RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550292.1

LINC00941-202, long intergenic non-protein coding RNA 941, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00941, Length 632 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00941-202ENST00000550292 IGF1RP08069 1367 aa36.2■■■■□ 3.39
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LINC00941-202ENST00000550292 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.96■■■■□ 3.35
LINC00941-202ENST00000550292 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
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LINC00941-202ENST00000550292 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.88■■■■□ 3.33
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LINC00941-202ENST00000550292 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
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LINC00941-202ENST00000550292 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.67■■■■□ 3.3
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LINC00941-202ENST00000550292 TSPOAP1O95153 1857 aa35.44■■■■□ 3.26
LINC00941-202ENST00000550292 ASXL2Q76L83 1435 aa35.42■■■■□ 3.26
LINC00941-202ENST00000550292 KDM6BO15054 1643 aa35.42■■■■□ 3.26
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LINC00941-202ENST00000550292 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.36■■■■□ 3.25
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LINC00941-202ENST00000550292 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.1■■■■□ 3.21
LINC00941-202ENST00000550292 ABCA8O94911 1581 aa35.1■■■■□ 3.21
LINC00941-202ENST00000550292 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.09■■■■□ 3.21
LINC00941-202ENST00000550292 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
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LINC00941-202ENST00000550292 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35■■■■□ 3.19
LINC00941-202ENST00000550292 EEA1Q15075 1411 aa34.95■■■■□ 3.19
LINC00941-202ENST00000550292 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
LINC00941-202ENST00000550292 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.92■■■■□ 3.18
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LINC00941-202ENST00000550292 CD109Q6YHK3 1445 aa34.88■■■■□ 3.17
LINC00941-202ENST00000550292 SAMD9Q5K651 1589 aa34.87■■■■□ 3.17
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LINC00941-202ENST00000550292 ARID3CA6NKF2 412 aa34.69■■■■□ 3.14
LINC00941-202ENST00000550292 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.65■■■■□ 3.14
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LINC00941-202ENST00000550292 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.62■■■■□ 3.13
LINC00941-202ENST00000550292 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.61■■■■□ 3.13
LINC00941-202ENST00000550292 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
LINC00941-202ENST00000550292 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.57■■■■□ 3.13
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LINC00941-202ENST00000550292 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
LINC00941-202ENST00000550292 NEO1Q92859 1461 aa34.49■■■■□ 3.11
LINC00941-202ENST00000550292 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.43■■■■□ 3.1
LINC00941-202ENST00000550292 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.34■■■■□ 3.09
LINC00941-202ENST00000550292 RAPGEF3O95398 923 aa34.33■■■■□ 3.09
LINC00941-202ENST00000550292 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
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LINC00941-202ENST00000550292 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.27■■■■□ 3.08
LINC00941-202ENST00000550292 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.27■■■■□ 3.08
LINC00941-202ENST00000550292 FMN1Q68DA7 1419 aa34.26■■■■□ 3.07
LINC00941-202ENST00000550292 FANCAO15360 1455 aa34.22■■■■□ 3.07
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LINC00941-202ENST00000550292 HECW1Q76N89 1606 aa34.19■■■■□ 3.06
LINC00941-202ENST00000550292 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.18■■■■□ 3.06
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LINC00941-202ENST00000550292 RICTORQ6R327 1708 aa34.18■■■■□ 3.06
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LINC00941-202ENST00000550292 PLCH2O75038 1416 aa34.09■■■■□ 3.05
LINC00941-202ENST00000550292 PTPRMP28827 1452 aa34.08■■■■□ 3.05
LINC00941-202ENST00000550292 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.08■■■■□ 3.05
LINC00941-202ENST00000550292 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
LINC00941-202ENST00000550292 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.03■■■■□ 3.04
LINC00941-202ENST00000550292 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34■■■■□ 3.03
LINC00941-202ENST00000550292 MADDQ8WXG6 1647 aa33.99■■■■□ 3.03
LINC00941-202ENST00000550292 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.99■■■■□ 3.03
LINC00941-202ENST00000550292 KIF14Q15058 1648 aa33.97■■■■□ 3.03
LINC00941-202ENST00000550292 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.97■■■■□ 3.03
LINC00941-202ENST00000550292 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
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