RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544336.5

PDCD2-211, Transcript of programmed cell death 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDCD2, Length 1,164 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2-211ENST00000544336 IGF1RP08069 1367 aa48.05■■■■■ 5.28
PDCD2-211ENST00000544336 CUL7Q14999 1698 aa48.01■■■■■ 5.28
PDCD2-211ENST00000544336 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.89■■■■■ 5.26
PDCD2-211ENST00000544336 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.86■■■■■ 5.25
PDCD2-211ENST00000544336 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.75■■■■■ 5.24
PDCD2-211ENST00000544336 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.73■■■■■ 5.23
PDCD2-211ENST00000544336 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.71■■■■■ 5.23
PDCD2-211ENST00000544336 MAPKBP1O60336 1514 aa47.6■■■■■ 5.21
PDCD2-211ENST00000544336 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.59■■■■■ 5.21
PDCD2-211ENST00000544336 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.58■■■■■ 5.21
PDCD2-211ENST00000544336 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.57■■■■■ 5.21
PDCD2-211ENST00000544336 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.55■■■■■ 5.2
PDCD2-211ENST00000544336 IQGAP2Q13576 1575 aa47.49■■■■■ 5.19
PDCD2-211ENST00000544336 DIP2BQ9P265 1576 aa47.49■■■■■ 5.19
PDCD2-211ENST00000544336 PTPRGP23470 1445 aa47.47■■■■■ 5.19
PDCD2-211ENST00000544336 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.44■■■■■ 5.18
PDCD2-211ENST00000544336 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.38■■■■■ 5.18
PDCD2-211ENST00000544336 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.33■■■■■ 5.17
PDCD2-211ENST00000544336 TSPOAP1O95153 1857 aa47.28■■■■■ 5.16
PDCD2-211ENST00000544336 DISP1Q96F81 1524 aa47.24■■■■■ 5.15
PDCD2-211ENST00000544336 ABCC2Q92887 1545 aa47.22■■■■■ 5.15
PDCD2-211ENST00000544336 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.15■■■■■ 5.14
PDCD2-211ENST00000544336 KDM6BO15054 1643 aa47.12■■■■■ 5.13
PDCD2-211ENST00000544336 UACAQ9BZF9 1416 aa47.11■■■■■ 5.13
PDCD2-211ENST00000544336 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.1■■■■■ 5.13
PDCD2-211ENST00000544336 ASXL2Q76L83 1435 aa47.09■■■■■ 5.13
PDCD2-211ENST00000544336 KIAA0556O60303 1618 aa47.07■■■■■ 5.13
PDCD2-211ENST00000544336 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.03■■■■■ 5.12
PDCD2-211ENST00000544336 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.02■■■■■ 5.12
PDCD2-211ENST00000544336 GLI2P10070 1586 aa46.91■■■■■ 5.1
PDCD2-211ENST00000544336 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
PDCD2-211ENST00000544336 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.9■■■■■ 5.1
PDCD2-211ENST00000544336 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
PDCD2-211ENST00000544336 PRXQ9BXM0 1461 aa46.81■■■■■ 5.08
PDCD2-211ENST00000544336 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
PDCD2-211ENST00000544336 GOLGA3Q08378 1498 aa46.76■■■■■ 5.08
PDCD2-211ENST00000544336 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.71■■■■■ 5.07
PDCD2-211ENST00000544336 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.62■■■■■ 5.05
PDCD2-211ENST00000544336 ABCA8O94911 1581 aa46.61■■■■■ 5.05
PDCD2-211ENST00000544336 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.6■■■■■ 5.05
PDCD2-211ENST00000544336 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.55■■■■■ 5.04
PDCD2-211ENST00000544336 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
PDCD2-211ENST00000544336 P3H3Q8IVL6 736 aa46.47■■■■■ 5.03
PDCD2-211ENST00000544336 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.46■■■■■ 5.03
PDCD2-211ENST00000544336 KCNH8Q96L42 1107 aa46.44■■■■■ 5.02
PDCD2-211ENST00000544336 ARID3CA6NKF2 412 aa46.37■■■■■ 5.01
PDCD2-211ENST00000544336 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.36■■■■■ 5.01
PDCD2-211ENST00000544336 CD109Q6YHK3 1445 aa46.34■■■■■ 5.01
PDCD2-211ENST00000544336 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
PDCD2-211ENST00000544336 SAMD9Q5K651 1589 aa46.29■■■■■ 5
PDCD2-211ENST00000544336 ADGRL1O94910 1474 aa46.27■■■■■ 5
PDCD2-211ENST00000544336 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.26■■■■■ 5
PDCD2-211ENST00000544336 ATP10BO94823 1461 aa46.22■■■■■ 4.99
PDCD2-211ENST00000544336 EEA1Q15075 1411 aa46.21■■■■■ 4.99
PDCD2-211ENST00000544336 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.98
PDCD2-211ENST00000544336 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.15■■■■■ 4.98
PDCD2-211ENST00000544336 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
PDCD2-211ENST00000544336 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
PDCD2-211ENST00000544336 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.02■■■■■ 4.96
PDCD2-211ENST00000544336 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.99■■■■■ 4.95
PDCD2-211ENST00000544336 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.95
PDCD2-211ENST00000544336 KIF21BO75037 1637 aa45.93■■■■■ 4.94
PDCD2-211ENST00000544336 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.9■■■■■ 4.94
PDCD2-211ENST00000544336 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.8■■■■■ 4.92
PDCD2-211ENST00000544336 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.8■■■■■ 4.92
PDCD2-211ENST00000544336 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.75■■■■■ 4.91
PDCD2-211ENST00000544336 NEO1Q92859 1461 aa45.72■■■■■ 4.91
PDCD2-211ENST00000544336 RAPGEF3O95398 923 aa45.7■■■■■ 4.91
PDCD2-211ENST00000544336 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.69■■■■■ 4.9
PDCD2-211ENST00000544336 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.65■■■■■ 4.9
PDCD2-211ENST00000544336 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
PDCD2-211ENST00000544336 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.61■■■■■ 4.89
PDCD2-211ENST00000544336 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.6■■■■■ 4.89
PDCD2-211ENST00000544336 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.56■■■■■ 4.88
PDCD2-211ENST00000544336 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.55■■■■■ 4.881e-6■■□□□ 13.9
PDCD2-211ENST00000544336 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.52■■■■■ 4.88
PDCD2-211ENST00000544336 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
PDCD2-211ENST00000544336 FANCAO15360 1455 aa45.46■■■■■ 4.87
PDCD2-211ENST00000544336 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.45■■■■■ 4.87
PDCD2-211ENST00000544336 AKNAQ7Z591 1439 aa45.45■■■■■ 4.87
PDCD2-211ENST00000544336 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
PDCD2-211ENST00000544336 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.42■■■■■ 4.86
PDCD2-211ENST00000544336 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.42■■■■■ 4.86
PDCD2-211ENST00000544336 RICTORQ6R327 1708 aa45.42■■■■■ 4.86
PDCD2-211ENST00000544336 FMN1Q68DA7 1419 aa45.39■■■■■ 4.86
PDCD2-211ENST00000544336 HECW1Q76N89 1606 aa45.39■■■■■ 4.86
PDCD2-211ENST00000544336 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
PDCD2-211ENST00000544336 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.35■■■■■ 4.85
PDCD2-211ENST00000544336 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.35■■■■■ 4.85
PDCD2-211ENST00000544336 PTPRMP28827 1452 aa45.31■■■■■ 4.84
PDCD2-211ENST00000544336 MADDQ8WXG6 1647 aa45.27■■■■■ 4.84
PDCD2-211ENST00000544336 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
PDCD2-211ENST00000544336 PLCH2O75038 1416 aa45.21■■■■■ 4.83
PDCD2-211ENST00000544336 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.21■■■■■ 4.83
PDCD2-211ENST00000544336 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.18■■■■■ 4.82
PDCD2-211ENST00000544336 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.17■■■■■ 4.82
PDCD2-211ENST00000544336 KIF14Q15058 1648 aa45.17■■■■■ 4.82
PDCD2-211ENST00000544336 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
PDCD2-211ENST00000544336 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.15■■■■■ 4.82
PDCD2-211ENST00000544336 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.15■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms