RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535739.5

LTBR-205, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5

Gene LTBR, Length 928 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-205ENST00000535739 KIF27Q86VH2 1401 aa36.03■■■■□ 3.36
LTBR-205ENST00000535739 CUL7Q14999 1698 aa35.97■■■■□ 3.35
LTBR-205ENST00000535739 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.9■■■■□ 3.34
LTBR-205ENST00000535739 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.86■■■■□ 3.33
LTBR-205ENST00000535739 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.8■■■■□ 3.32
LTBR-205ENST00000535739 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.75■■■■□ 3.31
LTBR-205ENST00000535739 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
LTBR-205ENST00000535739 MAPKBP1O60336 1514 aa35.66■■■■□ 3.3
LTBR-205ENST00000535739 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.65■■■■□ 3.3
LTBR-205ENST00000535739 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.64■■■■□ 3.3
LTBR-205ENST00000535739 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
LTBR-205ENST00000535739 PTPRGP23470 1445 aa35.57■■■■□ 3.29
LTBR-205ENST00000535739 IQGAP2Q13576 1575 aa35.57■■■■□ 3.28
LTBR-205ENST00000535739 DIP2BQ9P265 1576 aa35.57■■■■□ 3.28
LTBR-205ENST00000535739 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
LTBR-205ENST00000535739 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.54■■■■□ 3.28
LTBR-205ENST00000535739 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.51■■■■□ 3.28
LTBR-205ENST00000535739 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.47■■■■□ 3.27
LTBR-205ENST00000535739 TSPOAP1O95153 1857 aa35.41■■■■□ 3.26
LTBR-205ENST00000535739 DISP1Q96F81 1524 aa35.41■■■■□ 3.26
LTBR-205ENST00000535739 ABCC2Q92887 1545 aa35.38■■■■□ 3.25
LTBR-205ENST00000535739 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.34■■■■□ 3.25
LTBR-205ENST00000535739 UACAQ9BZF9 1416 aa35.31■■■■□ 3.24
LTBR-205ENST00000535739 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.3■■■■□ 3.24
LTBR-205ENST00000535739 ASXL2Q76L83 1435 aa35.27■■■■□ 3.24
LTBR-205ENST00000535739 KDM6BO15054 1643 aa35.27■■■■□ 3.24
LTBR-205ENST00000535739 KIAA0556O60303 1618 aa35.26■■■■□ 3.24
LTBR-205ENST00000535739 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.23■■■■□ 3.23
LTBR-205ENST00000535739 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.23■■■■□ 3.23
LTBR-205ENST00000535739 GLI2P10070 1586 aa35.16■■■■□ 3.22
LTBR-205ENST00000535739 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.16■■■■□ 3.22
LTBR-205ENST00000535739 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
LTBR-205ENST00000535739 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
LTBR-205ENST00000535739 PRXQ9BXM0 1461 aa35.1■■■■□ 3.21
LTBR-205ENST00000535739 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
LTBR-205ENST00000535739 GOLGA3Q08378 1498 aa35.03■■■■□ 3.2
LTBR-205ENST00000535739 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.99■■■■□ 3.19
LTBR-205ENST00000535739 ABCA8O94911 1581 aa34.93■■■■□ 3.18
LTBR-205ENST00000535739 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.92■■■■□ 3.18
LTBR-205ENST00000535739 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.92■■■■□ 3.18
LTBR-205ENST00000535739 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
LTBR-205ENST00000535739 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.85■■■■□ 3.17
LTBR-205ENST00000535739 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.85■■■■□ 3.17
LTBR-205ENST00000535739 P3H3Q8IVL6 736 aa34.81■■■■□ 3.16
LTBR-205ENST00000535739 KCNH8Q96L42 1107 aa34.79■■■■□ 3.16
LTBR-205ENST00000535739 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.73■■■■□ 3.15
LTBR-205ENST00000535739 CD109Q6YHK3 1445 aa34.72■■■■□ 3.15
LTBR-205ENST00000535739 ARID3CA6NKF2 412 aa34.71■■■■□ 3.15
LTBR-205ENST00000535739 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
LTBR-205ENST00000535739 SAMD9Q5K651 1589 aa34.7■■■■□ 3.14
LTBR-205ENST00000535739 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.67■■■■□ 3.14
LTBR-205ENST00000535739 EEA1Q15075 1411 aa34.66■■■■□ 3.14
LTBR-205ENST00000535739 ATP10BO94823 1461 aa34.65■■■■□ 3.14
LTBR-205ENST00000535739 ADGRL1O94910 1474 aa34.63■■■■□ 3.13
LTBR-205ENST00000535739 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.58■■■■□ 3.13
LTBR-205ENST00000535739 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
LTBR-205ENST00000535739 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.47■■■■□ 3.11
LTBR-205ENST00000535739 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.47■■■■□ 3.11
LTBR-205ENST00000535739 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
LTBR-205ENST00000535739 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
LTBR-205ENST00000535739 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
LTBR-205ENST00000535739 KIF21BO75037 1637 aa34.43■■■■□ 3.1
LTBR-205ENST00000535739 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.4■■■■□ 3.1
LTBR-205ENST00000535739 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.32■■■■□ 3.08
LTBR-205ENST00000535739 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.3■■■■□ 3.08
LTBR-205ENST00000535739 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.27■■■■□ 3.08
LTBR-205ENST00000535739 NEO1Q92859 1461 aa34.26■■■■□ 3.07
LTBR-205ENST00000535739 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.24■■■■□ 3.07
LTBR-205ENST00000535739 RAPGEF3O95398 923 aa34.24■■■■□ 3.07
LTBR-205ENST00000535739 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.23■■■■□ 3.07
LTBR-205ENST00000535739 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
LTBR-205ENST00000535739 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.17■■■■□ 3.06
LTBR-205ENST00000535739 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.15■■■■□ 3.06
LTBR-205ENST00000535739 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
LTBR-205ENST00000535739 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.13■■■■□ 3.051e-6■■■■■ 27.4
LTBR-205ENST00000535739 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.09■■■■□ 3.05
LTBR-205ENST00000535739 FANCAO15360 1455 aa34.06■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.06■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 AKNAQ7Z591 1439 aa34.05■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 RICTORQ6R327 1708 aa34.04■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.04■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.03■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 FMN1Q68DA7 1419 aa34.02■■■■□ 3.04
LTBR-205ENST00000535739 HECW1Q76N89 1606 aa33.99■■■■□ 3.03
LTBR-205ENST00000535739 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.97■■■■□ 3.03
LTBR-205ENST00000535739 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
LTBR-205ENST00000535739 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.95■■■■□ 3.03
LTBR-205ENST00000535739 PTPRMP28827 1452 aa33.94■■■■□ 3.02
LTBR-205ENST00000535739 PLCH2O75038 1416 aa33.9■■■■□ 3.02
LTBR-205ENST00000535739 MADDQ8WXG6 1647 aa33.89■■■■□ 3.02
LTBR-205ENST00000535739 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.87■■■■□ 3.01
LTBR-205ENST00000535739 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.85■■■■□ 3.01
LTBR-205ENST00000535739 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.85■■■■□ 3.01
LTBR-205ENST00000535739 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
LTBR-205ENST00000535739 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
LTBR-205ENST00000535739 KIF14Q15058 1648 aa33.83■■■■□ 3.01
LTBR-205ENST00000535739 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.82■■■■□ 3
LTBR-205ENST00000535739 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.82■■■■□ 3
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