RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554360.5

PSMA3-AS1-204, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMA3-AS1, Length 2,475 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ADAMTS12P58397 1594 aa15.38■□□□□ 0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.35■□□□□ 0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.33■□□□□ 0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CEP162Q5TB80 1403 aa15.33■□□□□ 0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.32■□□□□ 0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SYNJ2O15056 1496 aa15.26■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CLIP1P30622 1438 aa15.25■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GRIN2AQ12879 1464 aa15.24■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ARXQ96QS3 562 aa15.23■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CHD1O14646 1710 aa15.18■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 IQGAP2Q13576 1575 aa15.17■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.17■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FBLN2P98095 1184 aa15.15■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CEP170Q5SW79 1584 aa15.15■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.14■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.14■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 NUP160Q12769 1436 aa15.13■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ARAP1Q96P48 1450 aa15.11■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SAMD9Q5K651 1589 aa15.11■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.1■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.08■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.02■□□□□ -0
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KIAA0556O60303 1618 aa15.02□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 P3H3Q8IVL6 736 aa15□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FMN1Q68DA7 1419 aa15□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 DISP1Q96F81 1524 aa14.99□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SHROOM2Q13796 1616 aa14.98□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.98□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.98□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 JPH4Q96JJ6 628 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.92□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MAP3K1Q13233 1512 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 HECW1Q76N89 1606 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TIAM1Q13009 1591 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 OSCARQ8IYS5 282 aa14.87□□□□□ -0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.86□□□□□ -0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.85□□□□□ -0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.84□□□□□ -0.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.82□□□□□ -0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PTPRGP23470 1445 aa14.8□□□□□ -0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ABCA8O94911 1581 aa14.8□□□□□ -0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.79□□□□□ -0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.78□□□□□ -0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.74□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 BCL11AQ9H165 835 aa14.74□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 UACAQ9BZF9 1416 aa14.73□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.72□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ABCC2Q92887 1545 aa14.71□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.71□□□□□ -0.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 HOMEZQ8IX15 550 aa14.69□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KLHL34Q8N239 644 aa14.69□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.69□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.68□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ARID3CA6NKF2 412 aa14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ATP10BO94823 1461 aa14.66□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ARHGEF11O15085 1522 aa14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 NCOA2Q15596 1464 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KCNA4P22459 653 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.61□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.61□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KIF14Q15058 1648 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.55□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PLEKHG5O94827 1062 aa14.54□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MIA2Q96PC5 1412 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms