RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 FBLN2P98095 1184 aa28.01■■■□□ 2.07
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LGMN-216ENST00000557434 CLIP1P30622 1438 aa27.89■■■□□ 2.05
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LGMN-216ENST00000557434 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.56■■□□□ 1.84
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LGMN-216ENST00000557434 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.53■■□□□ 1.84
LGMN-216ENST00000557434 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
LGMN-216ENST00000557434 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
LGMN-216ENST00000557434 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
LGMN-216ENST00000557434 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
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