RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556975.5

TMEM260-214, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM260, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-214ENST00000556975 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.02■■■■□ 3.84
TMEM260-214ENST00000556975 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
TMEM260-214ENST00000556975 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.97■■■■□ 3.83
TMEM260-214ENST00000556975 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.94■■■■□ 3.82
TMEM260-214ENST00000556975 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.66■■■■□ 3.78
TMEM260-214ENST00000556975 IQGAP2Q13576 1575 aa38.57■■■■□ 3.77
TMEM260-214ENST00000556975 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.53■■■■□ 3.76
TMEM260-214ENST00000556975 PTPRGP23470 1445 aa38.47■■■■□ 3.75
TMEM260-214ENST00000556975 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.47■■■■□ 3.75
TMEM260-214ENST00000556975 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.46■■■■□ 3.75
TMEM260-214ENST00000556975 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.45■■■■□ 3.75
TMEM260-214ENST00000556975 PRXQ9BXM0 1461 aa38.41■■■■□ 3.74
TMEM260-214ENST00000556975 DISP1Q96F81 1524 aa38.39■■■■□ 3.74
TMEM260-214ENST00000556975 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.39■■■■□ 3.74
TMEM260-214ENST00000556975 MAPKBP1O60336 1514 aa38.38■■■■□ 3.73
TMEM260-214ENST00000556975 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.33■■■■□ 3.73
TMEM260-214ENST00000556975 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.28■■■■□ 3.72
TMEM260-214ENST00000556975 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
TMEM260-214ENST00000556975 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.27■■■■□ 3.72
TMEM260-214ENST00000556975 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
TMEM260-214ENST00000556975 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.24■■■■□ 3.71
TMEM260-214ENST00000556975 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.22■■■■□ 3.71
TMEM260-214ENST00000556975 KIAA0556O60303 1618 aa38.22■■■■□ 3.71
TMEM260-214ENST00000556975 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.22■■■■□ 3.71
TMEM260-214ENST00000556975 UACAQ9BZF9 1416 aa38.21■■■■□ 3.71
TMEM260-214ENST00000556975 ABCC2Q92887 1545 aa38.2■■■■□ 3.71
TMEM260-214ENST00000556975 DIP2BQ9P265 1576 aa38.16■■■■□ 3.7
TMEM260-214ENST00000556975 EEA1Q15075 1411 aa38.16■■■■□ 3.7
TMEM260-214ENST00000556975 GOLGA3Q08378 1498 aa38.12■■■■□ 3.69
TMEM260-214ENST00000556975 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.03■■■■□ 3.68
TMEM260-214ENST00000556975 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.02■■■■□ 3.68
TMEM260-214ENST00000556975 ASXL2Q76L83 1435 aa38.01■■■■□ 3.68
TMEM260-214ENST00000556975 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.92■■■■□ 3.66
TMEM260-214ENST00000556975 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
TMEM260-214ENST00000556975 GLI2P10070 1586 aa37.89■■■■□ 3.66
TMEM260-214ENST00000556975 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.65
TMEM260-214ENST00000556975 ABCA8O94911 1581 aa37.88■■■■□ 3.65
TMEM260-214ENST00000556975 TSPOAP1O95153 1857 aa37.82■■■■□ 3.65
TMEM260-214ENST00000556975 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
TMEM260-214ENST00000556975 SAMD9Q5K651 1589 aa37.79■■■■□ 3.64
TMEM260-214ENST00000556975 KIF21BO75037 1637 aa37.77■■■■□ 3.64
TMEM260-214ENST00000556975 P3H3Q8IVL6 736 aa37.77■■■■□ 3.64
TMEM260-214ENST00000556975 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.71■■■■□ 3.63
TMEM260-214ENST00000556975 KDM6BO15054 1643 aa37.69■■■■□ 3.62
TMEM260-214ENST00000556975 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
TMEM260-214ENST00000556975 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.65■■■■□ 3.62
TMEM260-214ENST00000556975 ATP10BO94823 1461 aa37.58■■■■□ 3.61
TMEM260-214ENST00000556975 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
TMEM260-214ENST00000556975 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.53■■■■□ 3.6
TMEM260-214ENST00000556975 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.53■■■■□ 3.6
TMEM260-214ENST00000556975 KCNH8Q96L42 1107 aa37.52■■■■□ 3.6
TMEM260-214ENST00000556975 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.52■■■■□ 3.6
TMEM260-214ENST00000556975 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.51■■■■□ 3.59
TMEM260-214ENST00000556975 ARID3CA6NKF2 412 aa37.47■■■■□ 3.59
TMEM260-214ENST00000556975 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
TMEM260-214ENST00000556975 CD109Q6YHK3 1445 aa37.45■■■■□ 3.59
TMEM260-214ENST00000556975 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.45■■■■□ 3.59
TMEM260-214ENST00000556975 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.43■■■■□ 3.58
TMEM260-214ENST00000556975 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
TMEM260-214ENST00000556975 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
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TMEM260-214ENST00000556975 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
TMEM260-214ENST00000556975 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.31■■■■□ 3.56
TMEM260-214ENST00000556975 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.26■■■■□ 3.56
TMEM260-214ENST00000556975 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.24■■■■□ 3.55
TMEM260-214ENST00000556975 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.21■■■■□ 3.55
TMEM260-214ENST00000556975 FMN1Q68DA7 1419 aa37.19■■■■□ 3.54
TMEM260-214ENST00000556975 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.15■■■■□ 3.54
TMEM260-214ENST00000556975 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.13■■■■□ 3.53
TMEM260-214ENST00000556975 NEO1Q92859 1461 aa37.05■■■■□ 3.52
TMEM260-214ENST00000556975 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
TMEM260-214ENST00000556975 ADGRL1O94910 1474 aa37.04■■■■□ 3.52
TMEM260-214ENST00000556975 HECW1Q76N89 1606 aa37.03■■■■□ 3.52
TMEM260-214ENST00000556975 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.99■■■■□ 3.51
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TMEM260-214ENST00000556975 RAPGEF3O95398 923 aa36.88■■■■□ 3.49
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TMEM260-214ENST00000556975 AKNAQ7Z591 1439 aa36.84■■■■□ 3.49
TMEM260-214ENST00000556975 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.84■■■■□ 3.49
TMEM260-214ENST00000556975 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.82■■■■□ 3.48
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TMEM260-214ENST00000556975 PLCH2O75038 1416 aa36.8■■■■□ 3.48
TMEM260-214ENST00000556975 CLIP1P30622 1438 aa36.8■■■■□ 3.48
TMEM260-214ENST00000556975 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
TMEM260-214ENST00000556975 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.78■■■■□ 3.48
TMEM260-214ENST00000556975 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
TMEM260-214ENST00000556975 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
TMEM260-214ENST00000556975 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.74■■■■□ 3.47
TMEM260-214ENST00000556975 RICTORQ6R327 1708 aa36.7■■■■□ 3.47
TMEM260-214ENST00000556975 KIF14Q15058 1648 aa36.7■■■■□ 3.47
TMEM260-214ENST00000556975 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.69■■■■□ 3.46
TMEM260-214ENST00000556975 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.66■■■■□ 3.46
TMEM260-214ENST00000556975 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.66■■■■□ 3.46
TMEM260-214ENST00000556975 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.6■■■■□ 3.45
TMEM260-214ENST00000556975 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.59■■■■□ 3.45
TMEM260-214ENST00000556975 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.59■■■■□ 3.45
TMEM260-214ENST00000556975 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.56■■■■□ 3.44
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