RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 ARHGEF11O15085 1522 aa15.59■□□□□ 0.09
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CS-224ENST00000551155 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.04■□□□□ -0
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CS-224ENST00000551155 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 KCNH8Q96L42 1107 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
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CS-224ENST00000551155 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
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CS-224ENST00000551155 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.9□□□□□ -0.02
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CS-224ENST00000551155 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.89□□□□□ -0.03
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CS-224ENST00000551155 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 CD109Q6YHK3 1445 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.83□□□□□ -0.03
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CS-224ENST00000551155 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CS-224ENST00000551155 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.82□□□□□ -0.04
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CS-224ENST00000551155 KIF14Q15058 1648 aa14.8□□□□□ -0.04
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CS-224ENST00000551155 TIAM1Q13009 1591 aa14.73□□□□□ -0.05
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CS-224ENST00000551155 PLCH2O75038 1416 aa14.71□□□□□ -0.05
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