RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.31■■■□□ 2.44
CS-219ENST00000550655 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CS-219ENST00000550655 JPH4Q96JJ6 628 aa30.24■■■□□ 2.43
CS-219ENST00000550655 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.2■■■□□ 2.43
CS-219ENST00000550655 IQGAP2Q13576 1575 aa30.16■■■□□ 2.42
CS-219ENST00000550655 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.08■■■□□ 2.41
CS-219ENST00000550655 PRXQ9BXM0 1461 aa30.07■■■□□ 2.4
CS-219ENST00000550655 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.98■■■□□ 2.39
CS-219ENST00000550655 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.97■■■□□ 2.39
CS-219ENST00000550655 DISP1Q96F81 1524 aa29.96■■■□□ 2.39
CS-219ENST00000550655 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CS-219ENST00000550655 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.94■■■□□ 2.38
CS-219ENST00000550655 EEA1Q15075 1411 aa29.93■■■□□ 2.38
CS-219ENST00000550655 KIAA0556O60303 1618 aa29.9■■■□□ 2.38
CS-219ENST00000550655 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.87■■■□□ 2.37
CS-219ENST00000550655 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.86■■■□□ 2.37
CS-219ENST00000550655 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.85■■■□□ 2.37
CS-219ENST00000550655 PTPRGP23470 1445 aa29.85■■■□□ 2.37
CS-219ENST00000550655 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.81■■■□□ 2.36
CS-219ENST00000550655 MAPKBP1O60336 1514 aa29.8■■■□□ 2.36
CS-219ENST00000550655 KIF21BO75037 1637 aa29.74■■■□□ 2.35
CS-219ENST00000550655 GOLGA3Q08378 1498 aa29.73■■■□□ 2.35
CS-219ENST00000550655 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.72■■■□□ 2.35
CS-219ENST00000550655 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CS-219ENST00000550655 ABCC2Q92887 1545 aa29.7■■■□□ 2.34
CS-219ENST00000550655 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CS-219ENST00000550655 UACAQ9BZF9 1416 aa29.68■■■□□ 2.34
CS-219ENST00000550655 DIP2BQ9P265 1576 aa29.67■■■□□ 2.34
CS-219ENST00000550655 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
CS-219ENST00000550655 SAMD9Q5K651 1589 aa29.64■■■□□ 2.34
CS-219ENST00000550655 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.64■■■□□ 2.34
CS-219ENST00000550655 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CS-219ENST00000550655 ABCA8O94911 1581 aa29.58■■■□□ 2.33
CS-219ENST00000550655 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.58■■■□□ 2.33
CS-219ENST00000550655 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.56■■■□□ 2.32
CS-219ENST00000550655 ASXL2Q76L83 1435 aa29.51■■■□□ 2.31
CS-219ENST00000550655 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.47■■■□□ 2.31
CS-219ENST00000550655 GLI2P10070 1586 aa29.43■■■□□ 2.3
CS-219ENST00000550655 P3H3Q8IVL6 736 aa29.42■■■□□ 2.3
CS-219ENST00000550655 TSPOAP1O95153 1857 aa29.42■■■□□ 2.3
CS-219ENST00000550655 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.41■■■□□ 2.3
CS-219ENST00000550655 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.38■■■□□ 2.29
CS-219ENST00000550655 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.37■■■□□ 2.29
CS-219ENST00000550655 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CS-219ENST00000550655 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CS-219ENST00000550655 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.34■■■□□ 2.29
CS-219ENST00000550655 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.33■■■□□ 2.29
CS-219ENST00000550655 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CS-219ENST00000550655 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.31■■■□□ 2.28
CS-219ENST00000550655 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CS-219ENST00000550655 ATP10BO94823 1461 aa29.26■■■□□ 2.27
CS-219ENST00000550655 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CS-219ENST00000550655 KDM6BO15054 1643 aa29.22■■■□□ 2.27
CS-219ENST00000550655 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.22■■■□□ 2.27
CS-219ENST00000550655 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.2■■■□□ 2.26
CS-219ENST00000550655 ARID3CA6NKF2 412 aa29.16■■■□□ 2.26
CS-219ENST00000550655 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.1■■■□□ 2.25
CS-219ENST00000550655 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.08■■■□□ 2.25
CS-219ENST00000550655 FMN1Q68DA7 1419 aa29.07■■■□□ 2.24
CS-219ENST00000550655 HECW1Q76N89 1606 aa29.05■■■□□ 2.24
CS-219ENST00000550655 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.05■■■□□ 2.24
CS-219ENST00000550655 KCNH8Q96L42 1107 aa29.05■■■□□ 2.24
CS-219ENST00000550655 CD109Q6YHK3 1445 aa29.03■■■□□ 2.24
CS-219ENST00000550655 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CS-219ENST00000550655 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29■■■□□ 2.23
CS-219ENST00000550655 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CS-219ENST00000550655 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CS-219ENST00000550655 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CS-219ENST00000550655 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CS-219ENST00000550655 CLIP1P30622 1438 aa28.91■■■□□ 2.22
CS-219ENST00000550655 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.212e-20■□□□□ 10.1
CS-219ENST00000550655 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.88■■■□□ 2.21
CS-219ENST00000550655 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.86■■■□□ 2.21
CS-219ENST00000550655 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.85■■■□□ 2.21
CS-219ENST00000550655 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.81■■■□□ 2.2
CS-219ENST00000550655 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
CS-219ENST00000550655 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CS-219ENST00000550655 NEO1Q92859 1461 aa28.79■■■□□ 2.2
CS-219ENST00000550655 KIF14Q15058 1648 aa28.78■■■□□ 2.2
CS-219ENST00000550655 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.78■■■□□ 2.2
CS-219ENST00000550655 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.75■■■□□ 2.19
CS-219ENST00000550655 CEP162Q5TB80 1403 aa28.74■■■□□ 2.19
CS-219ENST00000550655 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.74■■■□□ 2.19
CS-219ENST00000550655 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
CS-219ENST00000550655 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.72■■■□□ 2.19
CS-219ENST00000550655 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.71■■■□□ 2.19
CS-219ENST00000550655 FANCAO15360 1455 aa28.68■■■□□ 2.18
CS-219ENST00000550655 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CS-219ENST00000550655 RICTORQ6R327 1708 aa28.66■■■□□ 2.18
CS-219ENST00000550655 PLCH2O75038 1416 aa28.63■■■□□ 2.17
CS-219ENST00000550655 AKNAQ7Z591 1439 aa28.62■■■□□ 2.17
CS-219ENST00000550655 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.6■■■□□ 2.17
CS-219ENST00000550655 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.57■■■□□ 2.16
CS-219ENST00000550655 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CS-219ENST00000550655 PREX2Q70Z35 1606 aa28.57■■■□□ 2.16
CS-219ENST00000550655 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.56■■■□□ 2.16
CS-219ENST00000550655 RAPGEF3O95398 923 aa28.56■■■□□ 2.16
CS-219ENST00000550655 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CS-219ENST00000550655 ADGRL1O94910 1474 aa28.55■■■□□ 2.16
CS-219ENST00000550655 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.54■■■□□ 2.16
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