RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530449.1

TCIRG1-211, Transcript of T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCIRG1, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1-211ENST00000530449 JPH4Q96JJ6 628 aa37.66■■■■□ 3.62
TCIRG1-211ENST00000530449 CUL7Q14999 1698 aa37.64■■■■□ 3.62
TCIRG1-211ENST00000530449 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.51■■■■□ 3.59
TCIRG1-211ENST00000530449 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.46■■■■□ 3.59
TCIRG1-211ENST00000530449 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.22■■■■□ 3.55
TCIRG1-211ENST00000530449 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.2■■■■□ 3.54
TCIRG1-211ENST00000530449 IQGAP2Q13576 1575 aa37.18■■■■□ 3.54
TCIRG1-211ENST00000530449 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.15■■■■□ 3.54
TCIRG1-211ENST00000530449 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.14■■■■□ 3.54
TCIRG1-211ENST00000530449 MAPKBP1O60336 1514 aa37.12■■■■□ 3.53
TCIRG1-211ENST00000530449 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.11■■■■□ 3.53
TCIRG1-211ENST00000530449 PTPRGP23470 1445 aa37.1■■■■□ 3.53
TCIRG1-211ENST00000530449 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.07■■■■□ 3.52
TCIRG1-211ENST00000530449 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.06■■■■□ 3.52
TCIRG1-211ENST00000530449 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
TCIRG1-211ENST00000530449 FAM69CQ0P6D2 419 aa37■■■■□ 3.51
TCIRG1-211ENST00000530449 DISP1Q96F81 1524 aa37■■■■□ 3.51
TCIRG1-211ENST00000530449 DIP2BQ9P265 1576 aa36.99■■■■□ 3.51
TCIRG1-211ENST00000530449 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.96■■■■□ 3.51
TCIRG1-211ENST00000530449 ABCC2Q92887 1545 aa36.9■■■■□ 3.5
TCIRG1-211ENST00000530449 KIAA0556O60303 1618 aa36.85■■■■□ 3.49
TCIRG1-211ENST00000530449 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.85■■■■□ 3.49
TCIRG1-211ENST00000530449 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.85■■■■□ 3.49
TCIRG1-211ENST00000530449 PRXQ9BXM0 1461 aa36.84■■■■□ 3.49
TCIRG1-211ENST00000530449 UACAQ9BZF9 1416 aa36.84■■■■□ 3.49
TCIRG1-211ENST00000530449 ASXL2Q76L83 1435 aa36.74■■■■□ 3.47
TCIRG1-211ENST00000530449 TSPOAP1O95153 1857 aa36.71■■■■□ 3.47
TCIRG1-211ENST00000530449 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.71■■■■□ 3.47
TCIRG1-211ENST00000530449 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.69■■■■□ 3.46
TCIRG1-211ENST00000530449 GOLGA3Q08378 1498 aa36.67■■■■□ 3.46
TCIRG1-211ENST00000530449 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
TCIRG1-211ENST00000530449 GLI2P10070 1586 aa36.62■■■■□ 3.45
TCIRG1-211ENST00000530449 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
TCIRG1-211ENST00000530449 KDM6BO15054 1643 aa36.59■■■■□ 3.45
TCIRG1-211ENST00000530449 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.58■■■■□ 3.45
TCIRG1-211ENST00000530449 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
TCIRG1-211ENST00000530449 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
TCIRG1-211ENST00000530449 ABCA8O94911 1581 aa36.5■■■■□ 3.43
TCIRG1-211ENST00000530449 EEA1Q15075 1411 aa36.48■■■■□ 3.43
TCIRG1-211ENST00000530449 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.43■■■■□ 3.42
TCIRG1-211ENST00000530449 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.43■■■■□ 3.42
TCIRG1-211ENST00000530449 P3H3Q8IVL6 736 aa36.35■■■■□ 3.41
TCIRG1-211ENST00000530449 SAMD9Q5K651 1589 aa36.34■■■■□ 3.41
TCIRG1-211ENST00000530449 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.3■■■■□ 3.4
TCIRG1-211ENST00000530449 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
TCIRG1-211ENST00000530449 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TCIRG1-211ENST00000530449 KCNH8Q96L42 1107 aa36.21■■■■□ 3.39
TCIRG1-211ENST00000530449 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.19■■■■□ 3.38
TCIRG1-211ENST00000530449 KIF21BO75037 1637 aa36.19■■■■□ 3.38
TCIRG1-211ENST00000530449 ATP10BO94823 1461 aa36.19■■■■□ 3.38
TCIRG1-211ENST00000530449 ARID3CA6NKF2 412 aa36.17■■■■□ 3.38
TCIRG1-211ENST00000530449 CD109Q6YHK3 1445 aa36.17■■■■□ 3.38
TCIRG1-211ENST00000530449 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.16■■■■□ 3.38
TCIRG1-211ENST00000530449 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.14■■■■□ 3.38
TCIRG1-211ENST00000530449 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
TCIRG1-211ENST00000530449 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.12■■■■□ 3.37
TCIRG1-211ENST00000530449 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.12■■■■□ 3.37
TCIRG1-211ENST00000530449 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.09■■■■□ 3.37
TCIRG1-211ENST00000530449 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
TCIRG1-211ENST00000530449 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.01■■■■□ 3.36
TCIRG1-211ENST00000530449 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.97■■■■□ 3.35
TCIRG1-211ENST00000530449 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
TCIRG1-211ENST00000530449 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
TCIRG1-211ENST00000530449 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.9■■■■□ 3.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ADGRL1O94910 1474 aa35.9■■■■□ 3.34
TCIRG1-211ENST00000530449 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
TCIRG1-211ENST00000530449 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.85■■■■□ 3.33
TCIRG1-211ENST00000530449 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.78■■■■□ 3.32
TCIRG1-211ENST00000530449 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.77■■■■□ 3.32
TCIRG1-211ENST00000530449 NEO1Q92859 1461 aa35.74■■■■□ 3.31
TCIRG1-211ENST00000530449 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.73■■■■□ 3.31
TCIRG1-211ENST00000530449 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
TCIRG1-211ENST00000530449 FMN1Q68DA7 1419 aa35.68■■■■□ 3.3
TCIRG1-211ENST00000530449 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.65■■■■□ 3.3
TCIRG1-211ENST00000530449 RAPGEF3O95398 923 aa35.63■■■■□ 3.29
TCIRG1-211ENST00000530449 HECW1Q76N89 1606 aa35.61■■■■□ 3.29
TCIRG1-211ENST00000530449 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.6■■■■□ 3.29
TCIRG1-211ENST00000530449 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.59■■■■□ 3.29
TCIRG1-211ENST00000530449 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
TCIRG1-211ENST00000530449 FANCAO15360 1455 aa35.54■■■■□ 3.28
TCIRG1-211ENST00000530449 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.53■■■■□ 3.28
TCIRG1-211ENST00000530449 AKNAQ7Z591 1439 aa35.52■■■■□ 3.28
TCIRG1-211ENST00000530449 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
TCIRG1-211ENST00000530449 RICTORQ6R327 1708 aa35.47■■■■□ 3.27
TCIRG1-211ENST00000530449 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
TCIRG1-211ENST00000530449 PLCH2O75038 1416 aa35.42■■■■□ 3.26
TCIRG1-211ENST00000530449 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.42■■■■□ 3.26
TCIRG1-211ENST00000530449 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.38■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 KIF14Q15058 1648 aa35.37■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.36■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.35■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.34■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.34■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.32■■■■□ 3.25
TCIRG1-211ENST00000530449 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.31■■■■□ 3.24
TCIRG1-211ENST00000530449 CLIP1P30622 1438 aa35.3■■■■□ 3.24
TCIRG1-211ENST00000530449 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.29■■■■□ 3.24
TCIRG1-211ENST00000530449 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms