RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 ARAP1Q96P48 1450 aa31.53■■■□□ 2.64
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.53■■■□□ 2.64
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.49■■■□□ 2.63
PACSIN3-211ENST00000539589 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIN2AQ12879 1464 aa31.35■■■□□ 2.61
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNJ2O15056 1496 aa31.33■■■□□ 2.61
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.29■■■□□ 2.6
PACSIN3-211ENST00000539589 P3H3Q8IVL6 736 aa31.26■■■□□ 2.59
PACSIN3-211ENST00000539589 IQGAP2Q13576 1575 aa31.25■■■□□ 2.59
PACSIN3-211ENST00000539589 SAMD9Q5K651 1589 aa31.25■■■□□ 2.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.22■■■□□ 2.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP170Q5SW79 1584 aa31.2■■■□□ 2.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FBLN2P98095 1184 aa31.19■■■□□ 2.58
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.18■■■□□ 2.58
PACSIN3-211ENST00000539589 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
PACSIN3-211ENST00000539589 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP160Q12769 1436 aa31.13■■■□□ 2.57
PACSIN3-211ENST00000539589 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.11■■■□□ 2.57
PACSIN3-211ENST00000539589 CHD1O14646 1710 aa31.1■■■□□ 2.57
PACSIN3-211ENST00000539589 APLP2Q06481 763 aa31.07■■■□□ 2.56
PACSIN3-211ENST00000539589 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
PACSIN3-211ENST00000539589 DISP1Q96F81 1524 aa31■■■□□ 2.55
PACSIN3-211ENST00000539589 FMN1Q68DA7 1419 aa30.99■■■□□ 2.55
PACSIN3-211ENST00000539589 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.97■■■□□ 2.55
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA0556O60303 1618 aa30.96■■■□□ 2.55
PACSIN3-211ENST00000539589 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.95■■■□□ 2.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TIAM1Q13009 1591 aa30.94■■■□□ 2.54
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K1Q13233 1512 aa30.92■■■□□ 2.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.89■■■□□ 2.54
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.89■■■□□ 2.54
PACSIN3-211ENST00000539589 JPH4Q96JJ6 628 aa30.88■■■□□ 2.53
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.78■■■□□ 2.52
PACSIN3-211ENST00000539589 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.74■■■□□ 2.51
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SHROOM2Q13796 1616 aa30.73■■■□□ 2.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
PACSIN3-211ENST00000539589 HECW1Q76N89 1606 aa30.71■■■□□ 2.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.7■■■□□ 2.5
PACSIN3-211ENST00000539589 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
PACSIN3-211ENST00000539589 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.65■■■□□ 2.5
PACSIN3-211ENST00000539589 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.61■■■□□ 2.49
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
PACSIN3-211ENST00000539589 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.59■■■□□ 2.49
PACSIN3-211ENST00000539589 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.59■■■□□ 2.49
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.57■■■□□ 2.48
PACSIN3-211ENST00000539589 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
PACSIN3-211ENST00000539589 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.54■■■□□ 2.48
PACSIN3-211ENST00000539589 ARID3CA6NKF2 412 aa30.54■■■□□ 2.48
PACSIN3-211ENST00000539589 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.52■■■□□ 2.48
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCA8O94911 1581 aa30.52■■■□□ 2.48
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
PACSIN3-211ENST00000539589 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.5■■■□□ 2.47
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRGP23470 1445 aa30.48■■■□□ 2.47
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.44■■■□□ 2.46
PACSIN3-211ENST00000539589 NCOA2Q15596 1464 aa30.41■■■□□ 2.46
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF11O15085 1522 aa30.38■■■□□ 2.45
PACSIN3-211ENST00000539589 OSCARQ8IYS5 282 aa30.35■■■□□ 2.45
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP10BO94823 1461 aa30.33■■■□□ 2.45
PACSIN3-211ENST00000539589 UACAQ9BZF9 1416 aa30.31■■■□□ 2.44
PACSIN3-211ENST00000539589 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.28■■■□□ 2.44
PACSIN3-211ENST00000539589 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.26■■■□□ 2.44
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PACSIN3-211ENST00000539589 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC2Q92887 1545 aa30.23■■■□□ 2.43
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
PACSIN3-211ENST00000539589 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.19■■■□□ 2.42
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF14Q15058 1648 aa30.18■■■□□ 2.42
PACSIN3-211ENST00000539589 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGAEP38570 1179 aa30.18■■■□□ 2.42
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.15■■■□□ 2.42
PACSIN3-211ENST00000539589 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.14■■■□□ 2.41
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.12■■■□□ 2.41
PACSIN3-211ENST00000539589 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PACSIN3-211ENST00000539589 MIA2Q96PC5 1412 aa30.07■■■□□ 2.4
PACSIN3-211ENST00000539589 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.05■■■□□ 2.4
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.04■■■□□ 2.4
PACSIN3-211ENST00000539589 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRKQ15262 1439 aa30.02■■■□□ 2.4
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30■■■□□ 2.39
PACSIN3-211ENST00000539589 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30■■■□□ 2.39
PACSIN3-211ENST00000539589 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PACSIN3-211ENST00000539589 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.89■■■□□ 2.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.89■■■□□ 2.37
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-211ENST00000539589 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-211ENST00000539589 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.85■■■□□ 2.37
PACSIN3-211ENST00000539589 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
PACSIN3-211ENST00000539589 PREX2Q70Z35 1606 aa29.82■■■□□ 2.36
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