RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543823.1

SYTL1-208, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-208ENST00000543823 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
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SYTL1-208ENST00000543823 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.28■■■□□ 2.12
SYTL1-208ENST00000543823 PBRM1Q86U86 1689 aa28.27■■■□□ 2.12
SYTL1-208ENST00000543823 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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SYTL1-208ENST00000543823 IFT140Q96RY7 1462 aa28.2■■■□□ 2.1
SYTL1-208ENST00000543823 ADAMTS12P58397 1594 aa28.15■■■□□ 2.1
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SYTL1-208ENST00000543823 CEP170Q5SW79 1584 aa27.74■■■□□ 2.03
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SYTL1-208ENST00000543823 PTPRKQ15262 1439 aa27.39■■□□□ 1.98
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SYTL1-208ENST00000543823 ABCC5O15440 1437 aa26.98■■□□□ 1.91
SYTL1-208ENST00000543823 DAPK1P53355 1430 aa26.97■■□□□ 1.91
SYTL1-208ENST00000543823 MIER1Q8N108 512 aa26.97■■□□□ 1.91
SYTL1-208ENST00000543823 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.95■■□□□ 1.91
SYTL1-208ENST00000543823 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.95■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.95■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
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