RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555117.1

COCH-208, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 2

Gene COCH, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-208ENST00000555117 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
COCH-208ENST00000555117 JPH4Q96JJ6 628 aa38.42■■■■□ 3.74
COCH-208ENST00000555117 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.29■■■■□ 3.72
COCH-208ENST00000555117 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.24■■■■□ 3.71
COCH-208ENST00000555117 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.03■■■■□ 3.68
COCH-208ENST00000555117 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.03■■■■□ 3.68
COCH-208ENST00000555117 IQGAP2Q13576 1575 aa38.02■■■■□ 3.68
COCH-208ENST00000555117 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.96■■■■□ 3.67
COCH-208ENST00000555117 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.92■■■■□ 3.66
COCH-208ENST00000555117 MAPKBP1O60336 1514 aa37.92■■■■□ 3.66
COCH-208ENST00000555117 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.9■■■■□ 3.66
COCH-208ENST00000555117 PTPRGP23470 1445 aa37.87■■■■□ 3.65
COCH-208ENST00000555117 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.83■■■■□ 3.65
COCH-208ENST00000555117 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.82■■■■□ 3.64
COCH-208ENST00000555117 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
COCH-208ENST00000555117 DIP2BQ9P265 1576 aa37.79■■■■□ 3.64
COCH-208ENST00000555117 DISP1Q96F81 1524 aa37.78■■■■□ 3.64
COCH-208ENST00000555117 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.76■■■■□ 3.63
COCH-208ENST00000555117 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.76■■■■□ 3.63
COCH-208ENST00000555117 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.74■■■■□ 3.63
COCH-208ENST00000555117 KIAA0556O60303 1618 aa37.68■■■■□ 3.62
COCH-208ENST00000555117 ABCC2Q92887 1545 aa37.66■■■■□ 3.62
COCH-208ENST00000555117 PRXQ9BXM0 1461 aa37.63■■■■□ 3.61
COCH-208ENST00000555117 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.62■■■■□ 3.61
COCH-208ENST00000555117 UACAQ9BZF9 1416 aa37.61■■■■□ 3.61
COCH-208ENST00000555117 TSPOAP1O95153 1857 aa37.56■■■■□ 3.6
COCH-208ENST00000555117 ASXL2Q76L83 1435 aa37.5■■■■□ 3.59
COCH-208ENST00000555117 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.47■■■■□ 3.59
COCH-208ENST00000555117 GOLGA3Q08378 1498 aa37.46■■■■□ 3.59
COCH-208ENST00000555117 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.46■■■■□ 3.59
COCH-208ENST00000555117 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
COCH-208ENST00000555117 GLI2P10070 1586 aa37.4■■■■□ 3.58
COCH-208ENST00000555117 KDM6BO15054 1643 aa37.39■■■■□ 3.58
COCH-208ENST00000555117 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.36■■■■□ 3.57
COCH-208ENST00000555117 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
COCH-208ENST00000555117 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.57
COCH-208ENST00000555117 ABCA8O94911 1581 aa37.29■■■■□ 3.56
COCH-208ENST00000555117 EEA1Q15075 1411 aa37.29■■■■□ 3.56
COCH-208ENST00000555117 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
COCH-208ENST00000555117 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.24■■■■□ 3.55
COCH-208ENST00000555117 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.19■■■■□ 3.54
COCH-208ENST00000555117 SAMD9Q5K651 1589 aa37.17■■■■□ 3.54
COCH-208ENST00000555117 P3H3Q8IVL6 736 aa37.13■■■■□ 3.53
COCH-208ENST00000555117 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.1■■■■□ 3.53
COCH-208ENST00000555117 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
COCH-208ENST00000555117 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.07■■■■□ 3.52
COCH-208ENST00000555117 KIF21BO75037 1637 aa37.04■■■■□ 3.52
COCH-208ENST00000555117 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.02■■■■□ 3.52
COCH-208ENST00000555117 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.98■■■■□ 3.51
COCH-208ENST00000555117 KCNH8Q96L42 1107 aa36.96■■■■□ 3.51
COCH-208ENST00000555117 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
COCH-208ENST00000555117 ATP10BO94823 1461 aa36.94■■■■□ 3.5
COCH-208ENST00000555117 ARID3CA6NKF2 412 aa36.94■■■■□ 3.5
COCH-208ENST00000555117 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
COCH-208ENST00000555117 CD109Q6YHK3 1445 aa36.92■■■■□ 3.5
COCH-208ENST00000555117 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.9■■■■□ 3.5
COCH-208ENST00000555117 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.88■■■■□ 3.49
COCH-208ENST00000555117 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.84■■■■□ 3.49
COCH-208ENST00000555117 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.8■■■■□ 3.48
COCH-208ENST00000555117 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
COCH-208ENST00000555117 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.76■■■■□ 3.48
COCH-208ENST00000555117 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
COCH-208ENST00000555117 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
COCH-208ENST00000555117 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.71■■■■□ 3.47
COCH-208ENST00000555117 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
COCH-208ENST00000555117 ADGRL1O94910 1474 aa36.64■■■■□ 3.46
COCH-208ENST00000555117 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.59■■■■□ 3.45
COCH-208ENST00000555117 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.52■■■■□ 3.44
COCH-208ENST00000555117 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.52■■■■□ 3.44
COCH-208ENST00000555117 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.52■■■■□ 3.44
COCH-208ENST00000555117 NEO1Q92859 1461 aa36.5■■■■□ 3.43
COCH-208ENST00000555117 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
COCH-208ENST00000555117 FMN1Q68DA7 1419 aa36.46■■■■□ 3.43
COCH-208ENST00000555117 HECW1Q76N89 1606 aa36.45■■■■□ 3.42
COCH-208ENST00000555117 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.426e-7■■□□□ 11.4
COCH-208ENST00000555117 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.4■■■■□ 3.42
COCH-208ENST00000555117 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.36■■■■□ 3.41
COCH-208ENST00000555117 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.36■■■■□ 3.41
COCH-208ENST00000555117 RAPGEF3O95398 923 aa36.35■■■■□ 3.41
COCH-208ENST00000555117 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
COCH-208ENST00000555117 FANCAO15360 1455 aa36.31■■■■□ 3.4
COCH-208ENST00000555117 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.28■■■■□ 3.4
COCH-208ENST00000555117 RICTORQ6R327 1708 aa36.28■■■■□ 3.4
COCH-208ENST00000555117 AKNAQ7Z591 1439 aa36.27■■■■□ 3.4
COCH-208ENST00000555117 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
COCH-208ENST00000555117 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.2■■■■□ 3.38
COCH-208ENST00000555117 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
COCH-208ENST00000555117 KIF14Q15058 1648 aa36.18■■■■□ 3.38
COCH-208ENST00000555117 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
COCH-208ENST00000555117 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.16■■■■□ 3.38
COCH-208ENST00000555117 PLCH2O75038 1416 aa36.16■■■■□ 3.38
COCH-208ENST00000555117 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
COCH-208ENST00000555117 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.11■■■■□ 3.37
COCH-208ENST00000555117 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.1■■■■□ 3.37
COCH-208ENST00000555117 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.09■■■■□ 3.37
COCH-208ENST00000555117 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.09■■■■□ 3.37
COCH-208ENST00000555117 CLIP1P30622 1438 aa36.08■■■■□ 3.37
COCH-208ENST00000555117 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.08■■■■□ 3.37
COCH-208ENST00000555117 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.06■■■■□ 3.36
COCH-208ENST00000555117 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.03■■■■□ 3.36
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