RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-213ENST00000548746 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-213ENST00000548746 EEA1Q15075 1411 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-213ENST00000548746 PRXQ9BXM0 1461 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-213ENST00000548746 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.02□□□□□ -0.8
CS-213ENST00000548746 ARAP1Q96P48 1450 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-213ENST00000548746 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-213ENST00000548746 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-213ENST00000548746 IQGAP2Q13576 1575 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-213ENST00000548746 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.96□□□□□ -0.81
CS-213ENST00000548746 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-213ENST00000548746 KIF21BO75037 1637 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-213ENST00000548746 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-213ENST00000548746 FOXD1Q16676 465 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-213ENST00000548746 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-213ENST00000548746 JPH4Q96JJ6 628 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-213ENST00000548746 DISP1Q96F81 1524 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-213ENST00000548746 KIAA0556O60303 1618 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-213ENST00000548746 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-213ENST00000548746 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-213ENST00000548746 SAMD9Q5K651 1589 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-213ENST00000548746 GOLGA3Q08378 1498 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-213ENST00000548746 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-213ENST00000548746 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-213ENST00000548746 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-213ENST00000548746 PTPRGP23470 1445 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-213ENST00000548746 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-213ENST00000548746 MAPKBP1O60336 1514 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-213ENST00000548746 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-213ENST00000548746 ABCC2Q92887 1545 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-213ENST00000548746 UACAQ9BZF9 1416 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-213ENST00000548746 ABCA8O94911 1581 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-213ENST00000548746 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-213ENST00000548746 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-213ENST00000548746 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-213ENST00000548746 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-213ENST00000548746 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-213ENST00000548746 DIP2BQ9P265 1576 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-213ENST00000548746 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-213ENST00000548746 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.71□□□□□ -0.85
CS-213ENST00000548746 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 GLI2P10070 1586 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 ASXL2Q76L83 1435 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 FMN1Q68DA7 1419 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 ATP10BO94823 1461 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 P3H3Q8IVL6 736 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-213ENST00000548746 CLIP1P30622 1438 aa9.65□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 HECW1Q76N89 1606 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 CEP162Q5TB80 1403 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-213ENST00000548746 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 TSPOAP1O95153 1857 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 ADRA2BP18089 450 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 CD109Q6YHK3 1445 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-213ENST00000548746 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 ARID3CA6NKF2 412 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 KDM6BO15054 1643 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 KIF14Q15058 1648 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 NEO1Q92859 1461 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 KCNH8Q96L42 1107 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 MAP3K1Q13233 1512 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 TIAM1Q13009 1591 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 PREX2Q70Z35 1606 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 PLCH2O75038 1416 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-213ENST00000548746 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.45□□□□□ -0.9
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