RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 KIF27Q86VH2 1401 aa32.02■■■□□ 2.72
PUF60-218ENST00000531995 JPH4Q96JJ6 628 aa32.01■■■□□ 2.71
PUF60-218ENST00000531995 IGF1RP08069 1367 aa31.94■■■□□ 2.7
PUF60-218ENST00000531995 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.91■■■□□ 2.7
PUF60-218ENST00000531995 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.9■■■□□ 2.7
PUF60-218ENST00000531995 MAPKBP1O60336 1514 aa31.79■■■□□ 2.68
PUF60-218ENST00000531995 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.77■■■□□ 2.68
PUF60-218ENST00000531995 DIP2BQ9P265 1576 aa31.77■■■□□ 2.68
PUF60-218ENST00000531995 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.72■■■□□ 2.67
PUF60-218ENST00000531995 IQGAP2Q13576 1575 aa31.72■■■□□ 2.67
PUF60-218ENST00000531995 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.67■■■□□ 2.66
PUF60-218ENST00000531995 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.64■■■□□ 2.66
PUF60-218ENST00000531995 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
PUF60-218ENST00000531995 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
PUF60-218ENST00000531995 TSPOAP1O95153 1857 aa31.61■■■□□ 2.65
PUF60-218ENST00000531995 PTPRGP23470 1445 aa31.59■■■□□ 2.65
PUF60-218ENST00000531995 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.58■■■□□ 2.65
PUF60-218ENST00000531995 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.55■■■□□ 2.64
PUF60-218ENST00000531995 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.52■■■□□ 2.64
PUF60-218ENST00000531995 DISP1Q96F81 1524 aa31.52■■■□□ 2.64
PUF60-218ENST00000531995 ABCC2Q92887 1545 aa31.5■■■□□ 2.63
PUF60-218ENST00000531995 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.5■■■□□ 2.63
PUF60-218ENST00000531995 KDM6BO15054 1643 aa31.49■■■□□ 2.63
PUF60-218ENST00000531995 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.48■■■□□ 2.63
PUF60-218ENST00000531995 KIAA0556O60303 1618 aa31.46■■■□□ 2.63
PUF60-218ENST00000531995 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.45■■■□□ 2.63
PUF60-218ENST00000531995 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.4■■■□□ 2.62
PUF60-218ENST00000531995 ASXL2Q76L83 1435 aa31.39■■■□□ 2.62
PUF60-218ENST00000531995 UACAQ9BZF9 1416 aa31.38■■■□□ 2.61
PUF60-218ENST00000531995 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
PUF60-218ENST00000531995 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
PUF60-218ENST00000531995 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.33■■■□□ 2.61
PUF60-218ENST00000531995 GLI2P10070 1586 aa31.31■■■□□ 2.6
PUF60-218ENST00000531995 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.28■■■□□ 2.6
PUF60-218ENST00000531995 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.23■■■□□ 2.59
PUF60-218ENST00000531995 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
PUF60-218ENST00000531995 PRXQ9BXM0 1461 aa31.2■■■□□ 2.58
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA3Q08378 1498 aa31.15■■■□□ 2.58
PUF60-218ENST00000531995 ABCA8O94911 1581 aa31.12■■■□□ 2.57
PUF60-218ENST00000531995 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.11■■■□□ 2.57
PUF60-218ENST00000531995 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.04■■■□□ 2.56
PUF60-218ENST00000531995 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.02■■■□□ 2.56
PUF60-218ENST00000531995 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
PUF60-218ENST00000531995 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.99■■■□□ 2.55
PUF60-218ENST00000531995 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.99■■■□□ 2.55
PUF60-218ENST00000531995 EEA1Q15075 1411 aa30.98■■■□□ 2.55
PUF60-218ENST00000531995 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
PUF60-218ENST00000531995 SAMD9Q5K651 1589 aa30.94■■■□□ 2.54
PUF60-218ENST00000531995 ADGRL1O94910 1474 aa30.91■■■□□ 2.54
PUF60-218ENST00000531995 P3H3Q8IVL6 736 aa30.88■■■□□ 2.53
PUF60-218ENST00000531995 ARID3CA6NKF2 412 aa30.87■■■□□ 2.53
PUF60-218ENST00000531995 CD109Q6YHK3 1445 aa30.85■■■□□ 2.53
PUF60-218ENST00000531995 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.84■■■□□ 2.53
PUF60-218ENST00000531995 KCNH8Q96L42 1107 aa30.84■■■□□ 2.53
PUF60-218ENST00000531995 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.84■■■□□ 2.53
PUF60-218ENST00000531995 ATP10BO94823 1461 aa30.78■■■□□ 2.52
PUF60-218ENST00000531995 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.73■■■□□ 2.51
PUF60-218ENST00000531995 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
PUF60-218ENST00000531995 KIF21BO75037 1637 aa30.7■■■□□ 2.51
PUF60-218ENST00000531995 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.7■■■□□ 2.5
PUF60-218ENST00000531995 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
PUF60-218ENST00000531995 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.6■■■□□ 2.49
PUF60-218ENST00000531995 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.58■■■□□ 2.49
PUF60-218ENST00000531995 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
PUF60-218ENST00000531995 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PUF60-218ENST00000531995 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.54■■■□□ 2.48
PUF60-218ENST00000531995 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.51■■■□□ 2.47
PUF60-218ENST00000531995 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.51■■■□□ 2.47
PUF60-218ENST00000531995 NEO1Q92859 1461 aa30.48■■■□□ 2.47
PUF60-218ENST00000531995 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.45■■■□□ 2.46
PUF60-218ENST00000531995 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
PUF60-218ENST00000531995 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.41■■■□□ 2.46
PUF60-218ENST00000531995 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PUF60-218ENST00000531995 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
PUF60-218ENST00000531995 RAPGEF3O95398 923 aa30.39■■■□□ 2.46
PUF60-218ENST00000531995 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.39■■■□□ 2.46
PUF60-218ENST00000531995 RICTORQ6R327 1708 aa30.38■■■□□ 2.45
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.35■■■□□ 2.45
PUF60-218ENST00000531995 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.35■■■□□ 2.45
PUF60-218ENST00000531995 HECW1Q76N89 1606 aa30.33■■■□□ 2.45
PUF60-218ENST00000531995 FANCAO15360 1455 aa30.32■■■□□ 2.44
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.32■■■□□ 2.44
PUF60-218ENST00000531995 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.31■■■□□ 2.44
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.29■■■□□ 2.44
PUF60-218ENST00000531995 MADDQ8WXG6 1647 aa30.29■■■□□ 2.44
PUF60-218ENST00000531995 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
PUF60-218ENST00000531995 AKNAQ7Z591 1439 aa30.26■■■□□ 2.43
PUF60-218ENST00000531995 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.24■■■□□ 2.43
PUF60-218ENST00000531995 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.23■■■□□ 2.43
PUF60-218ENST00000531995 PTPRMP28827 1452 aa30.23■■■□□ 2.43
PUF60-218ENST00000531995 FMN1Q68DA7 1419 aa30.22■■■□□ 2.43
PUF60-218ENST00000531995 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.22■■■□□ 2.43
PUF60-218ENST00000531995 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.22■■■□□ 2.43
PUF60-218ENST00000531995 KIF14Q15058 1648 aa30.21■■■□□ 2.43
PUF60-218ENST00000531995 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.19■■■□□ 2.42
PUF60-218ENST00000531995 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PUF60-218ENST00000531995 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PUF60-218ENST00000531995 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PUF60-218ENST00000531995 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.17■■■□□ 2.42
PUF60-218ENST00000531995 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.13■■■□□ 2.41
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