RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556003.1

NRXN3-211, Transcript of neurexin 3, humanhuman

TSL 2

Gene NRXN3, Length 750 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-211ENST00000556003 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
NRXN3-211ENST00000556003 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.16■□□□□ 0.02
NRXN3-211ENST00000556003 CHD1O14646 1710 aa15.16■□□□□ 0.02
NRXN3-211ENST00000556003 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.16■□□□□ 0.02
NRXN3-211ENST00000556003 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NRXN3-211ENST00000556003 FBLN2P98095 1184 aa15.14■□□□□ 0.01
NRXN3-211ENST00000556003 ARAP1Q96P48 1450 aa15.14■□□□□ 0.01
NRXN3-211ENST00000556003 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.13■□□□□ 0.01
NRXN3-211ENST00000556003 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
NRXN3-211ENST00000556003 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.12■□□□□ 0.01
NRXN3-211ENST00000556003 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.09■□□□□ 0.01
NRXN3-211ENST00000556003 SYNJ2O15056 1496 aa15.06■□□□□ 0
NRXN3-211ENST00000556003 SAMD9Q5K651 1589 aa15.06■□□□□ 0
NRXN3-211ENST00000556003 GRIN2AQ12879 1464 aa15.05■□□□□ -0
NRXN3-211ENST00000556003 IQGAP2Q13576 1575 aa15.02■□□□□ -0
NRXN3-211ENST00000556003 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.99□□□□□ -0.01
NRXN3-211ENST00000556003 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.99□□□□□ -0.01
NRXN3-211ENST00000556003 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NRXN3-211ENST00000556003 MAP3K1Q13233 1512 aa14.97□□□□□ -0.01
NRXN3-211ENST00000556003 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NRXN3-211ENST00000556003 NUP160Q12769 1436 aa14.97□□□□□ -0.01
NRXN3-211ENST00000556003 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.95□□□□□ -0.02
NRXN3-211ENST00000556003 FMN1Q68DA7 1419 aa14.94□□□□□ -0.02
NRXN3-211ENST00000556003 CEP170Q5SW79 1584 aa14.94□□□□□ -0.02
NRXN3-211ENST00000556003 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NRXN3-211ENST00000556003 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NRXN3-211ENST00000556003 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.91□□□□□ -0.02
NRXN3-211ENST00000556003 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.91□□□□□ -0.02
NRXN3-211ENST00000556003 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.9□□□□□ -0.02
NRXN3-211ENST00000556003 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.89□□□□□ -0.03
NRXN3-211ENST00000556003 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NRXN3-211ENST00000556003 KIAA0556O60303 1618 aa14.88□□□□□ -0.03
NRXN3-211ENST00000556003 TIAM1Q13009 1591 aa14.88□□□□□ -0.03
NRXN3-211ENST00000556003 DISP1Q96F81 1524 aa14.86□□□□□ -0.03
NRXN3-211ENST00000556003 APLP2Q06481 763 aa14.85□□□□□ -0.03
NRXN3-211ENST00000556003 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.85□□□□□ -0.03
NRXN3-211ENST00000556003 HECW1Q76N89 1606 aa14.81□□□□□ -0.04
NRXN3-211ENST00000556003 SHROOM2Q13796 1616 aa14.79□□□□□ -0.04
NRXN3-211ENST00000556003 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.79□□□□□ -0.04
NRXN3-211ENST00000556003 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.79□□□□□ -0.04
NRXN3-211ENST00000556003 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.77□□□□□ -0.04
NRXN3-211ENST00000556003 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NRXN3-211ENST00000556003 P3H3Q8IVL6 736 aa14.74□□□□□ -0.05
NRXN3-211ENST00000556003 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.74□□□□□ -0.05
NRXN3-211ENST00000556003 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NRXN3-211ENST00000556003 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.72□□□□□ -0.05
NRXN3-211ENST00000556003 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.72□□□□□ -0.05
NRXN3-211ENST00000556003 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NRXN3-211ENST00000556003 JPH4Q96JJ6 628 aa14.7□□□□□ -0.06
NRXN3-211ENST00000556003 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NRXN3-211ENST00000556003 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NRXN3-211ENST00000556003 ABCA8O94911 1581 aa14.67□□□□□ -0.06
NRXN3-211ENST00000556003 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NRXN3-211ENST00000556003 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.63□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.62□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.62□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.61□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.61□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.6□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 NCOA2Q15596 1464 aa14.59□□□□□ -0.07
NRXN3-211ENST00000556003 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.57□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.57□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 PTPRGP23470 1445 aa14.57□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.56□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.55□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 HRCP23327 699 aa14.54□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 ABCC2Q92887 1545 aa14.54□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.53□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 UACAQ9BZF9 1416 aa14.52□□□□□ -0.08
NRXN3-211ENST00000556003 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NRXN3-211ENST00000556003 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NRXN3-211ENST00000556003 MIA2Q96PC5 1412 aa14.5□□□□□ -0.09
NRXN3-211ENST00000556003 ATP10BO94823 1461 aa14.5□□□□□ -0.09
NRXN3-211ENST00000556003 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.47□□□□□ -0.09
NRXN3-211ENST00000556003 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.47□□□□□ -0.09
NRXN3-211ENST00000556003 KIF14Q15058 1648 aa14.47□□□□□ -0.09
NRXN3-211ENST00000556003 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.47□□□□□ -0.09
NRXN3-211ENST00000556003 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.45□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.43□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 TSPOAP1O95153 1857 aa14.42□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 MAPKBP1O60336 1514 aa14.41□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 KDM6BO15054 1643 aa14.4□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 AKNAQ7Z591 1439 aa14.4□□□□□ -0.1
NRXN3-211ENST00000556003 DIP2BQ9P265 1576 aa14.39□□□□□ -0.11
NRXN3-211ENST00000556003 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NRXN3-211ENST00000556003 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.37□□□□□ -0.11
NRXN3-211ENST00000556003 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
NRXN3-211ENST00000556003 ARID3CA6NKF2 412 aa14.36□□□□□ -0.11
NRXN3-211ENST00000556003 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NRXN3-211ENST00000556003 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms