RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530939.5

CHID1-217, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene CHID1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-217ENST00000530939 JPH4Q96JJ6 628 aa45.4■■■■■ 4.86
CHID1-217ENST00000530939 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
CHID1-217ENST00000530939 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.34■■■■■ 4.85
CHID1-217ENST00000530939 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.26■■■■■ 4.84
CHID1-217ENST00000530939 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45■■■■■ 4.79
CHID1-217ENST00000530939 IQGAP2Q13576 1575 aa44.97■■■■■ 4.79
CHID1-217ENST00000530939 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.84■■■■■ 4.77
CHID1-217ENST00000530939 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.82■■■■■ 4.77
CHID1-217ENST00000530939 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
CHID1-217ENST00000530939 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.78■■■■■ 4.76
CHID1-217ENST00000530939 PTPRGP23470 1445 aa44.75■■■■■ 4.76
CHID1-217ENST00000530939 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.72■■■■■ 4.75
CHID1-217ENST00000530939 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.7■■■■■ 4.75
CHID1-217ENST00000530939 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.68■■■■■ 4.74
CHID1-217ENST00000530939 DISP1Q96F81 1524 aa44.66■■■■■ 4.74
CHID1-217ENST00000530939 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.65■■■■■ 4.74
CHID1-217ENST00000530939 PRXQ9BXM0 1461 aa44.65■■■■■ 4.74
CHID1-217ENST00000530939 MAPKBP1O60336 1514 aa44.6■■■■■ 4.73
CHID1-217ENST00000530939 KIAA0556O60303 1618 aa44.55■■■■■ 4.72
CHID1-217ENST00000530939 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.49■■■■■ 4.71
CHID1-217ENST00000530939 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.48■■■■■ 4.71
CHID1-217ENST00000530939 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.47■■■■■ 4.71
CHID1-217ENST00000530939 DIP2BQ9P265 1576 aa44.43■■■■■ 4.7
CHID1-217ENST00000530939 UACAQ9BZF9 1416 aa44.43■■■■■ 4.7
CHID1-217ENST00000530939 ABCC2Q92887 1545 aa44.43■■■■■ 4.7
CHID1-217ENST00000530939 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.4■■■■■ 4.7
CHID1-217ENST00000530939 EEA1Q15075 1411 aa44.39■■■■■ 4.7
CHID1-217ENST00000530939 GOLGA3Q08378 1498 aa44.37■■■■■ 4.69
CHID1-217ENST00000530939 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
CHID1-217ENST00000530939 ASXL2Q76L83 1435 aa44.24■■■■■ 4.67
CHID1-217ENST00000530939 TSPOAP1O95153 1857 aa44.23■■■■■ 4.67
CHID1-217ENST00000530939 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.19■■■■■ 4.67
CHID1-217ENST00000530939 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
CHID1-217ENST00000530939 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.19■■■■■ 4.66
CHID1-217ENST00000530939 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.17■■■■■ 4.66
CHID1-217ENST00000530939 P3H3Q8IVL6 736 aa44.1■■■■■ 4.65
CHID1-217ENST00000530939 ABCA8O94911 1581 aa44.08■■■■■ 4.65
CHID1-217ENST00000530939 KIF21BO75037 1637 aa44.03■■■■■ 4.64
CHID1-217ENST00000530939 GLI2P10070 1586 aa44.03■■■■■ 4.64
CHID1-217ENST00000530939 SAMD9Q5K651 1589 aa44.01■■■■■ 4.64
CHID1-217ENST00000530939 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
CHID1-217ENST00000530939 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
CHID1-217ENST00000530939 KDM6BO15054 1643 aa43.94■■■■■ 4.62
CHID1-217ENST00000530939 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.9■■■■■ 4.62
CHID1-217ENST00000530939 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
CHID1-217ENST00000530939 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.85■■■■■ 4.61
CHID1-217ENST00000530939 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.85■■■■■ 4.61
CHID1-217ENST00000530939 ARID3CA6NKF2 412 aa43.82■■■■■ 4.61
CHID1-217ENST00000530939 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.77■■■■■ 4.6
CHID1-217ENST00000530939 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.76■■■■■ 4.6
CHID1-217ENST00000530939 KCNH8Q96L42 1107 aa43.74■■■■■ 4.59
CHID1-217ENST00000530939 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
CHID1-217ENST00000530939 ATP10BO94823 1461 aa43.7■■■■■ 4.59
CHID1-217ENST00000530939 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.69■■■■■ 4.59
CHID1-217ENST00000530939 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
CHID1-217ENST00000530939 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.67■■■■■ 4.58
CHID1-217ENST00000530939 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.64■■■■■ 4.58
CHID1-217ENST00000530939 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
CHID1-217ENST00000530939 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
CHID1-217ENST00000530939 CD109Q6YHK3 1445 aa43.57■■■■■ 4.57
CHID1-217ENST00000530939 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
CHID1-217ENST00000530939 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
CHID1-217ENST00000530939 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.48■■■■■ 4.55
CHID1-217ENST00000530939 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.38■■■■■ 4.54
CHID1-217ENST00000530939 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.38■■■■■ 4.53
CHID1-217ENST00000530939 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.29■■■■■ 4.52
CHID1-217ENST00000530939 FMN1Q68DA7 1419 aa43.29■■■■■ 4.52
CHID1-217ENST00000530939 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
CHID1-217ENST00000530939 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
CHID1-217ENST00000530939 HECW1Q76N89 1606 aa43.21■■■■■ 4.51
CHID1-217ENST00000530939 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.17■■■■■ 4.5
CHID1-217ENST00000530939 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.12■■■■■ 4.49
CHID1-217ENST00000530939 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.08■■■■■ 4.49
CHID1-217ENST00000530939 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.07■■■■■ 4.493e-6■□□□□ 8.9
CHID1-217ENST00000530939 NEO1Q92859 1461 aa43.07■■■■■ 4.49
CHID1-217ENST00000530939 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.03■■■■■ 4.48
CHID1-217ENST00000530939 ADGRL1O94910 1474 aa43.02■■■■■ 4.48
CHID1-217ENST00000530939 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43■■■■■ 4.47
CHID1-217ENST00000530939 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
CHID1-217ENST00000530939 RAPGEF3O95398 923 aa42.93■■■■■ 4.46
CHID1-217ENST00000530939 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
CHID1-217ENST00000530939 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.93■■■■■ 4.46
CHID1-217ENST00000530939 CLIP1P30622 1438 aa42.92■■■■■ 4.46
CHID1-217ENST00000530939 FANCAO15360 1455 aa42.91■■■■■ 4.46
CHID1-217ENST00000530939 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.88■■■■■ 4.45
CHID1-217ENST00000530939 AKNAQ7Z591 1439 aa42.86■■■■■ 4.45
CHID1-217ENST00000530939 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.85■■■■■ 4.45
CHID1-217ENST00000530939 KIF14Q15058 1648 aa42.83■■■■■ 4.45
CHID1-217ENST00000530939 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
CHID1-217ENST00000530939 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.81■■■■■ 4.44
CHID1-217ENST00000530939 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
CHID1-217ENST00000530939 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.8■■■■■ 4.44
CHID1-217ENST00000530939 RICTORQ6R327 1708 aa42.77■■■■■ 4.44
CHID1-217ENST00000530939 PLCH2O75038 1416 aa42.77■■■■■ 4.44
CHID1-217ENST00000530939 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.75■■■■■ 4.43
CHID1-217ENST00000530939 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.63■■■■■ 4.41
CHID1-217ENST00000530939 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.61■■■■■ 4.41
CHID1-217ENST00000530939 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.61■■■■■ 4.41
CHID1-217ENST00000530939 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.6■■■■■ 4.41
CHID1-217ENST00000530939 CEP162Q5TB80 1403 aa42.57■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms