RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	CUL7	Q14999	1698 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PTPRJ-206	ENST00000534219	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.87	■■■■■ 4.45
PTPRJ-206	ENST00000534219	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.83	■■■■■ 4.45
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.77	■■■■■ 4.44
PTPRJ-206	ENST00000534219	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.47	■■■■■ 4.39
PTPRJ-206	ENST00000534219	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.47	■■■■■ 4.39
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
PTPRJ-206	ENST00000534219	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PTPRJ-206	ENST00000534219	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PTPRJ-206	ENST00000534219	PTPRG	P23470	1445 aa		42.36	■■■■■ 4.37
PTPRJ-206	ENST00000534219	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.29	■■■■■ 4.36
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PTPRJ-206	ENST00000534219	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PTPRJ-206	ENST00000534219	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.13	■■■■■ 4.33
PTPRJ-206	ENST00000534219	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.11	■■■■■ 4.33
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PTPRJ-206	ENST00000534219	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.02	■■■■■ 4.32
PTPRJ-206	ENST00000534219	ABCC2	Q92887	1545 aa		42	■■■■■ 4.31
PTPRJ-206	ENST00000534219	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.99	■■■■■ 4.31
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.98	■■■■■ 4.31
PTPRJ-206	ENST00000534219	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.97	■■■■■ 4.31
PTPRJ-206	ENST00000534219	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.96	■■■■■ 4.31
PTPRJ-206	ENST00000534219	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.96	■■■■■ 4.31
PTPRJ-206	ENST00000534219	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
PTPRJ-206	ENST00000534219	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.89	■■■■■ 4.3
PTPRJ-206	ENST00000534219	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.86	■■■■■ 4.29
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.81	■■■■■ 4.28
PTPRJ-206	ENST00000534219	EEA1	Q15075	1411 aa		41.81	■■■■■ 4.28
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
PTPRJ-206	ENST00000534219	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PTPRJ-206	ENST00000534219	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.69	■■■■■ 4.26
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
PTPRJ-206	ENST00000534219	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.64	■■■■■ 4.26
PTPRJ-206	ENST00000534219	GLI2	P10070	1586 aa		41.6	■■■■■ 4.25
PTPRJ-206	ENST00000534219	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PTPRJ-206	ENST00000534219	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.57	■■■■■ 4.25
PTPRJ-206	ENST00000534219	ABCA8	O94911	1581 aa		41.57	■■■■■ 4.25
PTPRJ-206	ENST00000534219	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.56	■■■■■ 4.24
PTPRJ-206	ENST00000534219	KDM6B	O15054	1643 aa		41.55	■■■■■ 4.24
PTPRJ-206	ENST00000534219	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.49	■■■■■ 4.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.45	■■■■■ 4.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.44	■■■■■ 4.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.43	■■■■■ 4.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.38	■■■■■ 4.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIF21B	O75037	1637 aa		41.37	■■■■■ 4.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.37	■■■■■ 4.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.36	■■■■■ 4.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.32	■■■■■ 4.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATP10B	O94823	1461 aa		41.29	■■■■■ 4.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.29	■■■■■ 4.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.27	■■■■■ 4.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.25	■■■■■ 4.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.25	■■■■■ 4.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.25	■■■■■ 4.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.22	■■■■■ 4.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
PTPRJ-206	ENST00000534219	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.14	■■■■■ 4.18
PTPRJ-206	ENST00000534219	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.13	■■■■■ 4.17
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.13	■■■■■ 4.17
PTPRJ-206	ENST00000534219	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.1	■■■■■ 4.17
PTPRJ-206	ENST00000534219	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.01	■■■■■ 4.16
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.96	■■■■■ 4.15
PTPRJ-206	ENST00000534219	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.91	■■■■■ 4.14
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.87	■■■■■ 4.13
PTPRJ-206	ENST00000534219	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.84	■■■■■ 4.13
PTPRJ-206	ENST00000534219	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.79	■■■■■ 4.12
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.78	■■■■■ 4.12
PTPRJ-206	ENST00000534219	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PTPRJ-206	ENST00000534219	NEO1	Q92859	1461 aa		40.71	■■■■■ 4.11
PTPRJ-206	ENST00000534219	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PTPRJ-206	ENST00000534219	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PTPRJ-206	ENST00000534219	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.64	■■■■■ 4.1
PTPRJ-206	ENST00000534219	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	FANCA	O15360	1455 aa		40.55	■■■■■ 4.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.55	■■■■■ 4.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.53	■■■■■ 4.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLCH2	O75038	1416 aa		40.43	■■■■■ 4.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	CLIP1	P30622	1438 aa		40.43	■■■■■ 4.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.43	■■■■■ 4.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIF14	Q15058	1648 aa		40.34	■■■■■ 4.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.26	■■■■■ 4.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.21	■■■■■ 4.03

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