RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-208ENST00000551676 ARAP1Q96P48 1450 aa40.53■■■■■ 4.08
PPP1CC-208ENST00000551676 SYNJ2O15056 1496 aa40.46■■■■■ 4.07
PPP1CC-208ENST00000551676 GRIN2AQ12879 1464 aa40.44■■■■■ 4.06
PPP1CC-208ENST00000551676 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.37■■■■■ 4.05
PPP1CC-208ENST00000551676 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
PPP1CC-208ENST00000551676 IQGAP2Q13576 1575 aa40.27■■■■■ 4.04
PPP1CC-208ENST00000551676 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.26■■■■■ 4.04
PPP1CC-208ENST00000551676 SAMD9Q5K651 1589 aa40.23■■■■■ 4.03
PPP1CC-208ENST00000551676 NUP160Q12769 1436 aa40.19■■■■■ 4.02
PPP1CC-208ENST00000551676 CEP170Q5SW79 1584 aa40.17■■■■■ 4.02
PPP1CC-208ENST00000551676 FBLN2P98095 1184 aa40.16■■■■■ 4.02
PPP1CC-208ENST00000551676 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
PPP1CC-208ENST00000551676 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.14■■■■■ 4.02
PPP1CC-208ENST00000551676 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.14■■■■■ 4.02
PPP1CC-208ENST00000551676 P3H3Q8IVL6 736 aa40.12■■■■■ 4.01
PPP1CC-208ENST00000551676 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
PPP1CC-208ENST00000551676 APLP2Q06481 763 aa40.05■■■■■ 4
PPP1CC-208ENST00000551676 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.01■■■■■ 4
PPP1CC-208ENST00000551676 FMN1Q68DA7 1419 aa40■■■■□ 3.99
PPP1CC-208ENST00000551676 CHD1O14646 1710 aa39.96■■■■□ 3.99
PPP1CC-208ENST00000551676 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.93■■■■□ 3.98
PPP1CC-208ENST00000551676 DISP1Q96F81 1524 aa39.93■■■■□ 3.98
PPP1CC-208ENST00000551676 MAP3K1Q13233 1512 aa39.91■■■■□ 3.98
PPP1CC-208ENST00000551676 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
PPP1CC-208ENST00000551676 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.9■■■■□ 3.98
PPP1CC-208ENST00000551676 KIAA0556O60303 1618 aa39.87■■■■□ 3.97
PPP1CC-208ENST00000551676 JPH4Q96JJ6 628 aa39.85■■■■□ 3.97
PPP1CC-208ENST00000551676 TIAM1Q13009 1591 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP1CC-208ENST00000551676 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
PPP1CC-208ENST00000551676 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
PPP1CC-208ENST00000551676 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.73■■■■□ 3.95
PPP1CC-208ENST00000551676 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.69■■■■□ 3.94
PPP1CC-208ENST00000551676 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
PPP1CC-208ENST00000551676 SHROOM2Q13796 1616 aa39.63■■■■□ 3.93
PPP1CC-208ENST00000551676 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.61■■■■□ 3.93
PPP1CC-208ENST00000551676 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.61■■■■□ 3.93
PPP1CC-208ENST00000551676 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PPP1CC-208ENST00000551676 HECW1Q76N89 1606 aa39.56■■■■□ 3.92
PPP1CC-208ENST00000551676 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.52■■■■□ 3.92
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.52■■■■□ 3.92
PPP1CC-208ENST00000551676 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.45■■■■□ 3.91
PPP1CC-208ENST00000551676 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
PPP1CC-208ENST00000551676 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.36■■■■□ 3.89
PPP1CC-208ENST00000551676 PTPRGP23470 1445 aa39.34■■■■□ 3.89
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCA8O94911 1581 aa39.34■■■■□ 3.89
PPP1CC-208ENST00000551676 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP1CC-208ENST00000551676 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.88
PPP1CC-208ENST00000551676 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
PPP1CC-208ENST00000551676 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.3■■■■□ 3.88
PPP1CC-208ENST00000551676 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP1CC-208ENST00000551676 OSCARQ8IYS5 282 aa39.27■■■■□ 3.88
PPP1CC-208ENST00000551676 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.26■■■■□ 3.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP1CC-208ENST00000551676 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.17■■■■□ 3.86
PPP1CC-208ENST00000551676 ARID3CA6NKF2 412 aa39.15■■■■□ 3.86
PPP1CC-208ENST00000551676 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
PPP1CC-208ENST00000551676 UACAQ9BZF9 1416 aa39.13■■■■□ 3.86
PPP1CC-208ENST00000551676 ARHGEF11O15085 1522 aa39.13■■■■□ 3.86
PPP1CC-208ENST00000551676 NCOA2Q15596 1464 aa39.13■■■■□ 3.85
PPP1CC-208ENST00000551676 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PPP1CC-208ENST00000551676 ATP10BO94823 1461 aa39.07■■■■□ 3.85
PPP1CC-208ENST00000551676 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
PPP1CC-208ENST00000551676 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
PPP1CC-208ENST00000551676 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCC2Q92887 1545 aa39■■■■□ 3.83
PPP1CC-208ENST00000551676 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP1CC-208ENST00000551676 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.98■■■■□ 3.833e-6■■□□□ 12.8
PPP1CC-208ENST00000551676 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP1CC-208ENST00000551676 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.89■■■■□ 3.82
PPP1CC-208ENST00000551676 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.88■■■■□ 3.81
PPP1CC-208ENST00000551676 HRCP23327 699 aa38.83■■■■□ 3.81
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
PPP1CC-208ENST00000551676 MIA2Q96PC5 1412 aa38.82■■■■□ 3.8
PPP1CC-208ENST00000551676 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.79■■■■□ 3.8
PPP1CC-208ENST00000551676 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
PPP1CC-208ENST00000551676 KIF14Q15058 1648 aa38.75■■■■□ 3.79
PPP1CC-208ENST00000551676 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.75■■■■□ 3.79
PPP1CC-208ENST00000551676 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.69■■■■□ 3.78
PPP1CC-208ENST00000551676 ITGAEP38570 1179 aa38.68■■■■□ 3.78
PPP1CC-208ENST00000551676 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
PPP1CC-208ENST00000551676 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.61■■■■□ 3.77
PPP1CC-208ENST00000551676 PTPRKQ15262 1439 aa38.53■■■■□ 3.76
PPP1CC-208ENST00000551676 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
PPP1CC-208ENST00000551676 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
PPP1CC-208ENST00000551676 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP1CC-208ENST00000551676 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PPP1CC-208ENST00000551676 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.47■■■■□ 3.75
PPP1CC-208ENST00000551676 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.45■■■■□ 3.752e-6■□□□□ 10.8
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
PPP1CC-208ENST00000551676 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.43■■■■□ 3.74
PPP1CC-208ENST00000551676 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.4■■■■□ 3.74
PPP1CC-208ENST00000551676 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.4■■■■□ 3.74
PPP1CC-208ENST00000551676 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.39■■■■□ 3.74
PPP1CC-208ENST00000551676 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.38■■■■□ 3.73
PPP1CC-208ENST00000551676 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.38■■■■□ 3.73
PPP1CC-208ENST00000551676 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
PPP1CC-208ENST00000551676 PREX2Q70Z35 1606 aa38.38■■■■□ 3.73
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