RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
PRKCH-216ENST00000555542 JPH4Q96JJ6 628 aa41.99■■■■■ 4.31
PRKCH-216ENST00000555542 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.9■■■■■ 4.3
PRKCH-216ENST00000555542 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.85■■■■■ 4.29
PRKCH-216ENST00000555542 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.6■■■■■ 4.25
PRKCH-216ENST00000555542 IQGAP2Q13576 1575 aa41.57■■■■■ 4.25
PRKCH-216ENST00000555542 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
PRKCH-216ENST00000555542 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.49■■■■■ 4.23
PRKCH-216ENST00000555542 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
PRKCH-216ENST00000555542 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.44■■■■■ 4.22
PRKCH-216ENST00000555542 PTPRGP23470 1445 aa41.41■■■■■ 4.22
PRKCH-216ENST00000555542 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.37■■■■■ 4.21
PRKCH-216ENST00000555542 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.3■■■■■ 4.2
PRKCH-216ENST00000555542 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.29■■■■■ 4.2
PRKCH-216ENST00000555542 MAPKBP1O60336 1514 aa41.28■■■■■ 4.2
PRKCH-216ENST00000555542 DISP1Q96F81 1524 aa41.27■■■■■ 4.2
PRKCH-216ENST00000555542 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.27■■■■■ 4.2
PRKCH-216ENST00000555542 PRXQ9BXM0 1461 aa41.23■■■■■ 4.19
PRKCH-216ENST00000555542 KIAA0556O60303 1618 aa41.18■■■■■ 4.18
PRKCH-216ENST00000555542 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.17■■■■■ 4.18
PRKCH-216ENST00000555542 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.17■■■■■ 4.18
PRKCH-216ENST00000555542 ABCC2Q92887 1545 aa41.11■■■■■ 4.17
PRKCH-216ENST00000555542 DIP2BQ9P265 1576 aa41.11■■■■■ 4.17
PRKCH-216ENST00000555542 UACAQ9BZF9 1416 aa41.1■■■■■ 4.17
PRKCH-216ENST00000555542 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.09■■■■■ 4.17
PRKCH-216ENST00000555542 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.05■■■■■ 4.16
PRKCH-216ENST00000555542 GOLGA3Q08378 1498 aa41.05■■■■■ 4.16
PRKCH-216ENST00000555542 EEA1Q15075 1411 aa41.01■■■■■ 4.16
PRKCH-216ENST00000555542 ASXL2Q76L83 1435 aa40.93■■■■■ 4.14
PRKCH-216ENST00000555542 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
PRKCH-216ENST00000555542 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.9■■■■■ 4.14
PRKCH-216ENST00000555542 TSPOAP1O95153 1857 aa40.89■■■■■ 4.14
PRKCH-216ENST00000555542 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.87■■■■■ 4.13
PRKCH-216ENST00000555542 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
PRKCH-216ENST00000555542 P3H3Q8IVL6 736 aa40.75■■■■■ 4.11
PRKCH-216ENST00000555542 ABCA8O94911 1581 aa40.74■■■■■ 4.11
PRKCH-216ENST00000555542 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.73■■■■■ 4.11
PRKCH-216ENST00000555542 GLI2P10070 1586 aa40.73■■■■■ 4.11
PRKCH-216ENST00000555542 KDM6BO15054 1643 aa40.69■■■■■ 4.1
PRKCH-216ENST00000555542 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
PRKCH-216ENST00000555542 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PRKCH-216ENST00000555542 KIF21BO75037 1637 aa40.66■■■■■ 4.1
PRKCH-216ENST00000555542 SAMD9Q5K651 1589 aa40.65■■■■■ 4.1
PRKCH-216ENST00000555542 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.62■■■■■ 4.09
PRKCH-216ENST00000555542 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
PRKCH-216ENST00000555542 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PRKCH-216ENST00000555542 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.55■■■■■ 4.08
PRKCH-216ENST00000555542 ARID3CA6NKF2 412 aa40.52■■■■■ 4.08
PRKCH-216ENST00000555542 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.5■■■■■ 4.07
PRKCH-216ENST00000555542 KCNH8Q96L42 1107 aa40.46■■■■■ 4.07
PRKCH-216ENST00000555542 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.45■■■■■ 4.07
PRKCH-216ENST00000555542 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.45■■■■■ 4.07
PRKCH-216ENST00000555542 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.43■■■■■ 4.06
PRKCH-216ENST00000555542 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
PRKCH-216ENST00000555542 ATP10BO94823 1461 aa40.39■■■■■ 4.06
PRKCH-216ENST00000555542 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.38■■■■■ 4.06
PRKCH-216ENST00000555542 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.36■■■■■ 4.05
PRKCH-216ENST00000555542 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
PRKCH-216ENST00000555542 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
PRKCH-216ENST00000555542 CD109Q6YHK3 1445 aa40.33■■■■■ 4.05
PRKCH-216ENST00000555542 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
PRKCH-216ENST00000555542 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.23■■■■■ 4.03
PRKCH-216ENST00000555542 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
PRKCH-216ENST00000555542 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.11■■■■■ 4.01
PRKCH-216ENST00000555542 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.05■■■■■ 4
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.05■■■■■ 4
PRKCH-216ENST00000555542 FMN1Q68DA7 1419 aa40.03■■■■■ 4
PRKCH-216ENST00000555542 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
PRKCH-216ENST00000555542 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.96■■■■□ 3.99
PRKCH-216ENST00000555542 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
PRKCH-216ENST00000555542 HECW1Q76N89 1606 aa39.94■■■■□ 3.99
PRKCH-216ENST00000555542 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.9■■■■□ 3.98
PRKCH-216ENST00000555542 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.88■■■■□ 3.97
PRKCH-216ENST00000555542 NEO1Q92859 1461 aa39.85■■■■□ 3.97
PRKCH-216ENST00000555542 ADGRL1O94910 1474 aa39.84■■■■□ 3.97
PRKCH-216ENST00000555542 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.81■■■■□ 3.96
PRKCH-216ENST00000555542 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.76■■■■□ 3.96
PRKCH-216ENST00000555542 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
PRKCH-216ENST00000555542 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.72■■■■□ 3.95
PRKCH-216ENST00000555542 RAPGEF3O95398 923 aa39.71■■■■□ 3.95
PRKCH-216ENST00000555542 FANCAO15360 1455 aa39.7■■■■□ 3.95
PRKCH-216ENST00000555542 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.65■■■■□ 3.94
PRKCH-216ENST00000555542 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
PRKCH-216ENST00000555542 CLIP1P30622 1438 aa39.65■■■■□ 3.94
PRKCH-216ENST00000555542 AKNAQ7Z591 1439 aa39.64■■■■□ 3.94
PRKCH-216ENST00000555542 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.61■■■■□ 3.93
PRKCH-216ENST00000555542 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.61■■■■□ 3.93
PRKCH-216ENST00000555542 KIF14Q15058 1648 aa39.61■■■■□ 3.93
PRKCH-216ENST00000555542 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
PRKCH-216ENST00000555542 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PRKCH-216ENST00000555542 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.57■■■■□ 3.92
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.56■■■■□ 3.92
PRKCH-216ENST00000555542 PLCH2O75038 1416 aa39.55■■■■□ 3.92
PRKCH-216ENST00000555542 RICTORQ6R327 1708 aa39.53■■■■□ 3.92
PRKCH-216ENST00000555542 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.5■■■■□ 3.91
PRKCH-216ENST00000555542 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.44■■■■□ 3.9
PRKCH-216ENST00000555542 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.41■■■■□ 3.9
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.41■■■■□ 3.9
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.41■■■■□ 3.9
PRKCH-216ENST00000555542 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms