RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532138.1

SCN4B-206, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 4, human

TSL 4

Gene SCN4B, Length 850 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCN4B-206	ENST00000532138	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SCN4B-206	ENST00000532138	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SCN4B-206	ENST00000532138	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
SCN4B-206	ENST00000532138	NUP160	Q12769	1436 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SCN4B-206	ENST00000532138	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SCN4B-206	ENST00000532138	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SCN4B-206	ENST00000532138	KIF21B	O75037	1637 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SCN4B-206	ENST00000532138	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SCN4B-206	ENST00000532138	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SCN4B-206	ENST00000532138	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SCN4B-206	ENST00000532138	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SCN4B-206	ENST00000532138	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SCN4B-206	ENST00000532138	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SCN4B-206	ENST00000532138	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SCN4B-206	ENST00000532138	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SCN4B-206	ENST00000532138	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SCN4B-206	ENST00000532138	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SCN4B-206	ENST00000532138	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SCN4B-206	ENST00000532138	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SCN4B-206	ENST00000532138	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SCN4B-206	ENST00000532138	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SCN4B-206	ENST00000532138	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SCN4B-206	ENST00000532138	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SCN4B-206	ENST00000532138	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SCN4B-206	ENST00000532138	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SCN4B-206	ENST00000532138	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SCN4B-206	ENST00000532138	PTPRG	P23470	1445 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SCN4B-206	ENST00000532138	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SCN4B-206	ENST00000532138	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SCN4B-206	ENST00000532138	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SCN4B-206	ENST00000532138	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SCN4B-206	ENST00000532138	CLIP1	P30622	1438 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SCN4B-206	ENST00000532138	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SCN4B-206	ENST00000532138	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SCN4B-206	ENST00000532138	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SCN4B-206	ENST00000532138	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SCN4B-206	ENST00000532138	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SCN4B-206	ENST00000532138	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SCN4B-206	ENST00000532138	ABCA8	O94911	1581 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SCN4B-206	ENST00000532138	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SCN4B-206	ENST00000532138	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SCN4B-206	ENST00000532138	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SCN4B-206	ENST00000532138	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SCN4B-206	ENST00000532138	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SCN4B-206	ENST00000532138	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SCN4B-206	ENST00000532138	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SCN4B-206	ENST00000532138	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.08	■■■□□ 2.73
SCN4B-206	ENST00000532138	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SCN4B-206	ENST00000532138	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SCN4B-206	ENST00000532138	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SCN4B-206	ENST00000532138	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SCN4B-206	ENST00000532138	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SCN4B-206	ENST00000532138	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32	■■■□□ 2.71
SCN4B-206	ENST00000532138	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32	■■■□□ 2.71
SCN4B-206	ENST00000532138	ATP10B	O94823	1461 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SCN4B-206	ENST00000532138	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SCN4B-206	ENST00000532138	KDM6B	O15054	1643 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SCN4B-206	ENST00000532138	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SCN4B-206	ENST00000532138	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SCN4B-206	ENST00000532138	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SCN4B-206	ENST00000532138	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SCN4B-206	ENST00000532138	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SCN4B-206	ENST00000532138	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
SCN4B-206	ENST00000532138	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SCN4B-206	ENST00000532138	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SCN4B-206	ENST00000532138	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SCN4B-206	ENST00000532138	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SCN4B-206	ENST00000532138	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SCN4B-206	ENST00000532138	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SCN4B-206	ENST00000532138	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SCN4B-206	ENST00000532138	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
SCN4B-206	ENST00000532138	GLI2	P10070	1586 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SCN4B-206	ENST00000532138	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SCN4B-206	ENST00000532138	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SCN4B-206	ENST00000532138	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SCN4B-206	ENST00000532138	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
SCN4B-206	ENST00000532138	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SCN4B-206	ENST00000532138	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SCN4B-206	ENST00000532138	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SCN4B-206	ENST00000532138	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SCN4B-206	ENST00000532138	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SCN4B-206	ENST00000532138	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SCN4B-206	ENST00000532138	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SCN4B-206	ENST00000532138	KIF14	Q15058	1648 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SCN4B-206	ENST00000532138	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SCN4B-206	ENST00000532138	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SCN4B-206	ENST00000532138	APLP2	Q06481	763 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SCN4B-206	ENST00000532138	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.5	■■■□□ 2.63
SCN4B-206	ENST00000532138	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SCN4B-206	ENST00000532138	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SCN4B-206	ENST00000532138	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.45	■■■□□ 2.63
SCN4B-206	ENST00000532138	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SCN4B-206	ENST00000532138	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
SCN4B-206	ENST00000532138	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SCN4B-206	ENST00000532138	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SCN4B-206	ENST00000532138	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
SCN4B-206	ENST00000532138	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SCN4B-206	ENST00000532138	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
SCN4B-206	ENST00000532138	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SCN4B-206	ENST00000532138	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.31	■■■□□ 2.6

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