RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557061.5

PAPLN-210, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, human

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 3,709 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPLN-210	ENST00000557061	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PAPLN-210	ENST00000557061	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	JPH4	Q96JJ6	628 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PAPLN-210	ENST00000557061	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPLN-210	ENST00000557061	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPLN-210	ENST00000557061	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PAPLN-210	ENST00000557061	CLIP1	P30622	1438 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPLN-210	ENST00000557061	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PAPLN-210	ENST00000557061	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PAPLN-210	ENST00000557061	SYNJ2	O15056	1496 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PAPLN-210	ENST00000557061	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PAPLN-210	ENST00000557061	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PAPLN-210	ENST00000557061	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PAPLN-210	ENST00000557061	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PAPLN-210	ENST00000557061	GRIN2A	Q12879	1464 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PAPLN-210	ENST00000557061	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PAPLN-210	ENST00000557061	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	PTPRG	P23470	1445 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	PRX	Q9BXM0	1461 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	CUL7	Q14999	1698 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PAPLN-210	ENST00000557061	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	ITGAE	P38570	1179 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PAPLN-210	ENST00000557061	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PAPLN-210	ENST00000557061	KIF21B	O75037	1637 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPLN-210	ENST00000557061	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPLN-210	ENST00000557061	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPLN-210	ENST00000557061	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PAPLN-210	ENST00000557061	MIER1	Q8N108	512 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PAPLN-210	ENST00000557061	NUP160	Q12769	1436 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PAPLN-210	ENST00000557061	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PAPLN-210	ENST00000557061	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	CHD1	O14646	1710 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PAPLN-210	ENST00000557061	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	ARAP1	Q96P48	1450 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PAPLN-210	ENST00000557061	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	DISP1	Q96F81	1524 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PAPLN-210	ENST00000557061	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PAPLN-210	ENST00000557061	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	ATP10B	O94823	1461 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	MLEC	Q14165	292 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PAPLN-210	ENST00000557061	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29

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