RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-206ENST00000554292 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.61■■■■■ 5.21
PCNX1-206ENST00000554292 ARAP1Q96P48 1450 aa47.59■■■■■ 5.21
PCNX1-206ENST00000554292 PRXQ9BXM0 1461 aa47.5■■■■■ 5.19
PCNX1-206ENST00000554292 JPH4Q96JJ6 628 aa47.48■■■■■ 5.19
PCNX1-206ENST00000554292 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.47■■■■■ 5.19
PCNX1-206ENST00000554292 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.46■■■■■ 5.19
PCNX1-206ENST00000554292 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.42■■■■■ 5.18
PCNX1-206ENST00000554292 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
PCNX1-206ENST00000554292 IQGAP2Q13576 1575 aa47.4■■■■■ 5.18
PCNX1-206ENST00000554292 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.32■■■■■ 5.17
PCNX1-206ENST00000554292 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
PCNX1-206ENST00000554292 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.14■■■■■ 5.14
PCNX1-206ENST00000554292 KIF21BO75037 1637 aa47.13■■■■■ 5.14
PCNX1-206ENST00000554292 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.11■■■■■ 5.13
PCNX1-206ENST00000554292 DISP1Q96F81 1524 aa46.97■■■■■ 5.11
PCNX1-206ENST00000554292 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.93■■■■■ 5.1
PCNX1-206ENST00000554292 KIAA0556O60303 1618 aa46.93■■■■■ 5.1
PCNX1-206ENST00000554292 GOLGA3Q08378 1498 aa46.91■■■■■ 5.1
PCNX1-206ENST00000554292 PTPRGP23470 1445 aa46.88■■■■■ 5.09
PCNX1-206ENST00000554292 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.72■■■■■ 5.07
PCNX1-206ENST00000554292 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
PCNX1-206ENST00000554292 SAMD9Q5K651 1589 aa46.64■■■■■ 5.06
PCNX1-206ENST00000554292 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
PCNX1-206ENST00000554292 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.59■■■■■ 5.05
PCNX1-206ENST00000554292 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.59■■■■■ 5.05
PCNX1-206ENST00000554292 UACAQ9BZF9 1416 aa46.58■■■■■ 5.05
PCNX1-206ENST00000554292 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.56■■■■■ 5.04
PCNX1-206ENST00000554292 ABCC2Q92887 1545 aa46.53■■■■■ 5.04
PCNX1-206ENST00000554292 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
PCNX1-206ENST00000554292 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.51■■■■■ 5.04
PCNX1-206ENST00000554292 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
PCNX1-206ENST00000554292 MAPKBP1O60336 1514 aa46.44■■■■■ 5.03
PCNX1-206ENST00000554292 P3H3Q8IVL6 736 aa46.43■■■■■ 5.02
PCNX1-206ENST00000554292 ABCA8O94911 1581 aa46.39■■■■■ 5.02
PCNX1-206ENST00000554292 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.38■■■■■ 5.01
PCNX1-206ENST00000554292 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.32■■■■■ 5.01
PCNX1-206ENST00000554292 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.3■■■■■ 5
PCNX1-206ENST00000554292 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
PCNX1-206ENST00000554292 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.21■■■■■ 4.99
PCNX1-206ENST00000554292 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.2■■■■■ 4.99
PCNX1-206ENST00000554292 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.18■■■■■ 4.98
PCNX1-206ENST00000554292 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.17■■■■■ 4.98
PCNX1-206ENST00000554292 DIP2BQ9P265 1576 aa46.14■■■■■ 4.98
PCNX1-206ENST00000554292 ASXL2Q76L83 1435 aa46.14■■■■■ 4.98
PCNX1-206ENST00000554292 FMN1Q68DA7 1419 aa46.04■■■■■ 4.96
PCNX1-206ENST00000554292 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.02■■■■■ 4.96
PCNX1-206ENST00000554292 CLIP1P30622 1438 aa45.96■■■■■ 4.95
PCNX1-206ENST00000554292 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
PCNX1-206ENST00000554292 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.96■■■■■ 4.95
PCNX1-206ENST00000554292 ATP10BO94823 1461 aa45.94■■■■■ 4.95
PCNX1-206ENST00000554292 GLI2P10070 1586 aa45.92■■■■■ 4.94
PCNX1-206ENST00000554292 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
PCNX1-206ENST00000554292 ARID3CA6NKF2 412 aa45.88■■■■■ 4.94
PCNX1-206ENST00000554292 HECW1Q76N89 1606 aa45.85■■■■■ 4.93
PCNX1-206ENST00000554292 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
PCNX1-206ENST00000554292 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
PCNX1-206ENST00000554292 TSPOAP1O95153 1857 aa45.78■■■■■ 4.92
PCNX1-206ENST00000554292 CEP162Q5TB80 1403 aa45.77■■■■■ 4.92
PCNX1-206ENST00000554292 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.74■■■■■ 4.91
PCNX1-206ENST00000554292 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.7■■■■■ 4.91
PCNX1-206ENST00000554292 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
PCNX1-206ENST00000554292 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
PCNX1-206ENST00000554292 KCNH8Q96L42 1107 aa45.66■■■■■ 4.9
PCNX1-206ENST00000554292 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.66■■■■■ 4.9
PCNX1-206ENST00000554292 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.65■■■■■ 4.9
PCNX1-206ENST00000554292 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
PCNX1-206ENST00000554292 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.6■■■■■ 4.89
PCNX1-206ENST00000554292 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.6■■■■■ 4.89
PCNX1-206ENST00000554292 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
PCNX1-206ENST00000554292 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.54■■■■■ 4.88
PCNX1-206ENST00000554292 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.54■■■■■ 4.88
PCNX1-206ENST00000554292 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.53■■■■■ 4.88
PCNX1-206ENST00000554292 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.52■■■■■ 4.88
PCNX1-206ENST00000554292 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
PCNX1-206ENST00000554292 CD109Q6YHK3 1445 aa45.5■■■■■ 4.87
PCNX1-206ENST00000554292 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.44■■■■■ 4.86
PCNX1-206ENST00000554292 KDM6BO15054 1643 aa45.41■■■■■ 4.86
PCNX1-206ENST00000554292 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
PCNX1-206ENST00000554292 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.3■■■■■ 4.84
PCNX1-206ENST00000554292 KIF14Q15058 1648 aa45.28■■■■■ 4.84
PCNX1-206ENST00000554292 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.25■■■■■ 4.83
PCNX1-206ENST00000554292 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.24■■■■■ 4.83
PCNX1-206ENST00000554292 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.15■■■■■ 4.82
PCNX1-206ENST00000554292 NEO1Q92859 1461 aa45.14■■■■■ 4.82
PCNX1-206ENST00000554292 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.13■■■■■ 4.82
PCNX1-206ENST00000554292 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.12■■■■■ 4.81
PCNX1-206ENST00000554292 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.05■■■■■ 4.8
PCNX1-206ENST00000554292 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.04■■■■■ 4.8
PCNX1-206ENST00000554292 FANCAO15360 1455 aa45.03■■■■■ 4.8
PCNX1-206ENST00000554292 PLCH2O75038 1416 aa45.02■■■■■ 4.8
PCNX1-206ENST00000554292 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.02■■■■■ 4.8
PCNX1-206ENST00000554292 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.98■■■■■ 4.79
PCNX1-206ENST00000554292 TIAM1Q13009 1591 aa44.96■■■■■ 4.79
PCNX1-206ENST00000554292 AKNAQ7Z591 1439 aa44.92■■■■■ 4.78
PCNX1-206ENST00000554292 PREX2Q70Z35 1606 aa44.9■■■■■ 4.78
PCNX1-206ENST00000554292 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.89■■■■■ 4.78
PCNX1-206ENST00000554292 MAP3K1Q13233 1512 aa44.87■■■■■ 4.77
PCNX1-206ENST00000554292 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.87■■■■■ 4.77
PCNX1-206ENST00000554292 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.86■■■■■ 4.77
PCNX1-206ENST00000554292 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.86■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms