RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.18■■■□□ 2.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ARAP1Q96P48 1450 aa32.14■■■□□ 2.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.11■■■□□ 2.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FBLN2P98095 1184 aa32.1■■■□□ 2.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IQGAP2Q13576 1575 aa32.03■■■□□ 2.72
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.03■■■□□ 2.72
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.02■■■□□ 2.72
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CEP170Q5SW79 1584 aa31.98■■■□□ 2.71
MIR9-3HG-202ENST00000538734 P3H3Q8IVL6 736 aa31.97■■■□□ 2.71
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUP160Q12769 1436 aa31.97■■■□□ 2.71
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SAMD9Q5K651 1589 aa31.95■■■□□ 2.71
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.91■■■□□ 2.7
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHD1O14646 1710 aa31.9■■■□□ 2.7
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.89■■■□□ 2.7
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.69
MIR9-3HG-202ENST00000538734 APLP2Q06481 763 aa31.81■■■□□ 2.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FMN1Q68DA7 1419 aa31.77■■■□□ 2.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 JPH4Q96JJ6 628 aa31.76■■■□□ 2.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DISP1Q96F81 1524 aa31.75■■■□□ 2.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIAA0556O60303 1618 aa31.7■■■□□ 2.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.69■■■□□ 2.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.67■■■□□ 2.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.65■■■□□ 2.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.62■■■□□ 2.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAP3K1Q13233 1512 aa31.6■■■□□ 2.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TIAM1Q13009 1591 aa31.55■■■□□ 2.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SHROOM2Q13796 1616 aa31.55■■■□□ 2.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.55■■■□□ 2.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.48■■■□□ 2.63
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.44■■■□□ 2.62
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.43■■■□□ 2.62
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HECW1Q76N89 1606 aa31.43■■■□□ 2.62
MIR9-3HG-202ENST00000538734 OSCARQ8IYS5 282 aa31.4■■■□□ 2.62
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.37■■■□□ 2.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.36■■■□□ 2.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PTPRGP23470 1445 aa31.34■■■□□ 2.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.34■■■□□ 2.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.34■■■□□ 2.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCA8O94911 1581 aa31.27■■■□□ 2.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ARID3CA6NKF2 412 aa31.25■■■□□ 2.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.24■■■□□ 2.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.18■■■□□ 2.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.17■■■□□ 2.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UACAQ9BZF9 1416 aa31.15■■■□□ 2.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.13■■■□□ 2.57
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATP10BO94823 1461 aa31.09■■■□□ 2.57
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NCOA2Q15596 1464 aa31.07■■■□□ 2.56
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.05■■■□□ 2.56
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCC2Q92887 1545 aa31.04■■■□□ 2.56
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ARHGEF11O15085 1522 aa31.02■■■□□ 2.56
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.99■■■□□ 2.55
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.97■■■□□ 2.55
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.93■■■□□ 2.54
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.92■■■□□ 2.54
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.87■■■□□ 2.53
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.87■■■□□ 2.53
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF14Q15058 1648 aa30.83■■■□□ 2.53
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MIA2Q96PC5 1412 aa30.79■■■□□ 2.52
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ITGAEP38570 1179 aa30.78■■■□□ 2.52
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.76■■■□□ 2.51
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.74■■■□□ 2.51
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.68■■■□□ 2.5
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.67■■■□□ 2.5
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.67■■■□□ 2.5
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.67■■■□□ 2.5
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.64■■■□□ 2.5
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KCNH8Q96L42 1107 aa30.63■■■□□ 2.49
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.61■■■□□ 2.49
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.49
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HRCP23327 699 aa30.59■■■□□ 2.49
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.59■■■□□ 2.49
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PTPRKQ15262 1439 aa30.57■■■□□ 2.48
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.57■■■□□ 2.48
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.55■■■□□ 2.48
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ASXL2Q76L83 1435 aa30.54■■■□□ 2.48
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.53■■■□□ 2.48
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.5 ms