RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532538.1

BRPF3-210, Transcript of bromodomain and PHD finger containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene BRPF3, Length 567 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3-210ENST00000532538 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
BRPF3-210ENST00000532538 KIF27Q86VH2 1401 aa26.5■■□□□ 1.83
BRPF3-210ENST00000532538 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.5■■□□□ 1.83
BRPF3-210ENST00000532538 CUL7Q14999 1698 aa26.49■■□□□ 1.83
BRPF3-210ENST00000532538 IGF1RP08069 1367 aa26.42■■□□□ 1.82
BRPF3-210ENST00000532538 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.39■■□□□ 1.81
BRPF3-210ENST00000532538 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
BRPF3-210ENST00000532538 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.36■■□□□ 1.81
BRPF3-210ENST00000532538 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.33■■□□□ 1.81
BRPF3-210ENST00000532538 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.32■■□□□ 1.8
BRPF3-210ENST00000532538 TSPOAP1O95153 1857 aa26.28■■□□□ 1.8
BRPF3-210ENST00000532538 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.27■■□□□ 1.8
BRPF3-210ENST00000532538 MAPKBP1O60336 1514 aa26.27■■□□□ 1.8
BRPF3-210ENST00000532538 DIP2BQ9P265 1576 aa26.23■■□□□ 1.79
BRPF3-210ENST00000532538 PTPRGP23470 1445 aa26.22■■□□□ 1.79
BRPF3-210ENST00000532538 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.22■■□□□ 1.79
BRPF3-210ENST00000532538 IQGAP2Q13576 1575 aa26.2■■□□□ 1.78
BRPF3-210ENST00000532538 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.15■■□□□ 1.78
BRPF3-210ENST00000532538 KDM6BO15054 1643 aa26.12■■□□□ 1.77
BRPF3-210ENST00000532538 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.07■■□□□ 1.76
BRPF3-210ENST00000532538 ABCC2Q92887 1545 aa26.05■■□□□ 1.76
BRPF3-210ENST00000532538 UACAQ9BZF9 1416 aa26■■□□□ 1.75
BRPF3-210ENST00000532538 ASXL2Q76L83 1435 aa25.99■■□□□ 1.75
BRPF3-210ENST00000532538 DISP1Q96F81 1524 aa25.98■■□□□ 1.75
BRPF3-210ENST00000532538 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.98■■□□□ 1.75
BRPF3-210ENST00000532538 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.98■■□□□ 1.75
BRPF3-210ENST00000532538 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.95■■□□□ 1.74
BRPF3-210ENST00000532538 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.94■■□□□ 1.74
BRPF3-210ENST00000532538 KIAA0556O60303 1618 aa25.94■■□□□ 1.74
BRPF3-210ENST00000532538 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
BRPF3-210ENST00000532538 GLI2P10070 1586 aa25.89■■□□□ 1.73
BRPF3-210ENST00000532538 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
BRPF3-210ENST00000532538 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.84■■□□□ 1.73
BRPF3-210ENST00000532538 GOLGA3Q08378 1498 aa25.81■■□□□ 1.72
BRPF3-210ENST00000532538 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
BRPF3-210ENST00000532538 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.79■■□□□ 1.72
BRPF3-210ENST00000532538 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.78■■□□□ 1.72
BRPF3-210ENST00000532538 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
BRPF3-210ENST00000532538 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.77■■□□□ 1.72
BRPF3-210ENST00000532538 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.72■■□□□ 1.71
BRPF3-210ENST00000532538 KCNH8Q96L42 1107 aa25.72■■□□□ 1.71
BRPF3-210ENST00000532538 PRXQ9BXM0 1461 aa25.69■■□□□ 1.7
BRPF3-210ENST00000532538 P3H3Q8IVL6 736 aa25.67■■□□□ 1.7
BRPF3-210ENST00000532538 ABCA8O94911 1581 aa25.66■■□□□ 1.7
BRPF3-210ENST00000532538 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.64■■□□□ 1.7
BRPF3-210ENST00000532538 ARID3CA6NKF2 412 aa25.64■■□□□ 1.7
BRPF3-210ENST00000532538 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
BRPF3-210ENST00000532538 ADGRL1O94910 1474 aa25.61■■□□□ 1.69
BRPF3-210ENST00000532538 CD109Q6YHK3 1445 aa25.61■■□□□ 1.69
BRPF3-210ENST00000532538 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.58■■□□□ 1.69
BRPF3-210ENST00000532538 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
BRPF3-210ENST00000532538 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
BRPF3-210ENST00000532538 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
BRPF3-210ENST00000532538 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.52■■□□□ 1.68
BRPF3-210ENST00000532538 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.46■■□□□ 1.67
BRPF3-210ENST00000532538 ATP10BO94823 1461 aa25.46■■□□□ 1.67
BRPF3-210ENST00000532538 SAMD9Q5K651 1589 aa25.45■■□□□ 1.66
BRPF3-210ENST00000532538 EEA1Q15075 1411 aa25.42■■□□□ 1.66
BRPF3-210ENST00000532538 KIF21BO75037 1637 aa25.39■■□□□ 1.66
BRPF3-210ENST00000532538 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.37■■□□□ 1.65
BRPF3-210ENST00000532538 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.34■■□□□ 1.65
BRPF3-210ENST00000532538 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
BRPF3-210ENST00000532538 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.31■■□□□ 1.64
BRPF3-210ENST00000532538 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.3■■□□□ 1.64
BRPF3-210ENST00000532538 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.28■■□□□ 1.64
BRPF3-210ENST00000532538 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.27■■□□□ 1.64
BRPF3-210ENST00000532538 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
BRPF3-210ENST00000532538 RAPGEF3O95398 923 aa25.26■■□□□ 1.63
BRPF3-210ENST00000532538 NEO1Q92859 1461 aa25.23■■□□□ 1.63
BRPF3-210ENST00000532538 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.22■■□□□ 1.63
BRPF3-210ENST00000532538 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
BRPF3-210ENST00000532538 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
BRPF3-210ENST00000532538 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
BRPF3-210ENST00000532538 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
BRPF3-210ENST00000532538 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.15■■□□□ 1.62
BRPF3-210ENST00000532538 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.11■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.1■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 FANCAO15360 1455 aa25.09■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 AKNAQ7Z591 1439 aa25.09■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.09■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.08■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 RICTORQ6R327 1708 aa25.08■■□□□ 1.61
BRPF3-210ENST00000532538 PTPRMP28827 1452 aa25.06■■□□□ 1.6
BRPF3-210ENST00000532538 MADDQ8WXG6 1647 aa25.04■■□□□ 1.6
BRPF3-210ENST00000532538 HECW1Q76N89 1606 aa25.04■■□□□ 1.6
BRPF3-210ENST00000532538 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.03■■□□□ 1.6
BRPF3-210ENST00000532538 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.02■■□□□ 1.6
BRPF3-210ENST00000532538 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BRPF3-210ENST00000532538 FMN1Q68DA7 1419 aa25.01■■□□□ 1.59
BRPF3-210ENST00000532538 CHIC1Q5VXU3 224 aa25■■□□□ 1.59
BRPF3-210ENST00000532538 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.99■■□□□ 1.59
BRPF3-210ENST00000532538 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
BRPF3-210ENST00000532538 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.96■■□□□ 1.59
BRPF3-210ENST00000532538 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.95■■□□□ 1.59
BRPF3-210ENST00000532538 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.95■■□□□ 1.58
BRPF3-210ENST00000532538 MLECQ14165 292 aa24.93■■□□□ 1.58
BRPF3-210ENST00000532538 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.93■■□□□ 1.58
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