ENST00000557944 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.73■■■□□ 2.51
MFGE8-204ENST00000557944 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
MFGE8-204ENST00000557944 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.68■■■□□ 2.5
MFGE8-204ENST00000557944 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.65■■■□□ 2.5
MFGE8-204ENST00000557944 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
MFGE8-204ENST00000557944 PLCH2O75038 1416 aa30.64■■■□□ 2.49
MFGE8-204ENST00000557944 NCOA2Q15596 1464 aa30.63■■■□□ 2.49
MFGE8-204ENST00000557944 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.62■■■□□ 2.49
MFGE8-204ENST00000557944 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.62■■■□□ 2.49
MFGE8-204ENST00000557944 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.56■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.56■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.55■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 NEO1Q92859 1461 aa30.54■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 TSPOAP1O95153 1857 aa30.53■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 FANCAO15360 1455 aa30.53■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms