RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530312.1

PHF21A-213, Transcript of PHD finger protein 21A, humanhuman

TSL 3

Gene PHF21A, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21A-213ENST00000530312 EEA1Q15075 1411 aa43.11■■■■■ 4.49
PHF21A-213ENST00000530312 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
PHF21A-213ENST00000530312 ARAP1Q96P48 1450 aa43.1■■■■■ 4.49
PHF21A-213ENST00000530312 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.1■■■■■ 4.49
PHF21A-213ENST00000530312 SHROOM2Q13796 1616 aa43.1■■■■■ 4.49
PHF21A-213ENST00000530312 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.09■■■■■ 4.49
PHF21A-213ENST00000530312 JPH4Q96JJ6 628 aa43.06■■■■■ 4.48
PHF21A-213ENST00000530312 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.99■■■■■ 4.47
PHF21A-213ENST00000530312 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
PHF21A-213ENST00000530312 IQGAP2Q13576 1575 aa42.85■■■■■ 4.45
PHF21A-213ENST00000530312 KIF21BO75037 1637 aa42.69■■■■■ 4.42
PHF21A-213ENST00000530312 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.67■■■■■ 4.42
PHF21A-213ENST00000530312 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.67■■■■■ 4.42
PHF21A-213ENST00000530312 DISP1Q96F81 1524 aa42.64■■■■■ 4.42
PHF21A-213ENST00000530312 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.57■■■■■ 4.41
PHF21A-213ENST00000530312 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.55■■■■■ 4.4
PHF21A-213ENST00000530312 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.48■■■■■ 4.39
PHF21A-213ENST00000530312 KIAA0556O60303 1618 aa42.46■■■■■ 4.39
PHF21A-213ENST00000530312 GOLGA3Q08378 1498 aa42.46■■■■■ 4.39
PHF21A-213ENST00000530312 PTPRGP23470 1445 aa42.45■■■■■ 4.39
PHF21A-213ENST00000530312 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
PHF21A-213ENST00000530312 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
PHF21A-213ENST00000530312 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PHF21A-213ENST00000530312 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.28■■■■■ 4.36
PHF21A-213ENST00000530312 P3H3Q8IVL6 736 aa42.27■■■■■ 4.36
PHF21A-213ENST00000530312 SAMD9Q5K651 1589 aa42.25■■■■■ 4.35
PHF21A-213ENST00000530312 UACAQ9BZF9 1416 aa42.17■■■■■ 4.34
PHF21A-213ENST00000530312 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.11■■■■■ 4.33
PHF21A-213ENST00000530312 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.11■■■■■ 4.33
PHF21A-213ENST00000530312 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.08■■■■■ 4.33
PHF21A-213ENST00000530312 ABCC2Q92887 1545 aa42.07■■■■■ 4.33
PHF21A-213ENST00000530312 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.04■■■■■ 4.32
PHF21A-213ENST00000530312 ABCA8O94911 1581 aa42.03■■■■■ 4.32
PHF21A-213ENST00000530312 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42■■■■■ 4.31
PHF21A-213ENST00000530312 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.98■■■■■ 4.31
PHF21A-213ENST00000530312 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
PHF21A-213ENST00000530312 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.93■■■■■ 4.3
PHF21A-213ENST00000530312 MAPKBP1O60336 1514 aa41.92■■■■■ 4.3
PHF21A-213ENST00000530312 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.9■■■■■ 4.3
PHF21A-213ENST00000530312 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
PHF21A-213ENST00000530312 ASXL2Q76L83 1435 aa41.78■■■■■ 4.28
PHF21A-213ENST00000530312 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.77■■■■■ 4.28
PHF21A-213ENST00000530312 ARID3CA6NKF2 412 aa41.76■■■■■ 4.28
PHF21A-213ENST00000530312 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.74■■■■■ 4.27
PHF21A-213ENST00000530312 CLIP1P30622 1438 aa41.74■■■■■ 4.27
PHF21A-213ENST00000530312 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
PHF21A-213ENST00000530312 ATP10BO94823 1461 aa41.72■■■■■ 4.27
PHF21A-213ENST00000530312 DIP2BQ9P265 1576 aa41.67■■■■■ 4.26
PHF21A-213ENST00000530312 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.66■■■■■ 4.26
PHF21A-213ENST00000530312 FMN1Q68DA7 1419 aa41.65■■■■■ 4.26
PHF21A-213ENST00000530312 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.65■■■■■ 4.26
PHF21A-213ENST00000530312 CEP162Q5TB80 1403 aa41.62■■■■■ 4.25
PHF21A-213ENST00000530312 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.56■■■■■ 4.24
PHF21A-213ENST00000530312 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
PHF21A-213ENST00000530312 GLI2P10070 1586 aa41.46■■■■■ 4.23
PHF21A-213ENST00000530312 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
PHF21A-213ENST00000530312 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
PHF21A-213ENST00000530312 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
PHF21A-213ENST00000530312 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
PHF21A-213ENST00000530312 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
PHF21A-213ENST00000530312 HECW1Q76N89 1606 aa41.41■■■■■ 4.22
PHF21A-213ENST00000530312 KCNH8Q96L42 1107 aa41.41■■■■■ 4.22
PHF21A-213ENST00000530312 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.41■■■■■ 4.22
PHF21A-213ENST00000530312 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.3■■■■■ 4.2
PHF21A-213ENST00000530312 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.28■■■■■ 4.2
PHF21A-213ENST00000530312 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.27■■■■■ 4.2
PHF21A-213ENST00000530312 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.27■■■■■ 4.2
PHF21A-213ENST00000530312 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
PHF21A-213ENST00000530312 TSPOAP1O95153 1857 aa41.22■■■■■ 4.19
PHF21A-213ENST00000530312 CD109Q6YHK3 1445 aa41.17■■■■■ 4.18
PHF21A-213ENST00000530312 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.15■■■■■ 4.18
PHF21A-213ENST00000530312 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.13■■■■■ 4.17
PHF21A-213ENST00000530312 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.11■■■■■ 4.17
PHF21A-213ENST00000530312 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.09■■■■■ 4.17
PHF21A-213ENST00000530312 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.09■■■■■ 4.17
PHF21A-213ENST00000530312 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
PHF21A-213ENST00000530312 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
PHF21A-213ENST00000530312 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.161e-6■■□□□ 11.6
PHF21A-213ENST00000530312 TEX14Q8IWB6 1497 aa41■■■■■ 4.15
PHF21A-213ENST00000530312 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.99■■■■■ 4.15
PHF21A-213ENST00000530312 KIF14Q15058 1648 aa40.99■■■■■ 4.15
PHF21A-213ENST00000530312 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
PHF21A-213ENST00000530312 KDM6BO15054 1643 aa40.9■■■■■ 4.14
PHF21A-213ENST00000530312 PLCH2O75038 1416 aa40.8■■■■■ 4.12
PHF21A-213ENST00000530312 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.78■■■■■ 4.12
PHF21A-213ENST00000530312 TIAM1Q13009 1591 aa40.77■■■■■ 4.12
PHF21A-213ENST00000530312 NEO1Q92859 1461 aa40.77■■■■■ 4.12
PHF21A-213ENST00000530312 FANCAO15360 1455 aa40.74■■■■■ 4.11
PHF21A-213ENST00000530312 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.72■■■■■ 4.11
PHF21A-213ENST00000530312 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.7■■■■■ 4.11
PHF21A-213ENST00000530312 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.69■■■■■ 4.1
PHF21A-213ENST00000530312 AKNAQ7Z591 1439 aa40.67■■■■■ 4.1
PHF21A-213ENST00000530312 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PHF21A-213ENST00000530312 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.66■■■■■ 4.1
PHF21A-213ENST00000530312 MAP3K1Q13233 1512 aa40.66■■■■■ 4.1
PHF21A-213ENST00000530312 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.63■■■■■ 4.09
PHF21A-213ENST00000530312 RAPGEF3O95398 923 aa40.6■■■■■ 4.09
PHF21A-213ENST00000530312 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.6■■■■■ 4.09
PHF21A-213ENST00000530312 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
PHF21A-213ENST00000530312 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.59■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms