RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 JPH4Q96JJ6 628 aa55.79■■■■■ 6.52
TTC7B-202ENST00000553948 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP55.78■■■■■ 6.52
TTC7B-202ENST00000553948 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa55.6■■■■■ 6.49
TTC7B-202ENST00000553948 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa55.59■■■■■ 6.49
TTC7B-202ENST00000553948 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa55.16■■■■■ 6.42
TTC7B-202ENST00000553948 IQGAP2Q13576 1575 aa55.14■■■■■ 6.42
TTC7B-202ENST00000553948 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP55.06■■■■■ 6.4
TTC7B-202ENST00000553948 ADCY10Q96PN6 1610 aa55.06■■■■■ 6.4
TTC7B-202ENST00000553948 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa55.05■■■■■ 6.4
TTC7B-202ENST00000553948 PTPRGP23470 1445 aa54.98■■■■■ 6.39
TTC7B-202ENST00000553948 TNIKQ9UKE5 1360 aa54.93■■■■■ 6.38
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TTC7B-202ENST00000553948 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP54.87■■■■■ 6.37
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TTC7B-202ENST00000553948 UGGT2Q9NYU1 1516 aa54.8■■■■■ 6.36
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TTC7B-202ENST00000553948 PRXQ9BXM0 1461 aa54.71■■■■■ 6.35
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TTC7B-202ENST00000553948 DIP2BQ9P265 1576 aa54.64■■■■■ 6.34
TTC7B-202ENST00000553948 KIAA0556O60303 1618 aa54.62■■■■■ 6.34
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TTC7B-202ENST00000553948 GOLGA3Q08378 1498 aa54.44■■■■■ 6.31
TTC7B-202ENST00000553948 CSRNP3Q8WYN3 585 aa54.44■■■■■ 6.31
TTC7B-202ENST00000553948 ASXL2Q76L83 1435 aa54.36■■■■■ 6.29
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TTC7B-202ENST00000553948 EEA1Q15075 1411 aa54.33■■■■■ 6.29
TTC7B-202ENST00000553948 KDM5BQ9UGL1 1544 aa54.32■■■■■ 6.29
TTC7B-202ENST00000553948 TSPOAP1O95153 1857 aa54.26■■■■■ 6.28
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TTC7B-202ENST00000553948 KDM6BO15054 1643 aa54.05■■■■■ 6.24
TTC7B-202ENST00000553948 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP54.03■■■■■ 6.24
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TTC7B-202ENST00000553948 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP53.93■■■■■ 6.22
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TTC7B-202ENST00000553948 WDR7Q9Y4E6 1490 aa53.93■■■■■ 6.22
TTC7B-202ENST00000553948 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa53.89■■■■■ 6.22
TTC7B-202ENST00000553948 CHIC1Q5VXU3 224 aa53.88■■■■■ 6.22
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TTC7B-202ENST00000553948 TEX14Q8IWB6 1497 aa53.72■■■■■ 6.19
TTC7B-202ENST00000553948 KCNH8Q96L42 1107 aa53.67■■■■■ 6.18
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TTC7B-202ENST00000553948 ATP10BO94823 1461 aa53.65■■■■■ 6.18
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TTC7B-202ENST00000553948 CFAP43Q8NDM7 1665 aa53.58■■■■■ 6.17
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TTC7B-202ENST00000553948 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP53.51■■■■■ 6.16
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TTC7B-202ENST00000553948 ADGRL1O94910 1474 aa52.98■■■■■ 6.07
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TTC7B-202ENST00000553948 HECW1Q76N89 1606 aa52.91■■■■■ 6.06
TTC7B-202ENST00000553948 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP52.9■■■■■ 6.06
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TTC7B-202ENST00000553948 CFAP74Q9C0B2 1584 aa52.69■■■■■ 6.03
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TTC7B-202ENST00000553948 CCDC18Q5T9S5 1454 aa52.42■■■■■ 5.98
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa52.35■■■■■ 5.97
TTC7B-202ENST00000553948 FYCO1Q9BQS8 1478 aa52.34■■■■■ 5.97
TTC7B-202ENST00000553948 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa52.33■■■■■ 5.97
TTC7B-202ENST00000553948 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa52.31■■■■■ 5.96
TTC7B-202ENST00000553948 SCAPERQ9BY12 1400 aa52.31■■■■■ 5.96
TTC7B-202ENST00000553948 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP52.26■■■■■ 5.96
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