RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550075.5

CPSF6-205, Transcript of cleavage and polyadenylation specific factor 6, humanhuman

TSL 4

Gene CPSF6, Length 540 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6-205ENST00000550075 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.57■■■■■ 4.57
CPSF6-205ENST00000550075 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.55■■■■■ 4.56
CPSF6-205ENST00000550075 EEA1Q15075 1411 aa43.54■■■■■ 4.56
CPSF6-205ENST00000550075 JPH4Q96JJ6 628 aa43.49■■■■■ 4.55
CPSF6-205ENST00000550075 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.48■■■■■ 4.55
CPSF6-205ENST00000550075 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
CPSF6-205ENST00000550075 PRXQ9BXM0 1461 aa43.43■■■■■ 4.54
CPSF6-205ENST00000550075 IQGAP2Q13576 1575 aa43.4■■■■■ 4.54
CPSF6-205ENST00000550075 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.35■■■■■ 4.53
CPSF6-205ENST00000550075 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.29■■■■■ 4.52
CPSF6-205ENST00000550075 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.19■■■■■ 4.5
CPSF6-205ENST00000550075 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
CPSF6-205ENST00000550075 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.13■■■■■ 4.5
CPSF6-205ENST00000550075 KIF21BO75037 1637 aa43.07■■■■■ 4.48
CPSF6-205ENST00000550075 DISP1Q96F81 1524 aa43.01■■■■■ 4.48
CPSF6-205ENST00000550075 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.99■■■■■ 4.47
CPSF6-205ENST00000550075 KIAA0556O60303 1618 aa42.97■■■■■ 4.47
CPSF6-205ENST00000550075 GOLGA3Q08378 1498 aa42.95■■■■■ 4.47
CPSF6-205ENST00000550075 PTPRGP23470 1445 aa42.95■■■■■ 4.47
CPSF6-205ENST00000550075 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.82■■■■■ 4.45
CPSF6-205ENST00000550075 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
CPSF6-205ENST00000550075 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
CPSF6-205ENST00000550075 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.72■■■■■ 4.43
CPSF6-205ENST00000550075 SAMD9Q5K651 1589 aa42.68■■■■■ 4.42
CPSF6-205ENST00000550075 UACAQ9BZF9 1416 aa42.67■■■■■ 4.42
CPSF6-205ENST00000550075 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.66■■■■■ 4.42
CPSF6-205ENST00000550075 ABCC2Q92887 1545 aa42.63■■■■■ 4.42
CPSF6-205ENST00000550075 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
CPSF6-205ENST00000550075 MAPKBP1O60336 1514 aa42.6■■■■■ 4.41
CPSF6-205ENST00000550075 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.57■■■■■ 4.41
CPSF6-205ENST00000550075 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.55■■■■■ 4.4
CPSF6-205ENST00000550075 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
CPSF6-205ENST00000550075 P3H3Q8IVL6 736 aa42.48■■■■■ 4.39
CPSF6-205ENST00000550075 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.47■■■■■ 4.39
CPSF6-205ENST00000550075 ABCA8O94911 1581 aa42.47■■■■■ 4.39
CPSF6-205ENST00000550075 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.43■■■■■ 4.38
CPSF6-205ENST00000550075 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
CPSF6-205ENST00000550075 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.37■■■■■ 4.37
CPSF6-205ENST00000550075 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.36■■■■■ 4.37
CPSF6-205ENST00000550075 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.36■■■■■ 4.37
CPSF6-205ENST00000550075 DIP2BQ9P265 1576 aa42.33■■■■■ 4.37
CPSF6-205ENST00000550075 ASXL2Q76L83 1435 aa42.3■■■■■ 4.36
CPSF6-205ENST00000550075 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.29■■■■■ 4.36
CPSF6-205ENST00000550075 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.22■■■■■ 4.35
CPSF6-205ENST00000550075 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.21■■■■■ 4.35
CPSF6-205ENST00000550075 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.13■■■■■ 4.34
CPSF6-205ENST00000550075 FMN1Q68DA7 1419 aa42.12■■■■■ 4.33
CPSF6-205ENST00000550075 GLI2P10070 1586 aa42.1■■■■■ 4.33
CPSF6-205ENST00000550075 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
CPSF6-205ENST00000550075 ATP10BO94823 1461 aa42.06■■■■■ 4.32
CPSF6-205ENST00000550075 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CPSF6-205ENST00000550075 ARID3CA6NKF2 412 aa42.01■■■■■ 4.32
CPSF6-205ENST00000550075 CLIP1P30622 1438 aa42■■■■■ 4.31
CPSF6-205ENST00000550075 HECW1Q76N89 1606 aa41.96■■■■■ 4.31
CPSF6-205ENST00000550075 TSPOAP1O95153 1857 aa41.95■■■■■ 4.31
CPSF6-205ENST00000550075 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
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CPSF6-205ENST00000550075 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.9■■■■■ 4.3
CPSF6-205ENST00000550075 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.83■■■■■ 4.29
CPSF6-205ENST00000550075 KCNH8Q96L42 1107 aa41.82■■■■■ 4.29
CPSF6-205ENST00000550075 CEP162Q5TB80 1403 aa41.8■■■■■ 4.28
CPSF6-205ENST00000550075 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
CPSF6-205ENST00000550075 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
CPSF6-205ENST00000550075 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
CPSF6-205ENST00000550075 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
CPSF6-205ENST00000550075 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.76■■■■■ 4.28
CPSF6-205ENST00000550075 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.75■■■■■ 4.27
CPSF6-205ENST00000550075 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.73■■■■■ 4.27
CPSF6-205ENST00000550075 CD109Q6YHK3 1445 aa41.7■■■■■ 4.27
CPSF6-205ENST00000550075 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.7■■■■■ 4.27
CPSF6-205ENST00000550075 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.69■■■■■ 4.27
CPSF6-205ENST00000550075 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.69■■■■■ 4.26
CPSF6-205ENST00000550075 KDM6BO15054 1643 aa41.69■■■■■ 4.26
CPSF6-205ENST00000550075 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.66■■■■■ 4.26
CPSF6-205ENST00000550075 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.65■■■■■ 4.26
CPSF6-205ENST00000550075 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
CPSF6-205ENST00000550075 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.61■■■■■ 4.25
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CPSF6-205ENST00000550075 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.236e-7■■□□□ 12.9
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CPSF6-205ENST00000550075 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.37■■■■■ 4.21
CPSF6-205ENST00000550075 NEO1Q92859 1461 aa41.36■■■■■ 4.21
CPSF6-205ENST00000550075 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.35■■■■■ 4.21
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CPSF6-205ENST00000550075 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CPSF6-205ENST00000550075 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.3■■■■■ 4.2
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CPSF6-205ENST00000550075 TIAM1Q13009 1591 aa41.08■■■■■ 4.17
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CPSF6-205ENST00000550075 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
CPSF6-205ENST00000550075 ADGRL1O94910 1474 aa41.04■■■■■ 4.16
CPSF6-205ENST00000550075 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.03■■■■■ 4.16
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