RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.41■■■■□ 3.58
CIPC-208ENST00000557115 CUL7Q14999 1698 aa37.41■■■■□ 3.58
CIPC-208ENST00000557115 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.36■■■■□ 3.57
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.34■■■■□ 3.57
CIPC-208ENST00000557115 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.16■■■■□ 3.54
CIPC-208ENST00000557115 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
CIPC-208ENST00000557115 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.02■■■■□ 3.52
CIPC-208ENST00000557115 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.02■■■■□ 3.52
CIPC-208ENST00000557115 PTPRGP23470 1445 aa37.01■■■■□ 3.51
CIPC-208ENST00000557115 IQGAP2Q13576 1575 aa37■■■■□ 3.51
CIPC-208ENST00000557115 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.96■■■■□ 3.51
CIPC-208ENST00000557115 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.93■■■■□ 3.5
CIPC-208ENST00000557115 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.92■■■■□ 3.5
CIPC-208ENST00000557115 MAPKBP1O60336 1514 aa36.87■■■■□ 3.49
CIPC-208ENST00000557115 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.85■■■■□ 3.49
CIPC-208ENST00000557115 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.82■■■■□ 3.49
CIPC-208ENST00000557115 DISP1Q96F81 1524 aa36.78■■■■□ 3.48
CIPC-208ENST00000557115 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.75■■■■□ 3.47
CIPC-208ENST00000557115 DIP2BQ9P265 1576 aa36.7■■■■□ 3.47
CIPC-208ENST00000557115 ABCC2Q92887 1545 aa36.7■■■■□ 3.47
CIPC-208ENST00000557115 UACAQ9BZF9 1416 aa36.69■■■■□ 3.46
CIPC-208ENST00000557115 PRXQ9BXM0 1461 aa36.66■■■■□ 3.46
CIPC-208ENST00000557115 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.64■■■■□ 3.46
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0556O60303 1618 aa36.63■■■■□ 3.45
CIPC-208ENST00000557115 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.59■■■■□ 3.45
CIPC-208ENST00000557115 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CIPC-208ENST00000557115 ASXL2Q76L83 1435 aa36.58■■■■□ 3.45
CIPC-208ENST00000557115 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.56■■■■□ 3.44
CIPC-208ENST00000557115 GOLGA3Q08378 1498 aa36.56■■■■□ 3.44
CIPC-208ENST00000557115 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.55■■■■□ 3.44
CIPC-208ENST00000557115 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.47■■■■□ 3.43
CIPC-208ENST00000557115 TSPOAP1O95153 1857 aa36.45■■■■□ 3.43
CIPC-208ENST00000557115 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CIPC-208ENST00000557115 EEA1Q15075 1411 aa36.4■■■■□ 3.42
CIPC-208ENST00000557115 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CIPC-208ENST00000557115 KDM6BO15054 1643 aa36.37■■■■□ 3.41
CIPC-208ENST00000557115 P3H3Q8IVL6 736 aa36.36■■■■□ 3.41
CIPC-208ENST00000557115 GLI2P10070 1586 aa36.36■■■■□ 3.41
CIPC-208ENST00000557115 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
CIPC-208ENST00000557115 ABCA8O94911 1581 aa36.27■■■■□ 3.4
CIPC-208ENST00000557115 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.25■■■■□ 3.39
CIPC-208ENST00000557115 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
CIPC-208ENST00000557115 KCNH8Q96L42 1107 aa36.2■■■■□ 3.39
CIPC-208ENST00000557115 ARID3CA6NKF2 412 aa36.18■■■■□ 3.38
CIPC-208ENST00000557115 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CIPC-208ENST00000557115 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.15■■■■□ 3.38
CIPC-208ENST00000557115 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.15■■■■□ 3.38
CIPC-208ENST00000557115 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.1■■■■□ 3.37
CIPC-208ENST00000557115 SAMD9Q5K651 1589 aa36.1■■■■□ 3.37
CIPC-208ENST00000557115 CD109Q6YHK3 1445 aa36.05■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 ATP10BO94823 1461 aa36.04■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.02■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 KIF21BO75037 1637 aa36.01■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
CIPC-208ENST00000557115 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.99■■■■□ 3.35
CIPC-208ENST00000557115 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.95■■■■□ 3.35
CIPC-208ENST00000557115 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CIPC-208ENST00000557115 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.94■■■■□ 3.34
CIPC-208ENST00000557115 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.93■■■■□ 3.34
CIPC-208ENST00000557115 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.92■■■■□ 3.34
CIPC-208ENST00000557115 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.85■■■■□ 3.33
CIPC-208ENST00000557115 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.77■■■■□ 3.32
CIPC-208ENST00000557115 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.72■■■■□ 3.31
CIPC-208ENST00000557115 ADGRL1O94910 1474 aa35.69■■■■□ 3.3
CIPC-208ENST00000557115 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
CIPC-208ENST00000557115 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.66■■■■□ 3.3
CIPC-208ENST00000557115 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.64■■■■□ 3.3
CIPC-208ENST00000557115 FMN1Q68DA7 1419 aa35.61■■■■□ 3.29
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.58■■■■□ 3.29
CIPC-208ENST00000557115 NEO1Q92859 1461 aa35.57■■■■□ 3.28
CIPC-208ENST00000557115 RAPGEF3O95398 923 aa35.55■■■■□ 3.28
CIPC-208ENST00000557115 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
CIPC-208ENST00000557115 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CIPC-208ENST00000557115 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.46■■■■□ 3.27
CIPC-208ENST00000557115 HECW1Q76N89 1606 aa35.46■■■■□ 3.27
CIPC-208ENST00000557115 FANCAO15360 1455 aa35.41■■■■□ 3.26
CIPC-208ENST00000557115 AKNAQ7Z591 1439 aa35.4■■■■□ 3.26
CIPC-208ENST00000557115 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.38■■■■□ 3.25
CIPC-208ENST00000557115 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
CIPC-208ENST00000557115 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.34■■■■□ 3.25
CIPC-208ENST00000557115 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.3■■■■□ 3.24
CIPC-208ENST00000557115 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
CIPC-208ENST00000557115 PLCH2O75038 1416 aa35.29■■■■□ 3.24
CIPC-208ENST00000557115 CLIP1P30622 1438 aa35.26■■■■□ 3.24
CIPC-208ENST00000557115 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CIPC-208ENST00000557115 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.23■■■■□ 3.23
CIPC-208ENST00000557115 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.22■■■■□ 3.23
CIPC-208ENST00000557115 KIF14Q15058 1648 aa35.2■■■■□ 3.23
CIPC-208ENST00000557115 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.19■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 RICTORQ6R327 1708 aa35.18■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.16■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.15■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.12■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.11■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.1■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.1■■■■□ 3.21
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