RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 JPH4Q96JJ6 628 aa40.82■■■■■ 4.13
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.73■■■■■ 4.11
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.72■■■■■ 4.11
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.43■■■■■ 4.06
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IQGAP2Q13576 1575 aa40.37■■■■■ 4.05
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.35■■■■■ 4.05
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.31■■■■■ 4.04
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PTPRGP23470 1445 aa40.25■■■■■ 4.03
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.23■■■■■ 4.03
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.21■■■■■ 4.03
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAPKBP1O60336 1514 aa40.16■■■■■ 4.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.14■■■■■ 4.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PRXQ9BXM0 1461 aa40.11■■■■■ 4.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DISP1Q96F81 1524 aa40.11■■■■■ 4.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.05■■■■■ 4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.03■■■■■ 4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.02■■■■■ 4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.98■■■■□ 3.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIAA0556O60303 1618 aa39.98■■■■□ 3.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCC2Q92887 1545 aa39.97■■■■□ 3.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.97■■■■□ 3.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UACAQ9BZF9 1416 aa39.96■■■■□ 3.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EEA1Q15075 1411 aa39.95■■■■□ 3.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GOLGA3Q08378 1498 aa39.94■■■■□ 3.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.93■■■■□ 3.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DIP2BQ9P265 1576 aa39.93■■■■□ 3.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.81■■■■□ 3.96
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.76■■■■□ 3.96
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ASXL2Q76L83 1435 aa39.76■■■■□ 3.96
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GLI2P10070 1586 aa39.63■■■■□ 3.94
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCA8O94911 1581 aa39.58■■■■□ 3.93
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.53■■■■□ 3.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TSPOAP1O95153 1857 aa39.51■■■■□ 3.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SAMD9Q5K651 1589 aa39.5■■■■□ 3.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF21BO75037 1637 aa39.49■■■■□ 3.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.48■■■■□ 3.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KDM6BO15054 1643 aa39.47■■■■□ 3.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 P3H3Q8IVL6 736 aa39.44■■■■□ 3.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.38■■■■□ 3.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.35■■■■□ 3.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.27■■■■□ 3.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.25■■■■□ 3.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ATP10BO94823 1461 aa39.24■■■■□ 3.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KCNH8Q96L42 1107 aa39.21■■■■□ 3.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.21■■■■□ 3.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.19■■■■□ 3.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CD109Q6YHK3 1445 aa39.18■■■■□ 3.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.15■■■■□ 3.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARID3CA6NKF2 412 aa39.15■■■■□ 3.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.02■■■■□ 3.84
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.97■■■■□ 3.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FMN1Q68DA7 1419 aa38.94■■■■□ 3.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.92■■■■□ 3.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.9■■■■□ 3.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.89■■■■□ 3.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.84■■■■□ 3.81
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.81■■■■□ 3.8
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NEO1Q92859 1461 aa38.79■■■■□ 3.8
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HECW1Q76N89 1606 aa38.78■■■■□ 3.8
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ADGRL1O94910 1474 aa38.66■■■■□ 3.78
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.65■■■■□ 3.78
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.6■■■■□ 3.77
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.57■■■■□ 3.76
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FANCAO15360 1455 aa38.56■■■■□ 3.76
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RAPGEF3O95398 923 aa38.53■■■■□ 3.76
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AKNAQ7Z591 1439 aa38.52■■■■□ 3.76
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.51■■■■□ 3.76
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CLIP1P30622 1438 aa38.49■■■■□ 3.75
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.47■■■■□ 3.75
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PLCH2O75038 1416 aa38.46■■■■□ 3.75
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.44■■■■□ 3.74
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF14Q15058 1648 aa38.44■■■■□ 3.74
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.41■■■■□ 3.74
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.37■■■■□ 3.73
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RICTORQ6R327 1708 aa38.35■■■■□ 3.73
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.35■■■■□ 3.73
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.35■■■■□ 3.73
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.3■■■■□ 3.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.29■■■■□ 3.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.28■■■■□ 3.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.27■■■■□ 3.72
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