RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539594.5

ESRRA-206, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-206ENST00000539594 JPH4Q96JJ6 628 aa47.33■■■■■ 5.17
ESRRA-206ENST00000539594 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.27■■■■■ 5.16
ESRRA-206ENST00000539594 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.27■■■■■ 5.16
ESRRA-206ENST00000539594 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
ESRRA-206ENST00000539594 EEA1Q15075 1411 aa47.06■■■■■ 5.12
ESRRA-206ENST00000539594 PRXQ9BXM0 1461 aa47.05■■■■■ 5.12
ESRRA-206ENST00000539594 IQGAP2Q13576 1575 aa47.05■■■■■ 5.12
ESRRA-206ENST00000539594 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.04■■■■■ 5.12
ESRRA-206ENST00000539594 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.97■■■■■ 5.11
ESRRA-206ENST00000539594 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.88■■■■■ 5.09
ESRRA-206ENST00000539594 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.85■■■■■ 5.09
ESRRA-206ENST00000539594 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.79■■■■■ 5.08
ESRRA-206ENST00000539594 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.71■■■■■ 5.07
ESRRA-206ENST00000539594 DISP1Q96F81 1524 aa46.69■■■■■ 5.06
ESRRA-206ENST00000539594 PTPRGP23470 1445 aa46.68■■■■■ 5.06
ESRRA-206ENST00000539594 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
ESRRA-206ENST00000539594 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
ESRRA-206ENST00000539594 KIAA0556O60303 1618 aa46.58■■■■■ 5.05
ESRRA-206ENST00000539594 GOLGA3Q08378 1498 aa46.57■■■■■ 5.04
ESRRA-206ENST00000539594 KIF21BO75037 1637 aa46.54■■■■■ 5.04
ESRRA-206ENST00000539594 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.54■■■■■ 5.04
ESRRA-206ENST00000539594 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.52■■■■■ 5.04
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ESRRA-206ENST00000539594 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.14■■■■■ 4.98
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ESRRA-206ENST00000539594 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.1■■■■■ 4.97
ESRRA-206ENST00000539594 ABCA8O94911 1581 aa46.09■■■■■ 4.97
ESRRA-206ENST00000539594 P3H3Q8IVL6 736 aa46.08■■■■■ 4.97
ESRRA-206ENST00000539594 DIP2BQ9P265 1576 aa46.04■■■■■ 4.96
ESRRA-206ENST00000539594 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.03■■■■■ 4.96
ESRRA-206ENST00000539594 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.01■■■■■ 4.96
ESRRA-206ENST00000539594 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.01■■■■■ 4.96
ESRRA-206ENST00000539594 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
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ESRRA-206ENST00000539594 ASXL2Q76L83 1435 aa45.99■■■■■ 4.95
ESRRA-206ENST00000539594 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.88■■■■■ 4.94
ESRRA-206ENST00000539594 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.82■■■■■ 4.93
ESRRA-206ENST00000539594 GLI2P10070 1586 aa45.79■■■■■ 4.92
ESRRA-206ENST00000539594 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.75■■■■■ 4.91
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ESRRA-206ENST00000539594 ATP10BO94823 1461 aa45.69■■■■■ 4.91
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.69■■■■■ 4.91
ESRRA-206ENST00000539594 TSPOAP1O95153 1857 aa45.65■■■■■ 4.9
ESRRA-206ENST00000539594 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
ESRRA-206ENST00000539594 FMN1Q68DA7 1419 aa45.61■■■■■ 4.89
ESRRA-206ENST00000539594 ARID3CA6NKF2 412 aa45.58■■■■■ 4.89
ESRRA-206ENST00000539594 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.55■■■■■ 4.88
ESRRA-206ENST00000539594 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
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ESRRA-206ENST00000539594 KCNH8Q96L42 1107 aa45.49■■■■■ 4.87
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ESRRA-206ENST00000539594 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.44■■■■■ 4.86
ESRRA-206ENST00000539594 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.41■■■■■ 4.86
ESRRA-206ENST00000539594 HECW1Q76N89 1606 aa45.4■■■■■ 4.86
ESRRA-206ENST00000539594 CLIP1P30622 1438 aa45.38■■■■■ 4.86
ESRRA-206ENST00000539594 KDM6BO15054 1643 aa45.36■■■■■ 4.85
ESRRA-206ENST00000539594 CD109Q6YHK3 1445 aa45.35■■■■■ 4.85
ESRRA-206ENST00000539594 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.34■■■■■ 4.85
ESRRA-206ENST00000539594 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.3■■■■■ 4.84
ESRRA-206ENST00000539594 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
ESRRA-206ENST00000539594 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.26■■■■■ 4.84
ESRRA-206ENST00000539594 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
ESRRA-206ENST00000539594 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.2■■■■■ 4.83
ESRRA-206ENST00000539594 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
ESRRA-206ENST00000539594 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
ESRRA-206ENST00000539594 CEP162Q5TB80 1403 aa45.12■■■■■ 4.81
ESRRA-206ENST00000539594 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.1■■■■■ 4.81
ESRRA-206ENST00000539594 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.08■■■■■ 4.81
ESRRA-206ENST00000539594 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.06■■■■■ 4.8
ESRRA-206ENST00000539594 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.04■■■■■ 4.8
ESRRA-206ENST00000539594 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.03■■■■■ 4.8
ESRRA-206ENST00000539594 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
ESRRA-206ENST00000539594 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.81e-6■■■■□ 24.7
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ESRRA-206ENST00000539594 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.92■■■■■ 4.78
ESRRA-206ENST00000539594 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.91■■■■■ 4.78
ESRRA-206ENST00000539594 KIF14Q15058 1648 aa44.88■■■■■ 4.78
ESRRA-206ENST00000539594 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.83■■■■■ 4.77
ESRRA-206ENST00000539594 FANCAO15360 1455 aa44.78■■■■■ 4.76
ESRRA-206ENST00000539594 PLCH2O75038 1416 aa44.77■■■■■ 4.76
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ESRRA-206ENST00000539594 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.62■■■■■ 4.73
ESRRA-206ENST00000539594 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
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ESRRA-206ENST00000539594 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.56■■■■■ 4.72
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.55■■■■■ 4.72
ESRRA-206ENST00000539594 ADGRL1O94910 1474 aa44.54■■■■■ 4.72
ESRRA-206ENST00000539594 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.53■■■■■ 4.72
ESRRA-206ENST00000539594 RICTORQ6R327 1708 aa44.52■■■■■ 4.72
ESRRA-206ENST00000539594 PREX2Q70Z35 1606 aa44.51■■■■■ 4.72
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