RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538064.1

LRRK1-211, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene LRRK1, Length 493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-211ENST00000538064 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
LRRK1-211ENST00000538064 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.79■■□□□ 1.72
LRRK1-211ENST00000538064 JPH4Q96JJ6 628 aa25.78■■□□□ 1.72
LRRK1-211ENST00000538064 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.75■■□□□ 1.71
LRRK1-211ENST00000538064 IQGAP2Q13576 1575 aa25.65■■□□□ 1.7
LRRK1-211ENST00000538064 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.62■■□□□ 1.69
LRRK1-211ENST00000538064 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.6■■□□□ 1.69
LRRK1-211ENST00000538064 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.6■■□□□ 1.69
LRRK1-211ENST00000538064 MAPKBP1O60336 1514 aa25.54■■□□□ 1.68
LRRK1-211ENST00000538064 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.52■■□□□ 1.68
LRRK1-211ENST00000538064 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.51■■□□□ 1.67
LRRK1-211ENST00000538064 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.48■■□□□ 1.67
LRRK1-211ENST00000538064 DISP1Q96F81 1524 aa25.47■■□□□ 1.67
LRRK1-211ENST00000538064 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.45■■□□□ 1.67
LRRK1-211ENST00000538064 PTPRGP23470 1445 aa25.45■■□□□ 1.66
LRRK1-211ENST00000538064 DIP2BQ9P265 1576 aa25.44■■□□□ 1.66
LRRK1-211ENST00000538064 KIAA0556O60303 1618 aa25.43■■□□□ 1.66
LRRK1-211ENST00000538064 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.42■■□□□ 1.66
LRRK1-211ENST00000538064 PRXQ9BXM0 1461 aa25.41■■□□□ 1.66
LRRK1-211ENST00000538064 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
LRRK1-211ENST00000538064 ABCC2Q92887 1545 aa25.37■■□□□ 1.65
LRRK1-211ENST00000538064 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.36■■□□□ 1.65
LRRK1-211ENST00000538064 UACAQ9BZF9 1416 aa25.3■■□□□ 1.64
LRRK1-211ENST00000538064 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
LRRK1-211ENST00000538064 GOLGA3Q08378 1498 aa25.28■■□□□ 1.64
LRRK1-211ENST00000538064 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.27■■□□□ 1.64
LRRK1-211ENST00000538064 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
LRRK1-211ENST00000538064 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.23■■□□□ 1.63
LRRK1-211ENST00000538064 EEA1Q15075 1411 aa25.23■■□□□ 1.63
LRRK1-211ENST00000538064 TSPOAP1O95153 1857 aa25.23■■□□□ 1.63
LRRK1-211ENST00000538064 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.21■■□□□ 1.63
LRRK1-211ENST00000538064 ASXL2Q76L83 1435 aa25.21■■□□□ 1.63
LRRK1-211ENST00000538064 GLI2P10070 1586 aa25.2■■□□□ 1.62
LRRK1-211ENST00000538064 ABCA8O94911 1581 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRK1-211ENST00000538064 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRK1-211ENST00000538064 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
LRRK1-211ENST00000538064 KDM6BO15054 1643 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRK1-211ENST00000538064 SAMD9Q5K651 1589 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRK1-211ENST00000538064 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.09■■□□□ 1.61
LRRK1-211ENST00000538064 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
LRRK1-211ENST00000538064 KIF21BO75037 1637 aa25.08■■□□□ 1.6
LRRK1-211ENST00000538064 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.05■■□□□ 1.6
LRRK1-211ENST00000538064 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRK1-211ENST00000538064 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.95■■□□□ 1.58
LRRK1-211ENST00000538064 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRK1-211ENST00000538064 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LRRK1-211ENST00000538064 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRK1-211ENST00000538064 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRK1-211ENST00000538064 P3H3Q8IVL6 736 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRK1-211ENST00000538064 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
LRRK1-211ENST00000538064 ATP10BO94823 1461 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRK1-211ENST00000538064 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRK1-211ENST00000538064 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRK1-211ENST00000538064 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LRRK1-211ENST00000538064 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
LRRK1-211ENST00000538064 CD109Q6YHK3 1445 aa24.8■■□□□ 1.56
LRRK1-211ENST00000538064 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.79■■□□□ 1.56
LRRK1-211ENST00000538064 ARID3CA6NKF2 412 aa24.76■■□□□ 1.55
LRRK1-211ENST00000538064 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
LRRK1-211ENST00000538064 KCNH8Q96L42 1107 aa24.75■■□□□ 1.55
LRRK1-211ENST00000538064 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
LRRK1-211ENST00000538064 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.65■■□□□ 1.54
LRRK1-211ENST00000538064 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.64■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 HECW1Q76N89 1606 aa24.63■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 FMN1Q68DA7 1419 aa24.61■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.61■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.61■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 ADGRL1O94910 1474 aa24.59■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 NEO1Q92859 1461 aa24.59■■□□□ 1.53
LRRK1-211ENST00000538064 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.57■■□□□ 1.52
LRRK1-211ENST00000538064 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.56■■□□□ 1.52
LRRK1-211ENST00000538064 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.55■■□□□ 1.52
LRRK1-211ENST00000538064 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
LRRK1-211ENST00000538064 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.53■■□□□ 1.52
LRRK1-211ENST00000538064 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.52■■□□□ 1.52
LRRK1-211ENST00000538064 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.52■■□□□ 1.52
LRRK1-211ENST00000538064 RICTORQ6R327 1708 aa24.46■■□□□ 1.51
LRRK1-211ENST00000538064 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LRRK1-211ENST00000538064 FANCAO15360 1455 aa24.44■■□□□ 1.5
LRRK1-211ENST00000538064 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.44■■□□□ 1.5
LRRK1-211ENST00000538064 KIF14Q15058 1648 aa24.43■■□□□ 1.5
LRRK1-211ENST00000538064 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.4■■□□□ 1.5
LRRK1-211ENST00000538064 AKNAQ7Z591 1439 aa24.39■■□□□ 1.5
LRRK1-211ENST00000538064 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.38■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 RAPGEF3O95398 923 aa24.37■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.37■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.36■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 PLCH2O75038 1416 aa24.35■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.34■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 CLIP1P30622 1438 aa24.34■■□□□ 1.49
LRRK1-211ENST00000538064 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.3■■□□□ 1.48
LRRK1-211ENST00000538064 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.3■■□□□ 1.48
LRRK1-211ENST00000538064 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms