RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHROOM2Q13796 1616 aa21.58■■□□□ 1.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRXQ9BXM0 1461 aa21.56■■□□□ 1.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARAP1Q96P48 1450 aa21.55■■□□□ 1.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.51■■□□□ 1.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.5■■□□□ 1.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.5■■□□□ 1.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IQGAP2Q13576 1575 aa21.46■■□□□ 1.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIF21BO75037 1637 aa21.45■■□□□ 1.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.41■■□□□ 1.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.39■■□□□ 1.01
SRP54-AS1-202ENST00000555015 JPH4Q96JJ6 628 aa21.39■■□□□ 1.01
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.34■■□□□ 1.01
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GOLGA3Q08378 1498 aa21.28■■□□□ 1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.27■■□□□ 1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DISP1Q96F81 1524 aa21.26■□□□□ 0.99
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA0556O60303 1618 aa21.26■□□□□ 0.99
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.18■□□□□ 0.98
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTPRGP23470 1445 aa21.13■□□□□ 0.97
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.11■□□□□ 0.97
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.11■□□□□ 0.97
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.09■□□□□ 0.97
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCC2Q92887 1545 aa21.04■□□□□ 0.96
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.03■□□□□ 0.96
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UACAQ9BZF9 1416 aa21.02■□□□□ 0.96
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.01■□□□□ 0.95
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCA8O94911 1581 aa21■□□□□ 0.95
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.97■□□□□ 0.95
SRP54-AS1-202ENST00000555015 P3H3Q8IVL6 736 aa20.97■□□□□ 0.95
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.96■□□□□ 0.95
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.96■□□□□ 0.95
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAPKBP1O60336 1514 aa20.95■□□□□ 0.94
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.93■□□□□ 0.94
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.93■□□□□ 0.94
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLIP1P30622 1438 aa20.87■□□□□ 0.93
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FMN1Q68DA7 1419 aa20.87■□□□□ 0.93
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEP162Q5TB80 1403 aa20.82■□□□□ 0.92
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 HECW1Q76N89 1606 aa20.81■□□□□ 0.92
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ASXL2Q76L83 1435 aa20.8■□□□□ 0.92
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.75■□□□□ 0.91
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.73■□□□□ 0.91
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPOAP1O95153 1857 aa20.69■□□□□ 0.9
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARID3CA6NKF2 412 aa20.68■□□□□ 0.9
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.67■□□□□ 0.9
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.66■□□□□ 0.9
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.65■□□□□ 0.9
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.64■□□□□ 0.9
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.6■□□□□ 0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.58■□□□□ 0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.56■□□□□ 0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNH8Q96L42 1107 aa20.55■□□□□ 0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIF14Q15058 1648 aa20.53■□□□□ 0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.51■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KDM6BO15054 1643 aa20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD109Q6YHK3 1445 aa20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.46■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TIAM1Q13009 1591 aa20.46■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAP3K1Q13233 1512 aa20.43■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.43■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.42■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.39■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.38■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NEO1Q92859 1461 aa20.37■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.37■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PREX2Q70Z35 1606 aa20.37■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.36■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLCH2O75038 1416 aa20.35■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.34■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FANCAO15360 1455 aa20.33■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.33■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.31■□□□□ 0.84
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