RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 IQGAP2Q13576 1575 aa30.71■■■□□ 2.51
PUF60-217ENST00000531951 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.7■■■□□ 2.51
PUF60-217ENST00000531951 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.7■■■□□ 2.51
PUF60-217ENST00000531951 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
PUF60-217ENST00000531951 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.65■■■□□ 2.5
PUF60-217ENST00000531951 OSCARQ8IYS5 282 aa30.64■■■□□ 2.5
PUF60-217ENST00000531951 SHROOM2Q13796 1616 aa30.61■■■□□ 2.49
PUF60-217ENST00000531951 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.53■■■□□ 2.48
PUF60-217ENST00000531951 SAMD9Q5K651 1589 aa30.46■■■□□ 2.47
PUF60-217ENST00000531951 JPH4Q96JJ6 628 aa30.44■■■□□ 2.46
PUF60-217ENST00000531951 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.43■■■□□ 2.46
PUF60-217ENST00000531951 CEP162Q5TB80 1403 aa30.43■■■□□ 2.46
PUF60-217ENST00000531951 KIAA0556O60303 1618 aa30.41■■■□□ 2.46
PUF60-217ENST00000531951 DISP1Q96F81 1524 aa30.39■■■□□ 2.46
PUF60-217ENST00000531951 CLIP1P30622 1438 aa30.38■■■□□ 2.45
PUF60-217ENST00000531951 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
PUF60-217ENST00000531951 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PUF60-217ENST00000531951 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.35■■■□□ 2.45
PUF60-217ENST00000531951 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.34■■■□□ 2.45
PUF60-217ENST00000531951 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.32■■■□□ 2.44
PUF60-217ENST00000531951 ARHGEF11O15085 1522 aa30.25■■■□□ 2.43
PUF60-217ENST00000531951 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
PUF60-217ENST00000531951 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
PUF60-217ENST00000531951 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
PUF60-217ENST00000531951 ARAP1Q96P48 1450 aa30.22■■■□□ 2.43
PUF60-217ENST00000531951 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.22■■■□□ 2.43
PUF60-217ENST00000531951 P3H3Q8IVL6 736 aa30.19■■■□□ 2.42
PUF60-217ENST00000531951 PTPRGP23470 1445 aa30.08■■■□□ 2.41
PUF60-217ENST00000531951 FMN1Q68DA7 1419 aa30.08■■■□□ 2.41
PUF60-217ENST00000531951 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.02■■■□□ 2.4
PUF60-217ENST00000531951 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.02■■■□□ 2.4
PUF60-217ENST00000531951 ABCA8O94911 1581 aa30.01■■■□□ 2.39
PUF60-217ENST00000531951 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PUF60-217ENST00000531951 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PUF60-217ENST00000531951 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.99■■■□□ 2.39
PUF60-217ENST00000531951 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.97■■■□□ 2.39
PUF60-217ENST00000531951 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.94■■■□□ 2.38
PUF60-217ENST00000531951 HECW1Q76N89 1606 aa29.94■■■□□ 2.38
PUF60-217ENST00000531951 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.93■■■□□ 2.38
PUF60-217ENST00000531951 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.93■■■□□ 2.38
PUF60-217ENST00000531951 UACAQ9BZF9 1416 aa29.92■■■□□ 2.38
PUF60-217ENST00000531951 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.92■■■□□ 2.38
PUF60-217ENST00000531951 ABCC2Q92887 1545 aa29.91■■■□□ 2.38
PUF60-217ENST00000531951 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.89■■■□□ 2.38
PUF60-217ENST00000531951 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PUF60-217ENST00000531951 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.81■■■□□ 2.36
PUF60-217ENST00000531951 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.79■■■□□ 2.36
PUF60-217ENST00000531951 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
PUF60-217ENST00000531951 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
PUF60-217ENST00000531951 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.76■■■□□ 2.35
PUF60-217ENST00000531951 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.75■■■□□ 2.35
PUF60-217ENST00000531951 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
PUF60-217ENST00000531951 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
PUF60-217ENST00000531951 ATP10BO94823 1461 aa29.71■■■□□ 2.35
PUF60-217ENST00000531951 TIAM1Q13009 1591 aa29.71■■■□□ 2.35
PUF60-217ENST00000531951 MAP3K1Q13233 1512 aa29.7■■■□□ 2.34
PUF60-217ENST00000531951 ARID3CA6NKF2 412 aa29.64■■■□□ 2.34
PUF60-217ENST00000531951 APLP2Q06481 763 aa29.58■■■□□ 2.33
PUF60-217ENST00000531951 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.56■■■□□ 2.32
PUF60-217ENST00000531951 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
PUF60-217ENST00000531951 MAPKBP1O60336 1514 aa29.55■■■□□ 2.32
PUF60-217ENST00000531951 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PUF60-217ENST00000531951 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PUF60-217ENST00000531951 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.52■■■□□ 2.32
PUF60-217ENST00000531951 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.52■■■□□ 2.32
PUF60-217ENST00000531951 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PUF60-217ENST00000531951 ASXL2Q76L83 1435 aa29.49■■■□□ 2.31
PUF60-217ENST00000531951 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.48■■■□□ 2.31
PUF60-217ENST00000531951 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PUF60-217ENST00000531951 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.46■■■□□ 2.31
PUF60-217ENST00000531951 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.46■■■□□ 2.31
PUF60-217ENST00000531951 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
PUF60-217ENST00000531951 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
PUF60-217ENST00000531951 KIF14Q15058 1648 aa29.43■■■□□ 2.3
PUF60-217ENST00000531951 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.34■■■□□ 2.29
PUF60-217ENST00000531951 DIP2BQ9P265 1576 aa29.33■■■□□ 2.29
PUF60-217ENST00000531951 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.32■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.31■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 NCOA2Q15596 1464 aa29.3■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.29■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.29■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.28■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 GLI2P10070 1586 aa29.28■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 KCNH8Q96L42 1107 aa29.28■■■□□ 2.28
PUF60-217ENST00000531951 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.26■■■□□ 2.27
PUF60-217ENST00000531951 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.23■■■□□ 2.27
PUF60-217ENST00000531951 PREX2Q70Z35 1606 aa29.22■■■□□ 2.27
PUF60-217ENST00000531951 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.22■■■□□ 2.27
PUF60-217ENST00000531951 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.16■■■□□ 2.26
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PUF60-217ENST00000531951 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PUF60-217ENST00000531951 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.14■■■□□ 2.26
PUF60-217ENST00000531951 TSPOAP1O95153 1857 aa29.14■■■□□ 2.26
PUF60-217ENST00000531951 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.13■■■□□ 2.25
PUF60-217ENST00000531951 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.11■■■□□ 2.25
PUF60-217ENST00000531951 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PUF60-217ENST00000531951 PLCH2O75038 1416 aa29.09■■■□□ 2.25
PUF60-217ENST00000531951 CD109Q6YHK3 1445 aa29.09■■■□□ 2.25
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