RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531006.1

TSTA3-213, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-213ENST00000531006 SHROOM2Q13796 1616 aa34.99■■■■□ 3.19
TSTA3-213ENST00000531006 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
TSTA3-213ENST00000531006 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.84■■■■□ 3.17
TSTA3-213ENST00000531006 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
TSTA3-213ENST00000531006 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.75■■■■□ 3.15
TSTA3-213ENST00000531006 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
TSTA3-213ENST00000531006 IQGAP2Q13576 1575 aa34.61■■■■□ 3.13
TSTA3-213ENST00000531006 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.56■■■■□ 3.12
TSTA3-213ENST00000531006 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
TSTA3-213ENST00000531006 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.55■■■■□ 3.12
TSTA3-213ENST00000531006 PRXQ9BXM0 1461 aa34.54■■■■□ 3.12
TSTA3-213ENST00000531006 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.47■■■■□ 3.11
TSTA3-213ENST00000531006 PTPRGP23470 1445 aa34.45■■■■□ 3.11
TSTA3-213ENST00000531006 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.44■■■■□ 3.1
TSTA3-213ENST00000531006 DISP1Q96F81 1524 aa34.42■■■■□ 3.1
TSTA3-213ENST00000531006 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.41■■■■□ 3.1
TSTA3-213ENST00000531006 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.41■■■■□ 3.1
TSTA3-213ENST00000531006 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.39■■■■□ 3.1
TSTA3-213ENST00000531006 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
TSTA3-213ENST00000531006 EEA1Q15075 1411 aa34.35■■■■□ 3.09
TSTA3-213ENST00000531006 KIAA0556O60303 1618 aa34.29■■■■□ 3.08
TSTA3-213ENST00000531006 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.23■■■■□ 3.07
TSTA3-213ENST00000531006 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.2■■■■□ 3.07
TSTA3-213ENST00000531006 P3H3Q8IVL6 736 aa34.19■■■■□ 3.06
TSTA3-213ENST00000531006 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
TSTA3-213ENST00000531006 UACAQ9BZF9 1416 aa34.18■■■■□ 3.06
TSTA3-213ENST00000531006 GOLGA3Q08378 1498 aa34.16■■■■□ 3.06
TSTA3-213ENST00000531006 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.15■■■■□ 3.06
TSTA3-213ENST00000531006 MAPKBP1O60336 1514 aa34.14■■■■□ 3.06
TSTA3-213ENST00000531006 ABCC2Q92887 1545 aa34.11■■■■□ 3.05
TSTA3-213ENST00000531006 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.1■■■■□ 3.05
TSTA3-213ENST00000531006 KIF21BO75037 1637 aa34.08■■■■□ 3.05
TSTA3-213ENST00000531006 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.07■■■■□ 3.05
TSTA3-213ENST00000531006 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.05■■■■□ 3.04
TSTA3-213ENST00000531006 DIP2BQ9P265 1576 aa34.02■■■■□ 3.04
TSTA3-213ENST00000531006 ASXL2Q76L83 1435 aa33.98■■■■□ 3.03
TSTA3-213ENST00000531006 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
TSTA3-213ENST00000531006 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.96■■■■□ 3.03
TSTA3-213ENST00000531006 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
TSTA3-213ENST00000531006 SAMD9Q5K651 1589 aa33.94■■■■□ 3.02
TSTA3-213ENST00000531006 TSPOAP1O95153 1857 aa33.94■■■■□ 3.02
TSTA3-213ENST00000531006 ABCA8O94911 1581 aa33.94■■■■□ 3.02
TSTA3-213ENST00000531006 ARID3CA6NKF2 412 aa33.91■■■■□ 3.02
TSTA3-213ENST00000531006 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.84■■■■□ 3.01
TSTA3-213ENST00000531006 KCNH8Q96L42 1107 aa33.77■■■■□ 3
TSTA3-213ENST00000531006 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
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TSTA3-213ENST00000531006 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.72■■■□□ 2.99
TSTA3-213ENST00000531006 ATP10BO94823 1461 aa33.71■■■□□ 2.99
TSTA3-213ENST00000531006 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.71■■■□□ 2.99
TSTA3-213ENST00000531006 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.69■■■□□ 2.98
TSTA3-213ENST00000531006 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
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TSTA3-213ENST00000531006 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
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TSTA3-213ENST00000531006 FMN1Q68DA7 1419 aa33.43■■■□□ 2.94
TSTA3-213ENST00000531006 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.43■■■□□ 2.94
TSTA3-213ENST00000531006 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.42■■■□□ 2.94
TSTA3-213ENST00000531006 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
TSTA3-213ENST00000531006 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
TSTA3-213ENST00000531006 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.36■■■□□ 2.93
TSTA3-213ENST00000531006 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.33■■■□□ 2.93
TSTA3-213ENST00000531006 CLIP1P30622 1438 aa33.3■■■□□ 2.92
TSTA3-213ENST00000531006 HECW1Q76N89 1606 aa33.3■■■□□ 2.92
TSTA3-213ENST00000531006 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.28■■■□□ 2.92
TSTA3-213ENST00000531006 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.25■■■□□ 2.91
TSTA3-213ENST00000531006 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
TSTA3-213ENST00000531006 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
TSTA3-213ENST00000531006 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.18■■■□□ 2.9
TSTA3-213ENST00000531006 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
TSTA3-213ENST00000531006 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.16■■■□□ 2.9
TSTA3-213ENST00000531006 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.14■■■□□ 2.9
TSTA3-213ENST00000531006 CEP162Q5TB80 1403 aa33.1■■■□□ 2.89
TSTA3-213ENST00000531006 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.09■■■□□ 2.89
TSTA3-213ENST00000531006 RAPGEF3O95398 923 aa33.08■■■□□ 2.89
TSTA3-213ENST00000531006 KIF14Q15058 1648 aa33.06■■■□□ 2.88
TSTA3-213ENST00000531006 NEO1Q92859 1461 aa33.05■■■□□ 2.88
TSTA3-213ENST00000531006 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.05■■■□□ 2.88
TSTA3-213ENST00000531006 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.05■■■□□ 2.88
TSTA3-213ENST00000531006 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
TSTA3-213ENST00000531006 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.04■■■□□ 2.88
TSTA3-213ENST00000531006 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.01■■■□□ 2.88
TSTA3-213ENST00000531006 FANCAO15360 1455 aa33■■■□□ 2.87
TSTA3-213ENST00000531006 AKNAQ7Z591 1439 aa33■■■□□ 2.87
TSTA3-213ENST00000531006 PLCH2O75038 1416 aa32.96■■■□□ 2.87
TSTA3-213ENST00000531006 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.94■■■□□ 2.86
TSTA3-213ENST00000531006 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.91■■■□□ 2.86
TSTA3-213ENST00000531006 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.89■■■□□ 2.86
TSTA3-213ENST00000531006 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.89■■■□□ 2.86
TSTA3-213ENST00000531006 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
TSTA3-213ENST00000531006 ADGRL1O94910 1474 aa32.86■■■□□ 2.85
TSTA3-213ENST00000531006 RICTORQ6R327 1708 aa32.85■■■□□ 2.85
TSTA3-213ENST00000531006 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.83■■■□□ 2.85
TSTA3-213ENST00000531006 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.82■■■□□ 2.85
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